基于DArT技术的大黄鱼耐低温性状相关分子标记的筛选
发布时间：2021-06-22 04:22
大黄鱼（Larimichthyscrocea）隶属于硬骨鱼纲，鲈形目（Perciformes），石首鱼科（Sciaenidae），黄鱼属。又名黄鱼、大鲜、金龙、红口等，宁波等地市1997年引进福建大黄鱼养殖后，发现冬季越冬水温过不了8oC，年年有大黄鱼被冻死，为此选育了大黄鱼“东海1号”耐低温和生长较快的新品种。通过以“东海1号”为实验材料，采用多样性芯片技术（DiversityArraysTechnology，DArT）筛选了大黄鱼耐低温性状相关分子标记，为“东海1号”选育提供了理论依据。结果如下：对“东海1号”进行低温筛选试验，得到了在水温9oC以上有死亡征兆的七条对低温敏感的“东海1号”大黄鱼低温敏感群体和在水温6oC以下仍健康存活的七条耐低温的“东海1号”大黄鱼耐低温群体。以低温筛选实验中得到的低温敏感群体和耐低温群体作为实验材料。将低温敏感群体和耐低温群体的基因组DNA等量混合，选择七种降低基因组复杂度方法（PstI/Alu I、Pst I/Ban II、Pst I/Bsp1286I、Pst I/BstN I、Pst I/Hae III、Pst I/Rsa I、Pst I/T...
【文章来源】：宁波大学浙江省
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
大黄鱼基因组DNA电泳图
图 2.1 大黄鱼基因组 DNA 电泳图Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DN4 DNA；2：X477 DNA；3：X456 DNA；4：X63X625 DNA DNA; 2: X477 DNA; 3: X456 DNA; 4: X633 DNADNA 的酶切X434、X477、X456”和“X633、X700、 Pst I/Rsa I、Pst I/Ban II、Pst I/Alu I、Pst I/BI 七组限制性内切酶组合进行酶切，结果 黄 鱼 基 因 组 DNA 被 彻 底 切 开 ， 酶说明酶切效果较好，符合实验要求。
图 2.3 大黄鱼基因组酶切 PCRg.2.3 Agarose electrophoresis of genomic restriction PM：1kb Marker；1：Pst I/Alu I 加接头后 PCR；Ban II 加接头后 PCR；3：Pst I/Bsp1286 I 加接头/BstN I 加接头后 PCR；5：Pst I/Hae III 加接头st I/Rsa I 加接头后 PCR；7：Pst I/Taq I 加接头后：1kb Marker；1：Pst I/Alu I adding adapter PCI adding adapter PCR；3：Pst I/Bsp1286 I adding I adding adapter PCR；5：Pst I/Hae III adding sa I adding adapter PCR；7：Pst I/Taq I adding aOMA SPINTM+TE-400 Columns 柱后，并库，库容量≥105，随机挑取部分克隆对然有个别片段大小＜500bp，但绝大部、Pst I/Alu I、Pst I/Bsp1286 I、Pst I/Hae II合插入片段大小平均值分别为 742.87
【参考文献】：
期刊论文
[1]4种裸胸鳝的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析[J]. 杜民,尹绍武,刘艳红,牛宝珍,齐兴柱,张本,廖经球,霍蕊. 海洋通报. 2013(03)
[2]鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析[J]. 郭薇,郑先虎,匡友谊,崔晓亮,曹顶臣,孙效文. 淡水渔业. 2013(02)
[3]黄姑鱼♀与大黄鱼♂杂交试验与AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,刘颖,王志勇. 集美大学学报(自然科学版). 2012(04)
[4]草鱼EST-SSRs标记的筛选及其与生长性状相关分析[J]. 王解香,白俊杰,于凌云. 淡水渔业. 2012(01)
[5]鲤改良品系与体质量、体长性状相关的TRAP标记筛选[J]. 董在杰,曲疆奇,袁新华,苏胜彦,谢庄. 中国水产科学. 2011(04)
[6]鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位[J]. 常玉梅,高国强,徐丽华,刘金亮,刘春雷,梁利群. 动物学研究. 2010(06)
[7]半滑舌鳎雌鱼基因组Fosmid文库构建及分析[J]. 孙晓华,张全启,王旭波,翟腾,齐洁,王志刚,王兴莲,王亚楠. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2010(08)
[8]大黄鱼♀与黄姑鱼♂杂交F1家系初孵仔鱼的AFLP分析[J]. 刘颖,蔡明夷,刘贤德,王志勇. 水产学报. 2010(06)
[9]低温选择大黄鱼（Pseudosciaena crocea）的肝脏蛋白质组双向电泳分析[J]. 李明云,吴玉珍,冀德伟,吴海庆,陈炯,史雨红,罗海忠,柳敏海,傅荣兵. 海洋与湖沼. 2010(03)
