大黄鱼养殖环境中浮游细菌和浮游病毒的遗传多样性研究
发布时间：2021-06-20 19:28
细菌和病毒作为海洋生态系统中重要的两类微生物,具有极高的丰度和极丰富的多样性,在全球物质循环和能量流转过程中发挥着重要的作用。在海洋环境中,浮游细菌和病毒的群落结构复杂,随着环境变化而发生改变,同时又反过来影响着环境。海水养殖环境是一类特殊的海洋环境,养殖活动给养殖环境输入了大量的营养物质,影响着养殖环境中微生物的群落结构。基于此,本论文调查分析了宁德近海大黄鱼养殖环境和非养殖环境浮游细菌和浮游病毒的丰度和遗传多样性及其在时间尺度上的变化趋势、大黄鱼不同部位的可培养和不可培养微生物的群落结构,试图揭示海水养殖环境下的微生物群落结构和多样性及养殖行为对微生物群落结构的影响。主要研究结果如下:1.利用流式细胞技术对宁德近海大黄鱼养殖环境和非养殖环境的浮游细菌和浮游病毒丰度进行了为期一年的检测。结果表明,养殖环境浮游细菌和浮游病毒均显示出极高的丰度,浮游细菌丰度范围为:3.21×105-5.16×106cellsmL-1,浮游病毒丰度范围为:9.07×106-4.22×107 particles mL-1。两者在时间尺度上均呈现明显的变化规律,在7月高温季节丰度最高,而1月低温季节丰度相对较...
【文章来源】：厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１主要海洋细菌类群中己有纯培养（黑色）和仍未能获得培养（红色）的??部分汇总（基于１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因序列的分析结果；综合Ｐａｃｅ，１９９７和Ｋｅｌｌｅｒ?＆??
层逐渐递减的明显时空分布特征，富营养地区浮游病毒显著高于寡营养地区，夏??秋季浮游病毒一般来说也会高于冬季。??１．２．１．２海洋病毒的分类??海洋浮游病毒具有极高的形态多样性和遗传多样性，目前国际上对海洋病毒??的分类主要依据其核酸类型、宿主类型和形态结构等特征，尚未建立统一的标准。??海洋病毒核酸类型为ＲＮＡ和ＤＮＡ，目前海洋浮游病毒研究主要聚焦在丰度最高??的双链ＤＮＡ病毒，但单链ＤＮＡ病毒和ＲＮＡ病毒丰度也很高（Ｌａｂｏｎｔｄ?ａｎｄ?Ｓｕｔｔｌｅ，??２０１３；?Ｓｔｅｗａｒｄ?ｅｌ?ａｌ．，?２０１３；?Ｔｏｍａｒｕ?ｅｔ?ａ／．，?２００９；?Ｓｈｉｒａｉ?ｅｔ?ａｌ．，?２００８；?Ｍｉｒａｎｄａ?ｅｌ?ａｌ．，??２０１６）。根据海洋病毒的宿主类型将海洋病毒主要分为噬菌体（宿主为细菌）和??噬藻体（宿主为真核藻类），除此之外还有浮游植物病毒、浮游动物病毒、真菌??病毒和人类病毒等（Ｗｏｍｍａｃｋ，２０００）。??
