瓯江彩鲤体色相关基因Sox10、Agouti、Tyrp1、Dct的分子克隆与表达分析
发布时间：2021-07-09 17:38
体色是鱼类一种较独特的表型性状，有重要的生物多样性价值和遗传学理论研究价值。鱼类体色变异研究一直是系统发育、脊椎动物遗传学和进化生物学的重要研究内容。瓯江彩鲤（Cyprinus carpio var. color）是分布在我国瓯江流域的一种鲤科鱼类，有“全红”、“大花”、“麻花”、“粉玉”和“粉花”五种基本体色类型，是进行鱼类体色研究的良好材料和模型。本论文以瓯江彩鲤为研究材料，在实验室前期研究工作的基础上，对黑色素合成通路中的四个基因（Sox10、Agouti、Tyrp1、Dct）进行了克隆及其在不同体色类型中表达分析，具体内容如下：1、Sox10基因的克隆和表达分析瓯江彩鲤Sox10基因的cDNA全长为2830bp，包括9bp5’-UTR、1375bp3’-UTR、和1446bp开放阅读框（编码481个氨基酸）。氨基酸序列的系统发育分析表明，瓯江彩鲤Sox10基因的氨基酸序列与其他部分物种的相似性在59%94%之间。RT-PCR分析表明，该基因在瓯江彩鲤皮肤、肌肉、眼睛和鳔组织中的表达量最高，鳃和心的表达量次之，肾和肝中没有表达。荧光定量PCR分析显示，Sox...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黑色素合成信号通路Fig.1Geneticpathwayformelanogenesis
上海海洋大学硕士学位论文5图1-1 实验鱼与其表皮取样图示Fig. 1-1 The fish and their skins used in the study1.2 主要仪器凝胶电泳系统: JUNYI，JY04S-3E高速冷冻离心机: cence，TGL-16微量离心机: EppendorfPC 仪: Eppendorf荧光定量 PCR 仪: Bio-Rad CFX-96超低温冰箱: SANYO MDF-382E普通冰箱: Haier BCD-268制冰机: GRANT高压灭菌锅: SHENAW LD2X-50KBS微量可调移液器: Eppendorf电泳仪: BGXP1.3 实验试剂Trizol TaKaRa 公司Prime Script RT-PCR Kit TaKaRa 公司LA Taq 酶 TaKaRa 公司PMD19-T vector 大连宝生物公司BioSpin Gel Extraction Kit 杭州博日公司3’-Full RACE Core Set Ver.2.0 TaKaRa 公司SMARTERTM RACE cDNA Amplification Kit Clontech 公司Advantage 2 PCR Kit Clontech 公司1x SYBR Green Master Mix Ta
图 1-4 瓯江彩鲤 Sox10 基因 cDNA 序列和推导的氨基酸序列阴影部分表示 ploy(A)尾巴；末端的加尾信号 aataaa 用斜体加下划线表示；下划线示起始码子 ATG；* 示终止密码子；小写字母示 5 '- 和 3 '-UTR.Fig. 1-4 cDNA and putative amino-acid sequences of Sox10 gene in Oujiang color commcarpThe ploy A signal is shade in gray; the terminal signal aataaa is underlined with italic in the 3'-ethe start codon ATG is underlined; the stop codon is indicated by an asterisk; the lowercaindicated 5' and 3' UTR.2.2 Sox10 的同源比较分析瓯江彩鲤 Sox10 基因的开放阅读框共编码 481 个氨基酸（图 1-4）。所得氨基酸通过 NCBI 的在线 BLAST 同源比对，氨基酸序列与斑马鱼（Danio reriNP_571950.1）、大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus , AFD97051.1）、泥鳅（ Misgurnus anguillicaudatus, AFD97052.1 ）、 青 鳉 （ Oryzias latipeNP_001158343.1）、半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis, ABW87298.1）、斜带石
【参考文献】：
期刊论文
[1]鱼类体色变异的遗传基础研究进展简述[J]. 王成辉. 上海海洋大学学报. 2012(05)
[2]瓯江彩鲤红、白两种体色遗传关系的初步研究[J]. 王成辉,项松平,吕耀平,王剑,潘增云,何小珍. 上海水产大学学报. 2008(04)
[3]鱼类色素细胞及体色调控[J]. 刘晓东,陈再忠. 水产科技情报. 2008(01)
[4]Agouti在不同颜色被毛羊驼皮肤组织中的表达[J]. 姜俊兵,赵志军,贺俊平,谢建山,董常生. 畜牧与兽医. 2007(04)
[5]几种鲤鲫鳞片色素细胞和体色发生的观察[J]. 徐伟,李池陶,曹顶臣,尹家胜. 水生生物学报. 2007(01)
[6]MITF基因与动物毛色的研究进展[J]. 白瑞,张美萍,乔德瑞,白军平,董常生. 上海畜牧兽医通讯. 2006(04)
