仿刺参（Apostichopus japonicus）高密度遗传连锁图谱构建及生长性状QTL精细定位
发布时间：2021-07-09 11:52
仿刺参Apostichopus japonicus （Selenka 1867）作为棘皮动物门的代表性物种之一,是我国水产养殖业中商业价值较高的经济物种,随着养殖规模的发展,仿刺参养殖已逐渐成为我国水产养殖业的支柱产业。本研究利用2b-RAD （2b-restriction site-associated DNA）技术,对仿刺参杂交家系子一代个体进行了高通量的SNP标记的开发。构建了高密度、高精度的仿剌参遗传连锁图谱,进行了生长性状的精细定位。为仿刺参全基因组测序以及其他基因组学和遗传学研究提供了丰富的信息和理论基础。同时也为仿刺参生长机制和分子标记辅助育种提供了理论和物质基础。1.作图家系的选择及仿刺参2b-RAD测序文库车的构建本研究中建立遗传图谱的家系的构建方法采用“双假拟测交”（double pseudo-testcross）策略,有目的地挑选了达到性成熟期的生长性状优良的个体分别作为建立家系的父母本,构建了9个“同父异母”的全同胞家系。在家系子代生长到1龄的时间点,进行采样和后期的家系鉴定,最终确定用于构建遗传图谱的家系材料。以杂交家系两个亲本和子一代100个个体的基因组DN...
【文章来源】：中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２．６?仿刺参整合阁谱２２个连锁群对染色体中屯、粒的推断??Ｆｉｇｕｒｅ??
位于１５．００－２４．００ｇ的区间范围内。其中在７．００－８．００ｇ的体重值区间范围内的个体??数最多，表现出了明显的峰值。分析结果显示作阐个体的体重基本符合正态分布??（图３．１），可用于后续的体重性状Ｑ化分析。??７９??
．连锁区间定位于构建的仿刺参遗传连锁图谱的第５号连锁群上，包含了?３个与??仿刺参生长性状呈显著相关的ＳＮＰ位点。这３个ＱＴＬ位点（ＳＮＰ１１３５８０１，??ＳＮＰ２３３６２９５，?ＳＮＰ２３３６３０６）定位于第５号连锁群的７９．６３－８０．０１?ｃＭ区间，共计??可Ｗ解释１９．８％的仿刺参作图个体的生长性状表型差异。??
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国刺参（♂）×日本红刺参（♀）杂交子代的胚胎、幼体发育及幼参生长性状的研究[J]. 孙秀俊,李琪,孔令锋,于瑞海. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2012(04)
[2]刺参受精及早期胚胎发育过程的细胞学观察[J]. 谭杰,孙慧玲,高菲,燕敬平,董迎辉,叶乃好,王清印. 水产学报. 2012(02)
[3]糙海参（Holothuria scabra）胚胎发育观察[J]. 劳赞,张丽敏,许波. 广东海洋大学学报. 2011(03)
[4]刺参染色体制备的初步研究[J]. 谭杰,孙慧玲,高菲,杨爱国,燕敬平,于东祥,刘志鸿,周丽青. 海洋科学. 2011(03)
[5]南方糙海参的人工催产与育苗初步试验[J]. 杨学明,张立,李有宁,陈明强,甘西. 南方水产科学. 2011(01)
[6]遗传标记的发展及其在家畜遗传育种中的应用[J]. 张蓉,刁其玉. 现代畜牧兽医. 2009(09)
[7]仿刺参精子形态与超微结构的研究[J]. 姚红伟,宋冠男,郭晋,高悦勉. 大连水产学院学报. 2009(S1)
[8]刺参的趋光性以及对附着基颜色的感应行为[J]. 张辉,王印庚,荣小军,曹善茂,陈霞. 生态学杂志. 2009(03)
[9]夏眠对刺参（Apostichopus japonicus （Selenka））能量收支的影响[J]. 袁秀堂,杨红生,王丽丽,周毅,张涛,刘鹰. 生态学报. 2007(08)
[10]刺参对筏式养殖海区生物沉积物清除作用的模拟研究[J]. 刘石林,杨红生,周毅,张涛,袁秀堂. 海洋科学. 2006(12)
博士论文
[1]刺参的幼体发育与遗传育种学研究[D]. 孙秀俊.中国海洋大学 2013
[2]刺参遗传连锁图谱构建及卵母细胞成熟过程研究[D]. 庞震国.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2009
硕士论文
[1]仿刺参Apostichopus japonicus胚胎发育和主要系统的组织学研究[D]. 朱峰.中国海洋大学 2009
[2]刺参的性腺发育及受精细胞学研究[D]. 庞震国.中国海洋大学 2006
本文编号：3273694
【文章来源】：中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２．６?仿刺参整合阁谱２２个连锁群对染色体中屯、粒的推断??Ｆｉｇｕｒｅ??