?１０??Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｆｉｓｈｅｓ??图１．３海水鱼和淡水鱼消化道中厌氧细菌组成（Ｒｏｍｅｒｏ占ｆｌ／．，?２０１４）??Ｆｉｇｕｒｅ?１．３?Ａｎａｅｒｏｂｉｃ?ｂａｃｔｅｒｉａ?ｒｅｐｏｒｔｅｄ?ｉｎ?ｔｈｅ?ＧＩ?ｔｒａｃｔ?ｏｆ?ｍａｒｉｎｅ?ａｎｄ?ｆｒｅｓｈｗａｔｅｒ??ｆｉｓｈ?（Ｒｏｍｅｒｏ?ｅｌ?ａｌ＾?２０１４）．??与恒温动物相比，鱼类肠道微生物多样性和丰度均较低，人类肠道微生物群??落多达４００种（Ｂｅｒｇ，丨９９６；?Ｔａｎｎｏｃｋ，１９９８），成人肠道中大约有１０１４个微生物细??胞，成鱼肠道中细菌数量约为１０５ＣＦＵ／ｇ－１０７ＣＦＵ／ｇ，微生物群落结构也更简单。??１．３．２影响鱼类肠道菌群结构的因素??鱼类肠道微生物群落是一个动态变化的系统，其群落结构和微生物数量受一??系列内源性和外源性因素影响，包括鱼的种类、发育阶段、生理状态、食物组成、??投喂策略、环境条件以及季节等。??各品种鱼的肠道菌群组成各异。研宄表明，海鳟Ｃａ／ｗｏ／ｒｗ／／＜３ｒｒｗ／／ａ）肠道??优势菌群分别为肠杆菌科、气单胞菌属、假单胞菌属，其占比分别为５２％，?２２％??和］４％
【参考文献】：
期刊论文
[1]厦门海域春季浮游病毒的丰度及形态多样性分析[J]. 蔡兰兰,殷思博,杨芸兰,张锐. 厦门大学学报(自然科学版). 2015(06)
[2]象山港网箱养殖区与非养殖区的细菌群落分布[J]. 胡常巨,熊金波,陈和平,王凯,叶然,崔永平,朱建林,张德民. 生态学报. 2015(24)
[3]Survey of cyanomyovirus abundance in Shantou coastal waters by g20[J]. 李传标,丁俊,周立镇,张昭,李升康,刘文华,温小波. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2015(03)
[4]人工养殖对虾肠道内可培养细菌数量及组成分析[J]. 张盛静,赵小金,宋晓玲,张晓静,万晓媛,黄倢. 上海海洋大学学报. 2015(02)
[5]南太平洋环流区底层水可培养细菌多样性研究[J]. 李昭,乔延路,范晓阳,史晓翀,张晓华. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2014(06)
[6]深海微生物多样性[J]. 王风平,周悦恒,张新旭,肖湘. 生物多样性. 2013(04)
[7]象山港网箱养殖对近海沉积物细菌群落的影响[J]. 裘琼芬,张德民,叶仙森,郑珍珍. 生态学报. 2013(02)
[8]大黄鱼（Pseudosciaena crocea）源美人鱼发光杆菌（Photobacterium damselae）的分离鉴定及致病性研究[J]. 张飞,苏永全,王军,覃映雪,马英,鄢庆枇. 海洋与湖沼. 2012(06)
[9]冬季和春季长江口及其近海水域浮游病毒丰度的分析[J]. 白晓歌,汪岷,马晶晶,孙军,梁彦韬,乔倩. 海洋与湖沼. 2007(04)
[10]西北太平洋沉积物中细菌多样性的研究[J]. 穆春华,包振民,陈刚,郝鲁江,祁自忠,劳军,李广雪,胡景杰. 海洋学报(中文版). 2006(04)
博士论文
[1]胶州湾和东太平洋海隆（～13°N）沉积物微生物多样性研究[D]. 李友训.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2008
硕士论文
[1]四种功能性饲料添加剂对花鳗鲡生长性能、脂肪代谢、非特异性免疫和肝肠健康的影响[D]. 解文丽.厦门大学 2017
[2]长江口及邻近海域海水细菌多样性及时空分布规律研究[D]. 刘晓辉.浙江海洋大学 2017
[3]野生与养殖大鲵肠道微生物多样性分析及产酶活性研究[D]. 刘栋.陕西理工学院 2016
[4]灿烂、哈维弧菌噬菌体的分离鉴定及其生物学特性的研究[D]. 李男.大连海洋大学 2016
[5]日本鳗鲡小肠共生微生物多样性及其功能分析[D]. 简思美.福建师范大学 2016
[6]北极斯瓦尔巴群岛冰川流域氮循环细菌的多样性及分类学研究[D]. 孙景.青岛科技大学 2015
[7]东太平洋深海热液区沉积物细菌和古菌多样性分析及一株中温细菌的分类鉴定[D]. 刘青.国家海洋局第三海洋研究所 2014
[8]副溶血弧菌噬菌体的分离鉴定、裂解性能及其在副溶血弧菌快速检测中的初步应用[D]. 彭勇.中国海洋大学 2013
[9]山东省东平湖四种常见淡水鱼肠道菌群分析[D]. 周玉法.山东农业大学 2011
[10]黄颡鱼肠道菌群分析和益生菌的研究[D]. 周金敏.华中农业大学 2010
本文编号：3239790
【文章来源】：厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１主要海洋细菌类群中己有纯培养（黑色）和仍未能获得培养（红色）的??部分汇总（基于１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因序列的分析结果；综合Ｐａｃｅ，１９９７和Ｋｅｌｌｅｒ?＆??
