条斑紫菜PHB基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2021-07-13 00:02

　　抗增殖蛋白（prohibitin）最早在哺乳动物中发现，有研究表明，抗增殖蛋白是一种分布广泛且高度保守的蛋白。因其具有抗细胞增殖，参与细胞衰老、凋亡等生物进程等的功能，已经引起研究者的广泛关注。条斑紫菜是我国重要的经济海藻之一，本论文以大型经济海藻为研究材料，克隆抗增殖蛋白基因，并对该基因的表达蛋白进行生物信息学分析。首先，从日本紫菜数据库中获得抗增殖蛋白相关EST序列并进行拼接，得到一条1167bp的抗增殖蛋白基因序列，据此序列设计特异性引物。对条斑紫菜丝状体细胞总RNA进行反转录获得cDNA。以cDNA为模版，采用PCR技术在特异性引物存在下对该序列进行扩增，获得了序列长度为1126bp的DNA片段。经BLAST比对显示该基因片段与其它物种的抗增殖蛋白基因编码的氨基酸序列相似度最高达到83%，并且克隆得到的抗增殖蛋白基因包含一个完整的开放阅读框，长度为894bp。其次，采用生物信息学方法和工具分析预测条斑紫菜抗增殖蛋白相应氨基酸序列的理化性质、结构特征。分析结果显示：克隆得到的抗增殖蛋白基因是一个不稳定的亲水性蛋白，共含有297个氨基酸，分子量为32954.5Da，等电点为6.88... 

【文章来源】：辽宁师范大学辽宁省

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.1条斑紫菜Fig1.1Porphyrayezoensis

图 1.2 条斑紫菜生活史Fig.1.2 Life cycle of Porphyra yezoensis活环境条斑紫菜叶状体，通常分布于沿海地区下带岩礁上（如半叶紫菜）或在潮上带是由单层细胞构成的紫红色和成簇生长因种类、品系、生长季节和生长环境的因为生活在潮间带，低潮时经常性地暴射阳光和低温具有很强的耐受力，生态养价值

ACCCAGCGTGAGCAGGTGTCGTGGACTTCAACATCGCCCTGGGAGTACACGGCGGCGGTGGGGCGCGGTTCCTGGTGGAGACGCGCAGGGTGAGGCCCGCTCCCGGGCTTTATCCAGCTCCGCATGTCCCGCTCGGCCAACCCTGGGGGAGGTTGCGTCCGACCGCGGCCAGAGGGGGAGGGCTCCGGCGGCGACTGCGACCCA据拼接后的片段，利用 primer5检测


本文编号：3280917