鳊鲂鱼类微卫星DNA指纹图谱的构建、遗传结构分析和团头鲂fgfr1基因的克隆与功能研究
发布时间：2021-03-05 12:09
团头鲂（Megalobrama amblycephala）是我国特有的养殖鱼类,在我国淡水养殖业及淡水捕捞业中占有重要的经济地位。团头鲂具有养殖成本低、生长快、成活率高、易捕捞,肉质好等优点,在我国广受青睐。发掘其生长发育相关主效基因,培育优良品种,是水产动物遗传育种基础研究的重要内容。然而,当前以团头鲂为首的鳊鲂鱼类天然资源已衰退严重,其基因库也受到了威胁。另外,鳊鲂鱼类由于地理分布上的叠加,形态和生活习性较为相近,在自然条件下有可能相互交配,从而造成种质混杂,原种鉴别日益迫切。成纤维生长因子受体（fibroblast growth factor receptor 1,Fgfr1）属于Fgfr家族,是一种酪氨酸激酶受体。它参与调控细胞的生长、分化、增殖和转移,对动物早期的胚胎发育和器官形成具有重要的作用。在哺乳动物中,Fgfr1通常由2-3个Ig-like胞外配体结合域、一个富含丝氨酸的特异酸框、一个转膜域和一个高度保守的酪氨酸激酶结构域,这四个结构域构成。Fgfr1通过与其相应的配体和HSPG的偶联,从而触发一系列的信号调控（如:PKC信号通路、PI3K/PKB信号通路和Ras/E...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
鳊鲂鱼类微卫星DNA指纹模式图
图 1-2 Mam03 (上图) 和 EST37 (下图) 引物在不同鳊鲂鱼类群体中的 PAGE 图谱M: PBR322 DNA/MspΙ 标准分子量，m: 50 bp DNA Ladder；1~5：东江三角鲂；6~10：长春鳊；11~15：厚颌鲂；16~20：广东鲂；21~25：钱塘江三角鲂；26~30：团头鲂。箭头显示为长春鳊的特异性标记。Fig. 1-2 PAGE analysis by primers Mam03 (upper) and EST37 (lower) among genus Megalobrama
上海海洋大学硕士学位论文31图2-1 团头鲂fgfr1a(上)和fgfr1b（下）基因cDNA序列及推测的氨基酸序列编码区用大写字母表示，非编码区用小写字母表示；氨基酸序列在上，碱基序列在下，终止密码子用*表示。Fig. 2-1 Nucleotide and deduced amino acid sequence of blunt snout bream fgfr1a (up) andfgfr1b (down) geneCapital letters indicate coding areas, small letters indicate the non-coding areas; Amino acidsequence and the nucleotide sequence are loacated up and down, respectively; termination codonuses * to express.2.3.2 团头鲂 fgfr1a 和 fgfr1b 基因氨基酸序列同源性及分子进化分析运用生物学软件，将团头鲂 fgfr1a 和 fgfr1b 的 ORF 氨基酸序列与斑马鱼（Danio rerio）和人类（Homo sapiens）的氨基酸序列进行相似性比较，结果如图2-2 所示。团头鲂 Fgfr1a 和 Fgfr1b 基因的成熟多肽有 82%的相似性，表现出高度的保守性。团头鲂 Fgfr1a 与人 FGFR1 和斑马鱼 Fgfr1a 的相似度都分别为 72%和
【参考文献】：
期刊论文
[1]Southern杂交技术在农作物遗传转化研究中的应用[J]. 代军. 安徽农业科学. 2015(01)
[2]Tgf2转座系统在转RFP基因斑马鱼上的应用[J]. 吴芳,叶星,邹曙明,张莉莉,孙成飞,田园园,白俊杰. 中国水产科学. 2014(04)
[3]Tgf2转座子介导鲤Fst1基因元件在鲤中的转基因效率研究[J]. 闫学春,钟莎莎,徐鹏,邹曙明,孙效文. 上海海洋大学学报. 2014(01)
[4]团头鲂EST-SSR在厚颌鲂中的跨种扩增及杂交F1的鉴定[J]. 易少奎,高泽霞,罗伟,段晓克,李艳和,王卫民. 水产学报. 2013(07)
[5]鲂属鱼类形态差异分析[J]. 宋文,王艺舟,祝东梅,任泷,王卫民. 淡水渔业. 2013(03)
[6]Tgf2转座子在团头鲂基因组中的插入效率[J]. 郭秀明,黄创新,沈睿杰,蒋霞云,陈杰,邹曙明. 遗传. 2013(08)
[7]鱼类活性DNA转座子的发掘与应用概况[J]. 邹曙明,杜雪地,蒋霞云. 上海海洋大学学报. 2012(05)
[8]大口黑鲈微卫星DNA指纹图谱的构建和遗传结构分析[J]. 樊佳佳,白俊杰,李胜杰,任坤,叶星. 水生生物学报. 2012(04)
[9]鲂属鱼类细胞色素b片段序列分析[J]. 谢楠,刘新轶,冯晓宇,郭水荣. 现代农业科技. 2012(01)
[10]鲤基因组中1个新Tc1类转座子的发现与鉴定[J]. 王全乐,冀培丰,徐鹏,孙效文. 中国水产科学. 2011(06)
