刺参消化道微生物组成及其产酶功能研究
发布时间:2021-04-28 12:23
刺参(Apostichopus japonicus)属于海参纲(Holothuroidea)、仿刺参属(Apostichopus),是我国北方主要的食用海参,具有较高的食用、保健和药用价值,被誉为“海味八珍”之首。由于需求量巨大,近几年,刺参养殖业在山东和辽宁大力发展,刺参已成为我国北方大部分地区主要的海水养殖种类,取得了巨大的经济价值和社会价值。益生菌已经在水产养殖中得到广泛的应用。本研究分析了刺参消化道内含物及其周围环境沉积物中的微生物组成,并对刺参消化道中菌群的产酶功能进行了研究,为研发刺参养殖专用益生菌提供了理论依据。利用16S rDNA454高通量测序技术对刺参前肠、后肠内含物及周围沉积物中细菌组成进行了研究。从10个肠道内含物样品和4个沉积物样品中共获得了188,623个优化序列和15,527个OTUs。前肠和后肠内含物以及周围沉积物中的细菌分别可以归为38.0±4.7、31.2±6.2和27.8±6.5个纲。刺参周围沉积物中细菌的丰度及Shannon多样性指数均高于刺参肠道。变形菌门(Proteobacteria)在刺参消化道内含物和周围沉积物中均占优势。前肠、后肠以及沉...
【文章来源】:上海海洋大学上海市
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单
摘要
ABSTRACT
目录
引言
第一章 文献综述
1 肠道微生物与宿主的关系
1.1 肠道中微生物的作用
2 肠道微生物研究方法
2.1 传统培养方法
2.2 现代分子生物学技术
3 刺参肠道微生物研究进展
3.1 刺参肠道微生物组成和多样性研究
3.2 影响刺参肠道微生物组成的因素
3.2.1 季节变化对刺参肠道微生物的影响
3.2.2 饲料添加剂与微生态制剂对刺参肠道微生物的影响
3.3 刺参肠道微生物功能研究现状
3.3.1 产生消化酶
3.3.2 抑菌作用
4、益生菌在水产养殖中的应用
5 本研究的目的和意义
第二章 利用 16S rDNA 高通量测序技术对刺参肠道内含物及周围沉积物微生物组成的研究
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 DNA 提取
1.3 序列片段扩增
1.4 454 高通量测序
1.5 数据及生物信息学分析
2 实验结果
2.1 丰富度和多样性分析
2.2 刺参肠道内含物和周围沉积物中微生物组成
2.3 刺参肠道内含物和周围沉积物中微生物组成的关系
3 讨论
4、结论
第三章 刺参肠道产酶微生物的分离鉴定及产酶能力分析
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 培养基
1.3 微生物培养
1.4 产酶微生物的筛选
1.4.1 产淀粉酶微生物的筛选
1.4.2 产纤维素酶微生物的筛选
1.4.3 产蛋白酶微生物的筛选
1.5 产酶微生物的分子生物学鉴定
1.5.1 产酶微生物的 DNA 提取和 16S rDNA 扩增
1.5.2 限制性片段长度多态性(RFLP)分析
1.6 产酶微生物产酶能力分析
2 实验结果
2.1 产酶微生物的分离与鉴定
2.2 16S rDNA 扩增结果
2.3 限制性片段长度多态性(RFLP)分析
2.4 16S rDNA 测序和系统发育分析
2.5 刺参肠道产酶能力分析
3 讨论
4 结论
第四章 刺参肠道微生物产胞外酶活性及抑菌活性研究
1 材料与方法
1.1 产酶菌株
1.2 病原菌
1.3 培养基
1.4 粗酶液的制备
1.5 产酶微生物产生的胞外酶活性测定
1.5.1 蛋白酶活性的测定
1.5.2 淀粉酶活性的测定
1.5.3 纤维素酶活性的测定
1.6 产酶微生物抑菌活性分析
2 结果
2.1 分离产酶菌株产酶活力测定
2.2 产酶菌株体外抑菌实验
3 讨论
