一种短开读框编码的核糖体蛋白S27在日本囊对虾先天免疫中的功能研究
发布时间:2021-07-08 12:18
通过对基因组、转录组和蛋白质组的分析,显示不同生物中存在数百至数千个翻译但未注释的短开放阅读框(sORF)或称小开放阅读框(smORF)。短开放阅读框(sORF)是指编码少于100个密码子多肽的核苷酸序列。研究发现,许多sORF在机体的生命过程中发挥重要作用,例如生长发育,细胞凋亡和先天免疫等。我们在病毒刺激的日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus虾的血细胞和消化道等转录组中发现了多种不同的sORFs,通过对这些sORFs进行的生物信息学分析,发现有多种sORFs属于核糖体蛋白的组成成分。越来越多的研究表明,许多种核糖体蛋白除组成核糖体,参与蛋白质的生物合成之外,还具有独立于蛋白质生物合成的作用,例如参与DNA修复、细胞发育调控和细胞分化等核糖体外功能;并且在胃癌、结直肠癌、食管癌和肝癌等肿瘤组织中一些核糖体蛋白基因高表达。这些sORFs及其编码的多肽在对虾免疫防御中有什么功能?为了回答这个问题,本论文开展了 sORFs在对虾免疫反应中的功能研究。首先,我们通过组织分布以及表达模式对筛选的sORF进行分析,发现它们在所检测的各种对虾组织中均有分布,并在WSSV刺激后呈...
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1.?1对虾和果蝇Toll通路的比较(Li?&?Xiang,2013)
2.?3抗菌肽??在对虾中,AMP作为免疫反应的产物,在直接杀死或清除感染的病原面发挥重要作用(Bachereetal.,2004)。自从在凡纳滨对虾中发现了对革兰性细菌和真菌具有抗菌活性的对4下素(penaeidins)以来(Destoumieux?et1997),到目前为止,对虾中已有不同类型的抗微生物肽或蛋白质被报道。penaeidins?之外,还有?Crustins?和抗脂多糖因子(Antilipopolysaccharide?factoALF)等。研究发现,来自中国对虾的重组Crustins可以在体外抑制革兰氏菌的生长(Sunetal.,?2010)。??2.4酚氣化酶原级联反应??黑化作用是无脊椎动物中宿主防御的重要方面,其由响应于病原性感染氧化酶活化系统控制。在对虾中,黑化作用在防御多种包括鳗弧菌??
3.?3七种sORF的表达模式分析??为了检测这七种sORF是否会在WSSV感染日本囊对虾的过程中发挥作用,??我们用qPCR检测了这七种基因在WSSV刺激的不同时间点的表达情况。图2.3??表示的是这七种基因在血细胞中表达模式。由图中可以看出,婦SUMO-1,??婦SUMO-3,邱'RPS28,均RPS27,功TIPL38,姆ACBD6?在?WSSV?刺激后有明??显的上调表现,表明这几个基因对于WSSV感染日本囊对虾都有不同程度的响??应。而il^RPS27在WSSV刺激时,有明显的上调表达及显著性差异,因此我们??选定邱RPS27作为进一步研究的基因。??20??
本文编号:3271552
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1.?1对虾和果蝇Toll通路的比较(Li?&?Xiang,2013)
2.?3抗菌肽??在对虾中,AMP作为免疫反应的产物,在直接杀死或清除感染的病原面发挥重要作用(Bachereetal.,2004)。自从在凡纳滨对虾中发现了对革兰性细菌和真菌具有抗菌活性的对4下素(penaeidins)以来(Destoumieux?et1997),到目前为止,对虾中已有不同类型的抗微生物肽或蛋白质被报道。penaeidins?之外,还有?Crustins?和抗脂多糖因子(Antilipopolysaccharide?factoALF)等。研究发现,来自中国对虾的重组Crustins可以在体外抑制革兰氏菌的生长(Sunetal.,?2010)。??2.4酚氣化酶原级联反应??黑化作用是无脊椎动物中宿主防御的重要方面,其由响应于病原性感染氧化酶活化系统控制。在对虾中,黑化作用在防御多种包括鳗弧菌??
3.?3七种sORF的表达模式分析??为了检测这七种sORF是否会在WSSV感染日本囊对虾的过程中发挥作用,??我们用qPCR检测了这七种基因在WSSV刺激的不同时间点的表达情况。图2.3??表示的是这七种基因在血细胞中表达模式。由图中可以看出,婦SUMO-1,??婦SUMO-3,邱'RPS28,均RPS27,功TIPL38,姆ACBD6?在?WSSV?刺激后有明??显的上调表现,表明这几个基因对于WSSV感染日本囊对虾都有不同程度的响??应。而il^RPS27在WSSV刺激时,有明显的上调表达及显著性差异,因此我们??选定邱RPS27作为进一步研究的基因。??20??
本文编号:3271552
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