硕士论文
[1]团头鲂结缔组织生长因子的克隆和PB转座子、PB-Tgf2复合转座元件的构建及转基因效率研究[D]. 王瑶.上海海洋大学 2014
[2]团头鲂缺氧应答相关基因的分子调控机制的研究[D]. 田玉梅.上海海洋大学 2012
[3]草鱼肌肉生长抑制素2的克隆、功能分析以及Tgf2转座子介导的鱼类插入诱变研究[D]. 孙成飞.上海海洋大学 2012
[4]金鱼Tgf2转座子的研究及其转基因应用[D]. 杜雪地.上海海洋大学 2011
本文编号：3065176
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
鳊鲂鱼类微卫星DNA指纹模式图
图 1-2 Mam03 (上图) 和 EST37 (下图) 引物在不同鳊鲂鱼类群体中的 PAGE 图谱M: PBR322 DNA/MspΙ 标准分子量，m: 50 bp DNA Ladder；1~5：东江三角鲂；6~10：长春鳊；11~15：厚颌鲂；16~20：广东鲂；21~25：钱塘江三角鲂；26~30：团头鲂。箭头显示为长春鳊的特异性标记。Fig. 1-2 PAGE analysis by primers Mam03 (upper) and EST37 (lower) among genus Megalobrama
上海海洋大学硕士学位论文31图2-1 团头鲂fgfr1a(上)和fgfr1b（下）基因cDNA序列及推测的氨基酸序列编码区用大写字母表示，非编码区用小写字母表示；氨基酸序列在上，碱基序列在下，终止密码子用*表示。Fig. 2-1 Nucleotide and deduced amino acid sequence of blunt snout bream fgfr1a (up) andfgfr1b (down) geneCapital letters indicate coding areas, small letters indicate the non-coding areas; Amino acidsequence and the nucleotide sequence are loacated up and down, respectively; termination codonuses * to express.2.3.2 团头鲂 fgfr1a 和 fgfr1b 基因氨基酸序列同源性及分子进化分析运用生物学软件，将团头鲂 fgfr1a 和 fgfr1b 的 ORF 氨基酸序列与斑马鱼（Danio rerio）和人类（Homo sapiens）的氨基酸序列进行相似性比较，结果如图2-2 所示。团头鲂 Fgfr1a 和 Fgfr1b 基因的成熟多肽有 82%的相似性，表现出高度的保守性。团头鲂 Fgfr1a 与人 FGFR1 和斑马鱼 Fgfr1a 的相似度都分别为 72%和
【参考文献】：
期刊论文
[1]Southern杂交技术在农作物遗传转化研究中的应用[J]. 代军. 安徽农业科学. 2015(01)
[2]Tgf2转座系统在转RFP基因斑马鱼上的应用[J]. 吴芳,叶星,邹曙明,张莉莉,孙成飞,田园园,白俊杰. 中国水产科学. 2014(04)
[3]Tgf2转座子介导鲤Fst1基因元件在鲤中的转基因效率研究[J]. 闫学春,钟莎莎,徐鹏,邹曙明,孙效文. 上海海洋大学学报. 2014(01)
[4]团头鲂EST-SSR在厚颌鲂中的跨种扩增及杂交F1的鉴定[J]. 易少奎,高泽霞,罗伟,段晓克,李艳和,王卫民. 水产学报. 2013(07)
[5]鲂属鱼类形态差异分析[J]. 宋文,王艺舟,祝东梅,任泷,王卫民. 淡水渔业. 2013(03)
[6]Tgf2转座子在团头鲂基因组中的插入效率[J]. 郭秀明,黄创新,沈睿杰,蒋霞云,陈杰,邹曙明. 遗传. 2013(08)
[7]鱼类活性DNA转座子的发掘与应用概况[J]. 邹曙明,杜雪地,蒋霞云. 上海海洋大学学报. 2012(05)
[8]大口黑鲈微卫星DNA指纹图谱的构建和遗传结构分析[J]. 樊佳佳,白俊杰,李胜杰,任坤,叶星. 水生生物学报. 2012(04)
[9]鲂属鱼类细胞色素b片段序列分析[J]. 谢楠,刘新轶,冯晓宇,郭水荣. 现代农业科技. 2012(01)
[10]鲤基因组中1个新Tc1类转座子的发现与鉴定[J]. 王全乐,冀培丰,徐鹏,孙效文. 中国水产科学. 2011(06)
硕士论文
[1]团头鲂结缔组织生长因子的克隆和PB转座子、PB-Tgf2复合转座元件的构建及转基因效率研究[D]. 王瑶.上海海洋大学 2014
[2]团头鲂缺氧应答相关基因的分子调控机制的研究[D]. 田玉梅.上海海洋大学 2012
[3]草鱼肌肉生长抑制素2的克隆、功能分析以及Tgf2转座子介导的鱼类插入诱变研究[D]. 孙成飞.上海海洋大学 2012
[4]金鱼Tgf2转座子的研究及其转基因应用[D]. 杜雪地.上海海洋大学 2011
本文编号：3065176
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