4 小结
小结
参考文献
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]Bacterial Diversity of Gut Content in Sea Cucumber(Apostichopus japonicus) and Its Habitat Surface Sediment[J]. GAO Fei,TAN Jie,SUN Huiling,YAN Jingping. Journal of Ocean University of China. 2014(02)
[2]罗非鱼养殖系统中产淀粉酶菌株的筛选和鉴定[J]. 丁彦文,袁翠霖,李卓佳,杨莺莺,林小涛. 广东农业科学. 2013(18)
[3]用于PCR扩增的细菌DNA提取方法比较[J]. 冯广达,陈美标,羊宋贞,朱红惠. 华南农业大学学报. 2013(03)
[4]复合益生菌对草鱼养殖水体水质和菌群结构的影响[J]. 郑佳佳,彭丽莎,张小平,孙健栋,傅罗琴,王一冰,胡彩虹,李卫芬. 水产学报. 2013(03)
[5]刺参肠道潜在产酶益生菌的筛选和鉴定[J]. 杨志平,孙飞雪,刘志明,张磊,曹为,马悦欣. 大连海洋大学学报. 2013(01)
[6]仿刺参相关微生物对致病灿烂弧菌的拮抗及机理研究[J]. 李虹宇,张公亮,侯红漫,葛静慧,孙名一. 食品工业. 2012(09)
[7]仿刺参肠道可培养微生物多样性研究[J]. 张文姬,侯红漫,张公亮,李琴艳,杜晨萌. 食品工业科技. 2011(09)
[8]柞蚕肠道菌群分析及产酶菌的筛选与鉴定[J]. 邹昌瑞,魏国清,刘朝良,朱保建,王在贵,杨文静. 中国农业科学. 2011(12)
[9]来自大黄鱼(Pseudosciaena crocea)肠道的弧菌拮抗菌的筛选与鉴定[J]. 王娟,封永辉,蔡立胜,王建,曲宪成,张庆华. 海洋与湖沼. 2010(05)
[10]益生菌的应用对鳗鲡池塘水质变化的影响[J]. 石和荣,林敏,马江耀,杜君裕,蔡秩强. 水产养殖. 2010(09)
硕士论文
[1]几种微生态制剂对刺参(Apostichopus japonicus)养殖水体及刺参肠道菌群结构的影响[D]. 阳钢.中国海洋大学 2012
[2]酶解海藻产物对刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌群和免疫相关因子的影响[D]. 杜以帅.中国海洋大学 2010
本文编号:3165470
【文章来源】:上海海洋大学上海市
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单
摘要
ABSTRACT
目录
引言
第一章 文献综述
1 肠道微生物与宿主的关系
1.1 肠道中微生物的作用
2 肠道微生物研究方法
2.1 传统培养方法
2.2 现代分子生物学技术
3 刺参肠道微生物研究进展
3.1 刺参肠道微生物组成和多样性研究
3.2 影响刺参肠道微生物组成的因素
3.2.1 季节变化对刺参肠道微生物的影响
3.2.2 饲料添加剂与微生态制剂对刺参肠道微生物的影响
3.3 刺参肠道微生物功能研究现状
3.3.1 产生消化酶
3.3.2 抑菌作用
4、益生菌在水产养殖中的应用
5 本研究的目的和意义
第二章 利用 16S rDNA 高通量测序技术对刺参肠道内含物及周围沉积物微生物组成的研究
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 DNA 提取
1.3 序列片段扩增
1.4 454 高通量测序
1.5 数据及生物信息学分析
2 实验结果
2.1 丰富度和多样性分析
2.2 刺参肠道内含物和周围沉积物中微生物组成
2.3 刺参肠道内含物和周围沉积物中微生物组成的关系
3 讨论
4、结论
第三章 刺参肠道产酶微生物的分离鉴定及产酶能力分析