位于１５．００－２４．００ｇ的区间范围内。其中在７．００－８．００ｇ的体重值区间范围内的个体??数最多，表现出了明显的峰值。分析结果显示作阐个体的体重基本符合正态分布??（图３．１），可用于后续的体重性状Ｑ化分析。??７９??
．连锁区间定位于构建的仿刺参遗传连锁图谱的第５号连锁群上，包含了?３个与??仿刺参生长性状呈显著相关的ＳＮＰ位点。这３个ＱＴＬ位点（ＳＮＰ１１３５８０１，??ＳＮＰ２３３６２９５，?ＳＮＰ２３３６３０６）定位于第５号连锁群的７９．６３－８０．０１?ｃＭ区间，共计??可Ｗ解释１９．８％的仿刺参作图个体的生长性状表型差异。??
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国刺参（♂）×日本红刺参（♀）杂交子代的胚胎、幼体发育及幼参生长性状的研究[J]. 孙秀俊,李琪,孔令锋,于瑞海. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2012(04)
[2]刺参受精及早期胚胎发育过程的细胞学观察[J]. 谭杰,孙慧玲,高菲,燕敬平,董迎辉,叶乃好,王清印. 水产学报. 2012(02)
[3]糙海参（Holothuria scabra）胚胎发育观察[J]. 劳赞,张丽敏,许波. 广东海洋大学学报. 2011(03)
[4]刺参染色体制备的初步研究[J]. 谭杰,孙慧玲,高菲,杨爱国,燕敬平,于东祥,刘志鸿,周丽青. 海洋科学. 2011(03)
[5]南方糙海参的人工催产与育苗初步试验[J]. 杨学明,张立,李有宁,陈明强,甘西. 南方水产科学. 2011(01)
[6]遗传标记的发展及其在家畜遗传育种中的应用[J]. 张蓉,刁其玉. 现代畜牧兽医. 2009(09)
[7]仿刺参精子形态与超微结构的研究[J]. 姚红伟,宋冠男,郭晋,高悦勉. 大连水产学院学报. 2009(S1)
[8]刺参的趋光性以及对附着基颜色的感应行为[J]. 张辉,王印庚,荣小军,曹善茂,陈霞. 生态学杂志. 2009(03)
[9]夏眠对刺参（Apostichopus japonicus （Selenka））能量收支的影响[J]. 袁秀堂,杨红生,王丽丽,周毅,张涛,刘鹰. 生态学报. 2007(08)
[10]刺参对筏式养殖海区生物沉积物清除作用的模拟研究[J]. 刘石林,杨红生,周毅,张涛,袁秀堂. 海洋科学. 2006(12)
博士论文
[1]刺参的幼体发育与遗传育种学研究[D]. 孙秀俊.中国海洋大学 2013
[2]刺参遗传连锁图谱构建及卵母细胞成熟过程研究[D]. 庞震国.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2009
硕士论文
[1]仿刺参Apostichopus japonicus胚胎发育和主要系统的组织学研究[D]. 朱峰.中国海洋大学 2009
[2]刺参的性腺发育及受精细胞学研究[D]. 庞震国.中国海洋大学 2006
本文编号：3273694
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