层逐渐递减的明显时空分布特征，富营养地区浮游病毒显著高于寡营养地区，夏??秋季浮游病毒一般来说也会高于冬季。??１．２．１．２海洋病毒的分类??海洋浮游病毒具有极高的形态多样性和遗传多样性，目前国际上对海洋病毒??的分类主要依据其核酸类型、宿主类型和形态结构等特征，尚未建立统一的标准。??海洋病毒核酸类型为ＲＮＡ和ＤＮＡ，目前海洋浮游病毒研究主要聚焦在丰度最高??的双链ＤＮＡ病毒，但单链ＤＮＡ病毒和ＲＮＡ病毒丰度也很高（Ｌａｂｏｎｔｄ?ａｎｄ?Ｓｕｔｔｌｅ，??２０１３；?Ｓｔｅｗａｒｄ?ｅｌ?ａｌ．，?２０１３；?Ｔｏｍａｒｕ?ｅｔ?ａ／．，?２００９；?Ｓｈｉｒａｉ?ｅｔ?ａｌ．，?２００８；?Ｍｉｒａｎｄａ?ｅｌ?ａｌ．，??２０１６）。根据海洋病毒的宿主类型将海洋病毒主要分为噬菌体（宿主为细菌）和??噬藻体（宿主为真核藻类），除此之外还有浮游植物病毒、浮游动物病毒、真菌??病毒和人类病毒等（Ｗｏｍｍａｃｋ，２０００）。??
?１０??Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｆｉｓｈｅｓ??图１．３海水鱼和淡水鱼消化道中厌氧细菌组成（Ｒｏｍｅｒｏ占ｆｌ／．，?２０１４）??Ｆｉｇｕｒｅ?１．３?Ａｎａｅｒｏｂｉｃ?ｂａｃｔｅｒｉａ?ｒｅｐｏｒｔｅｄ?ｉｎ?ｔｈｅ?ＧＩ?ｔｒａｃｔ?ｏｆ?ｍａｒｉｎｅ?ａｎｄ?ｆｒｅｓｈｗａｔｅｒ??ｆｉｓｈ?（Ｒｏｍｅｒｏ?ｅｌ?ａｌ＾?２０１４）．??与恒温动物相比，鱼类肠道微生物多样性和丰度均较低，人类肠道微生物群??落多达４００种（Ｂｅｒｇ，丨９９６；?Ｔａｎｎｏｃｋ，１９９８），成人肠道中大约有１０１４个微生物细??胞，成鱼肠道中细菌数量约为１０５ＣＦＵ／ｇ－１０７ＣＦＵ／ｇ，微生物群落结构也更简单。??１．３．２影响鱼类肠道菌群结构的因素??鱼类肠道微生物群落是一个动态变化的系统，其群落结构和微生物数量受一??系列内源性和外源性因素影响，包括鱼的种类、发育阶段、生理状态、食物组成、??投喂策略、环境条件以及季节等。??各品种鱼的肠道菌群组成各异。研宄表明，海鳟Ｃａ／ｗｏ／ｒｗ／／＜３ｒｒｗ／／ａ）肠道??优势菌群分别为肠杆菌科、气单胞菌属、假单胞菌属，其占比分别为５２％，?２２％??和］４％
【参考文献】：
期刊论文
[1]厦门海域春季浮游病毒的丰度及形态多样性分析[J]. 蔡兰兰,殷思博,杨芸兰,张锐. 厦门大学学报(自然科学版). 2015(06)
[2]象山港网箱养殖区与非养殖区的细菌群落分布[J]. 胡常巨,熊金波,陈和平,王凯,叶然,崔永平,朱建林,张德民. 生态学报. 2015(24)
[3]Survey of cyanomyovirus abundance in Shantou coastal waters by g20[J]. 李传标,丁俊,周立镇,张昭,李升康,刘文华,温小波. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2015(03)