[10]低温胁迫下大黄鱼肝脏蛋白质组双向电泳分析[J]. 李明云,冀德伟,吴海庆,陈炯,史雨红,徐镇,徐万土. 农业生物技术学报. 2010(02)
博士论文
[1]基于生物芯片标记技术的五种濒危冷杉保护遗传学研究[D]. 饶龙兵.中国林业科学研究院 2009
[2]中国红鲤遗传多样性研究[D]. 王成辉.上海水产大学 2002
硕士论文
[1]香鱼养殖群体遗传多样性的AFLP分析及性别相关标记的筛选[D]. 范慧慧.宁波大学 2012
[2]白菜类作物DArT标记体系的建立[D]. 冯艳丽.中国农业科学院 2009
本文编号：3242109
【文章来源】：宁波大学浙江省
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
大黄鱼基因组DNA电泳图
图 2.1 大黄鱼基因组 DNA 电泳图Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DN4 DNA；2：X477 DNA；3：X456 DNA；4：X63X625 DNA DNA; 2: X477 DNA; 3: X456 DNA; 4: X633 DNADNA 的酶切X434、X477、X456”和“X633、X700、 Pst I/Rsa I、Pst I/Ban II、Pst I/Alu I、Pst I/BI 七组限制性内切酶组合进行酶切，结果 黄 鱼 基 因 组 DNA 被 彻 底 切 开 ， 酶说明酶切效果较好，符合实验要求。
图 2.3 大黄鱼基因组酶切 PCRg.2.3 Agarose electrophoresis of genomic restriction PM：1kb Marker；1：Pst I/Alu I 加接头后 PCR；Ban II 加接头后 PCR；3：Pst I/Bsp1286 I 加接头/BstN I 加接头后 PCR；5：Pst I/Hae III 加接头st I/Rsa I 加接头后 PCR；7：Pst I/Taq I 加接头后：1kb Marker；1：Pst I/Alu I adding adapter PCI adding adapter PCR；3：Pst I/Bsp1286 I adding I adding adapter PCR；5：Pst I/Hae III adding sa I adding adapter PCR；7：Pst I/Taq I adding aOMA SPINTM+TE-400 Columns 柱后，并库，库容量≥105，随机挑取部分克隆对然有个别片段大小＜500bp，但绝大部、Pst I/Alu I、Pst I/Bsp1286 I、Pst I/Hae II合插入片段大小平均值分别为 742.87
【参考文献】：
期刊论文
[1]4种裸胸鳝的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析[J]. 杜民,尹绍武,刘艳红,牛宝珍,齐兴柱,张本,廖经球,霍蕊. 海洋通报. 2013(03)
[2]鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析[J]. 郭薇,郑先虎,匡友谊,崔晓亮,曹顶臣,孙效文. 淡水渔业. 2013(02)
[3]黄姑鱼♀与大黄鱼♂杂交试验与AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,刘颖,王志勇. 集美大学学报(自然科学版). 2012(04)
[4]草鱼EST-SSRs标记的筛选及其与生长性状相关分析[J]. 王解香,白俊杰,于凌云. 淡水渔业. 2012(01)
[5]鲤改良品系与体质量、体长性状相关的TRAP标记筛选[J]. 董在杰,曲疆奇,袁新华,苏胜彦,谢庄. 中国水产科学. 2011(04)
[6]鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位[J]. 常玉梅,高国强,徐丽华,刘金亮,刘春雷,梁利群. 动物学研究. 2010(06)
[7]半滑舌鳎雌鱼基因组Fosmid文库构建及分析[J]. 孙晓华,张全启,王旭波,翟腾,齐洁,王志刚,王兴莲,王亚楠. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2010(08)
[8]大黄鱼♀与黄姑鱼♂杂交F1家系初孵仔鱼的AFLP分析[J]. 刘颖,蔡明夷,刘贤德,王志勇. 水产学报. 2010(06)
[9]低温选择大黄鱼（Pseudosciaena crocea）的肝脏蛋白质组双向电泳分析[J]. 李明云,吴玉珍,冀德伟,吴海庆,陈炯,史雨红,罗海忠,柳敏海,傅荣兵. 海洋与湖沼. 2010(03)
[10]低温胁迫下大黄鱼肝脏蛋白质组双向电泳分析[J]. 李明云,冀德伟,吴海庆,陈炯,史雨红,徐镇,徐万土. 农业生物技术学报. 2010(02)
博士论文
[1]基于生物芯片标记技术的五种濒危冷杉保护遗传学研究[D]. 饶龙兵.中国林业科学研究院 2009
[2]中国红鲤遗传多样性研究[D]. 王成辉.上海水产大学 2002
硕士论文
[1]香鱼养殖群体遗传多样性的AFLP分析及性别相关标记的筛选[D]. 范慧慧.宁波大学 2012
[2]白菜类作物DArT标记体系的建立[D]. 冯艳丽.中国农业科学院 2009
本文编号：3242109
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