长江上游中华纹胸鮡遗传多样性及遗传结构研究

发布时间：2021-06-22 22:04

　　为研究中华纹胸鮡（Glyptothorax sinensis）遗传多样性和遗传结构,对长江上游9个中华纹胸鮡群体（巴南、江津、合江、泸州、南溪、犍为、巧家、宁南和攀枝花）的Cyt b基因和COI基因进行分析。结果显示:341条Cyt b序列共检测出80个变异位点,65个单倍型,平均单倍型多样性（H_d）和平均核苷酸多样性（P_i）分别为0.845和0.007。109条COI序列共检测出31个变异位点,23个单倍型,H_d指数和P_i指数分别为0.774和0.005。分子方差分析（AMOVA）显示F_ST>0.5,说明中华纹胸鮡采样点群体间出现明显分化。构建的NJ树和单倍型网络结构图显示单倍型聚类形成三个高支持率的分支。 

【文章来源】：淡水渔业. 2020,50(04)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

中华纹胸鮡采样位点

对Cyt b序列的9个群体以及Clade I、II(图4)分别进行Tajima′s D[25]和Fu′s Fs[26]中性检验,结果显示Clade I(-59.18,-2.18)均为显著负值,长江上游群体也均为负值(表1)。碱基错配分析显示,Clade I、Clade II呈多峰结构(图4)。BSP分析结果表明,Clade I群体在距今0.1～0.04 Ma(百万年)经历了扩张事件。图3 基于Cyt b序列的中华纹胸鮡群体Structure聚类分析

图2 基于Cyt b序列(a)和COI序列(b)构建的中华纹胸鮡单倍型网络结构图(右)和邻接系统发育树(左)图4 基于Cyt b序列的中华纹胸鮡错配分布分析和BSP分析

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]长江上游大规模水库群综合运用联合优化调度研究[D]. 李纯龙.华中科技大学 2016

硕士论文
[1]三种鮡科鱼类线粒体全基因组的测定及鮡科鱼类系统发育分析[D]. 李博.华中农业大学 2016
[2]澜沧江老挝纹胸鮡遗传结构分析[D]. 金菊.华中农业大学 2011
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本文编号：3243605