南极磷虾羧肽酶的适冷特性及蛋白质结构预测
发布时间:2021-07-06 17:00
研究南极磷虾羧肽酶的适冷特性,探讨其在催化反应过程中应对低温环境的机理,对酶类分子改造等基础学研究及实际生产应用具有一定意义。本研究首先比较了南极磷虾羧肽酶及牛(胰)羧肽酶的动力学,对其适冷性进行了分析,接着采用生物信息学方法,对其理化性质和氨基酸序列进行比对,并进行二级、三级结构预测,对南极磷虾羧肽酶的结构与适冷性关系进行探讨。结果显示,在4和30℃下,南极磷虾羧肽酶催化效率及对底物的亲和性均高于常温下的牛(胰)羧肽酶,更能适应低温环境。通过结构分析预测,南极磷虾羧肽酶氨基酸序列与河鳌虾等物种同源性较高,活性位点、Zn结合位点等存在保守性;不同的是与其他恒温动物相比南极磷虾羧肽酶含有更高比例的Asp和较低比例的Pro、Arg、Phe,可能致使其蛋白质分子内相互作用减弱,分子柔性增强;二级元件中松散的无规则卷曲占比相对较高,使得南极磷虾羧肽酶三级结构呈现出活性中心更暴露、整体结构更松散的状态。南极磷虾羧肽酶具有一定的适冷性,酶分子各级蛋白结构基于降低分子间作用力、提高分子柔性和减少活性位点空间位阻等,为其应对低温环境并保持较高效的催化能力起到了一定的作用。
【文章来源】:水产学报. 2020,44(11)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【参考文献】:
期刊论文
[1]藏药翼首草角鲨烯合成酶的生物信息学分析[J]. 何焱,李忠玥,李卿,吕宗友,权红,张磊,兰小中. 基因组学与应用生物学. 2020(07)
[2]南极磷虾羧肽酶A的分离纯化及其酶学性质分析[J]. 吴晶,周德庆,王珊珊,苏婷,朱兰兰. 南方农业学报. 2017(08)
[3]南极磷虾来源酶的研究进展[J]. 燕梦雅,陈雪忠,刘志东,刘宝林,黄洪亮,汪一红,曲映红,李斌,马庆保,戚亭,王帅. 食品工业科技. 2017(09)
[4]南极磷虾综合利用研究进展[J]. 谈俊晓,赵永强,李来好,杨贤庆,吴燕燕,魏涯,岑剑伟. 广东农业科学. 2017(03)
[5]南极磷虾胰蛋白酶的结构分析及适冷性机制研究[J]. 周婷婷,王锡昌,李燕. 现代食品科技. 2016(05)
[6]南极磷虾蛋白质的分离特性及其组分分析[J]. 李芳,刘俊荣,梁姗姗,闫瑞霞. 大连海洋大学学报. 2013(02)
[7]羧肽酶研究进展[J]. 吴静,闵柔,邬敏辰,陈伟. 食品与生物技术学报. 2012(08)
[8]南极微藻适应低温的研究进展[J]. 王欣,高宏. 安徽农业科学. 2012(10)
[9]牛ANGPTL2基因结构与功能的生物信息学分析[J]. 李芬,周佩,杨婷,陈宁博,马云. 华北农学报. 2012(01)
[10]适冷酶结构与功能的关系[J]. 陈秀兰,张玉忠. 中国农业科技导报. 2007(03)
博士论文
[1]南极磷虾油的分级制备及功能评价[D]. 谢丹.江南大学 2019
硕士论文
[1]南极大磷虾(Euphausia superba)胰蛋白酶适冷性酶学性质及结构特征分析[D]. 王军仁.中国海洋大学 2013
[2]南极大磷虾(Euphausia superba)胰蛋白酶样酶分离纯化、酶学性质探索及其生物学活性研究[D]. 向宇.中国海洋大学 2011
本文编号:3268624
【文章来源】:水产学报. 2020,44(11)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【参考文献】:
期刊论文
[1]藏药翼首草角鲨烯合成酶的生物信息学分析[J]. 何焱,李忠玥,李卿,吕宗友,权红,张磊,兰小中. 基因组学与应用生物学. 2020(07)
[2]南极磷虾羧肽酶A的分离纯化及其酶学性质分析[J]. 吴晶,周德庆,王珊珊,苏婷,朱兰兰. 南方农业学报. 2017(08)
[3]南极磷虾来源酶的研究进展[J]. 燕梦雅,陈雪忠,刘志东,刘宝林,黄洪亮,汪一红,曲映红,李斌,马庆保,戚亭,王帅. 食品工业科技. 2017(09)
[4]南极磷虾综合利用研究进展[J]. 谈俊晓,赵永强,李来好,杨贤庆,吴燕燕,魏涯,岑剑伟. 广东农业科学. 2017(03)
[5]南极磷虾胰蛋白酶的结构分析及适冷性机制研究[J]. 周婷婷,王锡昌,李燕. 现代食品科技. 2016(05)
[6]南极磷虾蛋白质的分离特性及其组分分析[J]. 李芳,刘俊荣,梁姗姗,闫瑞霞. 大连海洋大学学报. 2013(02)
[7]羧肽酶研究进展[J]. 吴静,闵柔,邬敏辰,陈伟. 食品与生物技术学报. 2012(08)
[8]南极微藻适应低温的研究进展[J]. 王欣,高宏. 安徽农业科学. 2012(10)
[9]牛ANGPTL2基因结构与功能的生物信息学分析[J]. 李芬,周佩,杨婷,陈宁博,马云. 华北农学报. 2012(01)
[10]适冷酶结构与功能的关系[J]. 陈秀兰,张玉忠. 中国农业科技导报. 2007(03)
博士论文
[1]南极磷虾油的分级制备及功能评价[D]. 谢丹.江南大学 2019
硕士论文
[1]南极大磷虾(Euphausia superba)胰蛋白酶适冷性酶学性质及结构特征分析[D]. 王军仁.中国海洋大学 2013
[2]南极大磷虾(Euphausia superba)胰蛋白酶样酶分离纯化、酶学性质探索及其生物学活性研究[D]. 向宇.中国海洋大学 2011
本文编号:3268624
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