[7]水晶彩鲫、红鲫、锦鲤、荷包红鲤杂交子代的生长和体色研究[J]. 徐伟,曹顶臣,李池陶,匡友谊,尹家胜. 水产学报. 2005(03)
[8]瓯江彩鲤体色与生长的遗传—环境互作分析[J]. 王成辉,李思发,曾伟光,徐志彬,项松平,王剑,段江萍,潘增云. 上海水产大学学报. 2004(02)
[9]哺乳动物毛色色素Agouti基因位点的研究进展[J]. 范瑞文,董常生,赫晓燕,张俊珍. 动物医学进展. 2004(03)
[10]黑色素的研究进展[J]. 舒文,毛华明. 国外畜牧学(猪与禽). 2003(02)
本文编号：3274183
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黑色素合成信号通路Fig.1Geneticpathwayformelanogenesis
上海海洋大学硕士学位论文5图1-1 实验鱼与其表皮取样图示Fig. 1-1 The fish and their skins used in the study1.2 主要仪器凝胶电泳系统: JUNYI，JY04S-3E高速冷冻离心机: cence，TGL-16微量离心机: EppendorfPC 仪: Eppendorf荧光定量 PCR 仪: Bio-Rad CFX-96超低温冰箱: SANYO MDF-382E普通冰箱: Haier BCD-268制冰机: GRANT高压灭菌锅: SHENAW LD2X-50KBS微量可调移液器: Eppendorf电泳仪: BGXP1.3 实验试剂Trizol TaKaRa 公司Prime Script RT-PCR Kit TaKaRa 公司LA Taq 酶 TaKaRa 公司PMD19-T vector 大连宝生物公司BioSpin Gel Extraction Kit 杭州博日公司3’-Full RACE Core Set Ver.2.0 TaKaRa 公司SMARTERTM RACE cDNA Amplification Kit Clontech 公司Advantage 2 PCR Kit Clontech 公司1x SYBR Green Master Mix Ta
图 1-4 瓯江彩鲤 Sox10 基因 cDNA 序列和推导的氨基酸序列阴影部分表示 ploy(A)尾巴；末端的加尾信号 aataaa 用斜体加下划线表示；下划线示起始码子 ATG；* 示终止密码子；小写字母示 5 '- 和 3 '-UTR.Fig. 1-4 cDNA and putative amino-acid sequences of Sox10 gene in Oujiang color commcarpThe ploy A signal is shade in gray; the terminal signal aataaa is underlined with italic in the 3'-ethe start codon ATG is underlined; the stop codon is indicated by an asterisk; the lowercaindicated 5' and 3' UTR.2.2 Sox10 的同源比较分析瓯江彩鲤 Sox10 基因的开放阅读框共编码 481 个氨基酸（图 1-4）。所得氨基酸通过 NCBI 的在线 BLAST 同源比对，氨基酸序列与斑马鱼（Danio reriNP_571950.1）、大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus , AFD97051.1）、泥鳅（ Misgurnus anguillicaudatus, AFD97052.1 ）、 青 鳉 （ Oryzias latipeNP_001158343.1）、半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis, ABW87298.1）、斜带石
【参考文献】：
期刊论文
[1]鱼类体色变异的遗传基础研究进展简述[J]. 王成辉. 上海海洋大学学报. 2012(05)
[2]瓯江彩鲤红、白两种体色遗传关系的初步研究[J]. 王成辉,项松平,吕耀平,王剑,潘增云,何小珍. 上海水产大学学报. 2008(04)
[3]鱼类色素细胞及体色调控[J]. 刘晓东,陈再忠. 水产科技情报. 2008(01)
[4]Agouti在不同颜色被毛羊驼皮肤组织中的表达[J]. 姜俊兵,赵志军,贺俊平,谢建山,董常生. 畜牧与兽医. 2007(04)
[5]几种鲤鲫鳞片色素细胞和体色发生的观察[J]. 徐伟,李池陶,曹顶臣,尹家胜. 水生生物学报. 2007(01)
[6]MITF基因与动物毛色的研究进展[J]. 白瑞,张美萍,乔德瑞,白军平,董常生. 上海畜牧兽医通讯. 2006(04)
[7]水晶彩鲫、红鲫、锦鲤、荷包红鲤杂交子代的生长和体色研究[J]. 徐伟,曹顶臣,李池陶,匡友谊,尹家胜. 水产学报. 2005(03)
[8]瓯江彩鲤体色与生长的遗传—环境互作分析[J]. 王成辉,李思发,曾伟光,徐志彬,项松平,王剑,段江萍,潘增云. 上海水产大学学报. 2004(02)
[9]哺乳动物毛色色素Agouti基因位点的研究进展[J]. 范瑞文,董常生,赫晓燕,张俊珍. 动物医学进展. 2004(03)
[10]黑色素的研究进展[J]. 舒文,毛华明. 国外畜牧学(猪与禽). 2003(02)
本文编号：3274183
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