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 培养基
1.3 微生物培养
1.4 产酶微生物的筛选
1.4.1 产淀粉酶微生物的筛选
1.4.2 产纤维素酶微生物的筛选
1.4.3 产蛋白酶微生物的筛选
1.5 产酶微生物的分子生物学鉴定
1.5.1 产酶微生物的 DNA 提取和 16S rDNA 扩增
1.5.2 限制性片段长度多态性(RFLP)分析
1.6 产酶微生物产酶能力分析
2 实验结果
2.1 产酶微生物的分离与鉴定
2.2 16S rDNA 扩增结果
2.3 限制性片段长度多态性(RFLP)分析
2.4 16S rDNA 测序和系统发育分析
2.5 刺参肠道产酶能力分析
3 讨论
4 结论
第四章 刺参肠道微生物产胞外酶活性及抑菌活性研究
1 材料与方法
1.1 产酶菌株
1.2 病原菌
1.3 培养基
1.4 粗酶液的制备
1.5 产酶微生物产生的胞外酶活性测定
1.5.1 蛋白酶活性的测定
1.5.2 淀粉酶活性的测定
1.5.3 纤维素酶活性的测定
1.6 产酶微生物抑菌活性分析
2 结果
2.1 分离产酶菌株产酶活力测定
2.2 产酶菌株体外抑菌实验
3 讨论
4 小结
小结
参考文献
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]Bacterial Diversity of Gut Content in Sea Cucumber(Apostichopus japonicus) and Its Habitat Surface Sediment[J]. GAO Fei,TAN Jie,SUN Huiling,YAN Jingping. Journal of Ocean University of China. 2014(02)
[2]罗非鱼养殖系统中产淀粉酶菌株的筛选和鉴定[J]. 丁彦文,袁翠霖,李卓佳,杨莺莺,林小涛. 广东农业科学. 2013(18)
[3]用于PCR扩增的细菌DNA提取方法比较[J]. 冯广达,陈美标,羊宋贞,朱红惠. 华南农业大学学报. 2013(03)
[4]复合益生菌对草鱼养殖水体水质和菌群结构的影响[J]. 郑佳佳,彭丽莎,张小平,孙健栋,傅罗琴,王一冰,胡彩虹,李卫芬. 水产学报. 2013(03)
[5]刺参肠道潜在产酶益生菌的筛选和鉴定[J]. 杨志平,孙飞雪,刘志明,张磊,曹为,马悦欣. 大连海洋大学学报. 2013(01)
[6]仿刺参相关微生物对致病灿烂弧菌的拮抗及机理研究[J]. 李虹宇,张公亮,侯红漫,葛静慧,孙名一. 食品工业. 2012(09)
[7]仿刺参肠道可培养微生物多样性研究[J]. 张文姬,侯红漫,张公亮,李琴艳,杜晨萌. 食品工业科技. 2011(09)
[8]柞蚕肠道菌群分析及产酶菌的筛选与鉴定[J]. 邹昌瑞,魏国清,刘朝良,朱保建,王在贵,杨文静. 中国农业科学. 2011(12)
[9]来自大黄鱼(Pseudosciaena crocea)肠道的弧菌拮抗菌的筛选与鉴定[J]. 王娟,封永辉,蔡立胜,王建,曲宪成,张庆华. 海洋与湖沼. 2010(05)
[10]益生菌的应用对鳗鲡池塘水质变化的影响[J]. 石和荣,林敏,马江耀,杜君裕,蔡秩强. 水产养殖. 2010(09)
硕士论文
[1]几种微生态制剂对刺参(Apostichopus japonicus)养殖水体及刺参肠道菌群结构的影响[D]. 阳钢.中国海洋大学 2012
[2]酶解海藻产物对刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌群和免疫相关因子的影响[D]. 杜以帅.中国海洋大学 2010
本文编号:3165470
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