[4]人工养殖对虾肠道内可培养细菌数量及组成分析[J]. 张盛静,赵小金,宋晓玲,张晓静,万晓媛,黄倢. 上海海洋大学学报. 2015(02)
[5]南太平洋环流区底层水可培养细菌多样性研究[J]. 李昭,乔延路,范晓阳,史晓翀,张晓华. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2014(06)
[6]深海微生物多样性[J]. 王风平,周悦恒,张新旭,肖湘. 生物多样性. 2013(04)
[7]象山港网箱养殖对近海沉积物细菌群落的影响[J]. 裘琼芬,张德民,叶仙森,郑珍珍. 生态学报. 2013(02)
[8]大黄鱼（Pseudosciaena crocea）源美人鱼发光杆菌（Photobacterium damselae）的分离鉴定及致病性研究[J]. 张飞,苏永全,王军,覃映雪,马英,鄢庆枇. 海洋与湖沼. 2012(06)
[9]冬季和春季长江口及其近海水域浮游病毒丰度的分析[J]. 白晓歌,汪岷,马晶晶,孙军,梁彦韬,乔倩. 海洋与湖沼. 2007(04)
[10]西北太平洋沉积物中细菌多样性的研究[J]. 穆春华,包振民,陈刚,郝鲁江,祁自忠,劳军,李广雪,胡景杰. 海洋学报(中文版). 2006(04)
博士论文
[1]胶州湾和东太平洋海隆（～13°N）沉积物微生物多样性研究[D]. 李友训.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2008
硕士论文
[1]四种功能性饲料添加剂对花鳗鲡生长性能、脂肪代谢、非特异性免疫和肝肠健康的影响[D]. 解文丽.厦门大学 2017
[2]长江口及邻近海域海水细菌多样性及时空分布规律研究[D]. 刘晓辉.浙江海洋大学 2017
[3]野生与养殖大鲵肠道微生物多样性分析及产酶活性研究[D]. 刘栋.陕西理工学院 2016
[4]灿烂、哈维弧菌噬菌体的分离鉴定及其生物学特性的研究[D]. 李男.大连海洋大学 2016
[5]日本鳗鲡小肠共生微生物多样性及其功能分析[D]. 简思美.福建师范大学 2016
[6]北极斯瓦尔巴群岛冰川流域氮循环细菌的多样性及分类学研究[D]. 孙景.青岛科技大学 2015
[7]东太平洋深海热液区沉积物细菌和古菌多样性分析及一株中温细菌的分类鉴定[D]. 刘青.国家海洋局第三海洋研究所 2014
[8]副溶血弧菌噬菌体的分离鉴定、裂解性能及其在副溶血弧菌快速检测中的初步应用[D]. 彭勇.中国海洋大学 2013
[9]山东省东平湖四种常见淡水鱼肠道菌群分析[D]. 周玉法.山东农业大学 2011
[10]黄颡鱼肠道菌群分析和益生菌的研究[D]. 周金敏.华中农业大学 2010
本文编号：3239790
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3239790.html
