克氏原螯虾两种SOD基因克隆与功能研究
发布时间:2021-06-09 04:22
克氏原螯虾(Procambarus clarkii)已发展成为最具特色、最具潜力的水产养殖新品种之一。但近些年暴发的螺原体疫病给克氏原螯虾这一正处于高速发展期的养殖品种带来了重大损失。中华绒螯蟹螺原体(Spiroplasma eriocheiris)作为一种新型的水产病原,除了引起中华绒螯蟹“颤抖病”外,还引起克氏原螯虾的严重病害,已成为严重危害我国克氏原螯虾等淡水虾蟹养殖的重要病原,此外,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是水产常见病菌,开展此类病原微生物的研究不仅具有理论价值,而且可以为生产实际中的病害防治提供理论依据和实用技术,对我国水产养殖业的可持续发展具有重要意义。SOD(Superoxide Dismutase)的中文名称超氧化物歧化酶,是生物体内重要的抗氧化物酶,广泛分布于各种生物体内。本文从克氏原螯虾血细胞中分别克隆得到的胞外型铜锌超氧化物歧化酶和线粒体型锰超氧化物歧化酶两种基因,并研究克氏原螯虾在不同病原菌(中华绒螯蟹螺原体和嗜水气单胞菌)刺激下这两种SOD的mRNA转录水平上和蛋白水平上的变化,从而揭示克氏原螯虾体内的SOD参与抗病菌的作用。1...
【文章来源】:南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
ecCuZnSOD的氨基酸序列分析及同源比对
第三章克氏原整奸mtMnSOD的克隆及序列分析 3.2intMnSOD的氨基酸序列的同源对比和系统发育分析将获得的基因的氨基酸序列与己知的其他物种的相对应的蛋白序列进行比对,发现克氏原螯奸的mtMnSOD与其余的已知物种的相似度很高。mtMnSOD具有典型的猛超氧化物歧化酶结构域(DVWEHAYY)和四个保守的氨基酸构成的猛离子结合位点(His 48, His 96,Asp 180 和 His 184)(图 3-2)。克氏原螯奸mtMnSOD的氨基酸序列与红鳌螯奸、岸蟹、罗氏沼奸、锯缘青蟹和中国明对好的mtMnSOD的蛋白序列相似度依次为87%,85%, 84%,83%和82%。系统发育分析表明MnSODs也可以分为两个不同的群:mtMnSOD和cytMnSOD。克氏原螯奸mtMnSOD与其他的甲壳类动物的mtMnSOD是有点接近的,但与甲壳动物的cytMnSODs的亲缘性比较远。(图3-3)
突光定量PCR分别检测两种SOD基因在克氏原螯奸心、肝胰腺、神经、肠、肌肉、鳃和胃7个组织中的基因转录水平的变化,P-actin作为内参。如图4.1示,两种基因在七个组织中均有广泛的表达,ecCuZnSOD在不同组织中表达趋势与mtMnSOD是类似的。ecCuZnSOD和mtMnSOD的mRNA在觸、血细胞和肝胰腺中高表达,而在肌肉、心、胃、肠和神经组织中表达水平相对较低。33
本文编号:3219918
【文章来源】:南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
ecCuZnSOD的氨基酸序列分析及同源比对
第三章克氏原整奸mtMnSOD的克隆及序列分析 3.2intMnSOD的氨基酸序列的同源对比和系统发育分析将获得的基因的氨基酸序列与己知的其他物种的相对应的蛋白序列进行比对,发现克氏原螯奸的mtMnSOD与其余的已知物种的相似度很高。mtMnSOD具有典型的猛超氧化物歧化酶结构域(DVWEHAYY)和四个保守的氨基酸构成的猛离子结合位点(His 48, His 96,Asp 180 和 His 184)(图 3-2)。克氏原螯奸mtMnSOD的氨基酸序列与红鳌螯奸、岸蟹、罗氏沼奸、锯缘青蟹和中国明对好的mtMnSOD的蛋白序列相似度依次为87%,85%, 84%,83%和82%。系统发育分析表明MnSODs也可以分为两个不同的群:mtMnSOD和cytMnSOD。克氏原螯奸mtMnSOD与其他的甲壳类动物的mtMnSOD是有点接近的,但与甲壳动物的cytMnSODs的亲缘性比较远。(图3-3)
突光定量PCR分别检测两种SOD基因在克氏原螯奸心、肝胰腺、神经、肠、肌肉、鳃和胃7个组织中的基因转录水平的变化,P-actin作为内参。如图4.1示,两种基因在七个组织中均有广泛的表达,ecCuZnSOD在不同组织中表达趋势与mtMnSOD是类似的。ecCuZnSOD和mtMnSOD的mRNA在觸、血细胞和肝胰腺中高表达,而在肌肉、心、胃、肠和神经组织中表达水平相对较低。33
本文编号:3219918
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