杂交鳢PKCθ基因克隆及其在两种病原菌感染后的表达分析

发布时间：2021-06-24 08:48

　　为初步探索鱼类PKCθ基因在抵御病原菌感染过程中的作用,本研究进行了杂交鳢（Channa maculata♀×C. argus♂） PKCθ（CmaPKCθ）基因克隆及其在舒伯特气单胞菌（Aeromonas schubertii）、鰤鱼诺卡氏菌（Nocardia seriolae）感染后的表达分析。克隆获得CmaPKCθ的完整开放阅读框（ORF）长度为2 151 bp,预测编码716个氨基酸,具有保守的C1、C2样、C3和C4结构域。Blast分析表明CmaPKCθ氨基酸序列与尖吻鲈（Lates calcarifer） PKCθ的同源性最高,达92%。氨基酸多重序列比对显示CmaPKCθ具有保守的磷酸化位点和泛素化位点。系统进化树结果显示杂交鳢与其他鱼类的PKCθ聚为一个分支,其中与尖吻鲈PKCθ亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果表明,CmaPKCθ在健康杂交鳢的所有被检组织中广泛表达,其中在肝脏中表达水平最高,其次为脾脏、胸腺和头肾,在肌肉中的表达量最低。舒伯特气单胞菌和鰤鱼诺卡氏菌分别感染杂交鳢后,其肝脏、脾脏和头肾分别在第5天、第5天、第12小时和第10天、第2天、第3天时达到... 

【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(05)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

罗氏沼虾Ec R基因的PCR扩增片段

罗氏沼虾EcR基因预测的氨基酸序列(ecr-aa)和NCBI中已发表的EcR氨基酸(EcR-AA)序列比对

借助在线分析软件Expasy Protscale预测EcR蛋白的疏水性。结果显示，在-0.5以下的区域有很多氨基酸，即是亲水性区域，表明EcR蛋白具有亲水性(图5)，这与Expasy Protaram预测得到的总平均疏水指数(GRAVY=-0.442)结果一致。图4 基于EcR基因推导的氨基酸序列构建的系统进化树分析

【参考文献】：
期刊论文
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[6]杂交鳢（斑鳢♀×乌鳢♂）内脏类结节病病原菌的分离、鉴定与特性分析[J]. 刘春,李凯彬,王庆,常藕琴,梁慧丽,王芳,潘德博,石存斌,吴淑勤.  水产学报. 2012(07)
[7]日本沼虾蜕皮激素受体（EcR）的cDNA克隆及其在胚胎发育过程中的表达分析[J]. 陈辉,王文清,朱小玲.  海洋渔业. 2009(04)

博士论文
[1]黄脸油葫芦雌激素相关受体（ERR）和蜕皮激素受体（EcR）基因的克隆及其在发育过程中的表达研究[D]. 何慧.陕西师范大学 2010



本文编号：3246779