高体雅罗鱼线粒体基因组全序列测定及雅罗鱼亚科鱼类系统发育分析

发布时间：2021-07-15 20:55

　　高体雅罗鱼（Leuciscus idus）是一种冷水性鱼类,分布于欧洲、中亚和新疆北部的额尔齐斯河水系。高体雅罗鱼属于鲤科雅罗鱼属。世界上有雅罗鱼属鱼类大约30余种,我国有7种,它们是：瓦氏雅罗鱼（Leuciscus waleckii）、图们雅罗鱼（Leuciscus waleckii tumensis）、准噶尔雅罗鱼（Leuciscus merzbacheri）、贝加尔雅罗鱼（Leuciscus leuciscus baicalensis）、高体雅罗鱼（Leuciscus idus）、滩头雅罗鱼（Leuciscus brandti）和珠星雅罗鱼（Leuciscus hakonensis）。近些年来,雅罗鱼属各种的种群数量与规模都在下降,有的种在人们还没有开始了解它时就已经消失了。2013年《经济观察报》的一篇报道称黄河雅罗鱼在黄河里已经绝迹,我国的雅罗鱼类种群现状可见一斑。目前雅罗鱼属鱼类已经公开的线粒体基因信息也不是很多,GenBank上面仅公布了瓦氏雅罗鱼的线粒体基因全序列。本实验以瓦氏雅罗鱼的线粒体DNA为模板,使用步移法扩增并测定了高体雅罗鱼的线粒体基因全序列,并已上传Gen... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语表
第一章 文献综述
    1 线粒体
    2 鱼类线粒体基因组研究现状
        2.1 鱼类线粒体基因组的结构
            2.1.1 蛋白质编码基因
            2.1.2 tRNA基因
            2.1.3 rRNA基因
            2.1.4 非编码区
        2.2 鱼类线粒体基因组的特点
    3 线粒体DNA在鱼类遗传学中的应用
        3.1 线粒体DNA在鱼类系统学中的应用
            3.1.1 系统发育与种群关系
            3.1.2 分子系统地理学
        3.2 在鱼类种间杂交渐渗的应用
        3.3 种群的识别
    4 雅罗鱼亚科鱼类的系统进化关系研究现状
    5 研究的目的和意义
第二章 高体雅罗鱼线粒体基因组全序列的测定及分析
    1 实验材料与方法
        1.1 实验仪器
        1.2 实验试剂
        1.3 样本
        1.4 实验前的准备工作
        1.5 实验方法
            1.5.1 DNA的提取
            1.5.2 PCR引物的设计
            1.5.3 PCR扩增反应
            1.5.4 电泳检测
    2 结果与分析
        2.1 高体雅罗鱼线粒体DNA结构
        2.2 碱基组成
        2.3 蛋白质编码基因
        2.4 rRNA基因和tRNA基因
    3 讨论
第三章 雅罗鱼亚科16个属的系统进化树的构建
    1 材料与方法
        1.1 实验数据的获得
        1.2 实验方法
    2 结果与分析
        2.1 用于构建分子树的数据集的比较信息
            2.1.1 Cyt b基因数据集的比较信息
            2.1.2 16S rRNA基因数据集的比较信息
        2.2 建树结果
            2.2.1 基于Cyt b基因数据集的建树结果
            2.2.2 基于16SrRNA基因数据集的建树结果
    3 讨论
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体Cytb基因全序列的松江鲈群体遗传结构分析[J]. 高天翔,毕潇潇,赵林林,李创举.  水生生物学报. 2013(02)
[2]舌鳎亚科鱼类线粒体控制区快速进化及其重复序列延伸机制初步研究[J]. 时伟,孔晓瑜,江金霞,苗宪广.  中国海洋大学学报(自然科学版). 2012(Z1)
[3]动物组织线粒体DNA研究进展[J]. 樊贺明,杨明妍,毕峰.  当代医学. 2011(29)
[4]两种鯻科鱼类线粒体16S rRNA基因片段序列分析[J]. 张龙岗,孟庆磊,安丽,董学飒,付佩胜.  生物技术通报. 2011(08)
[5]基于线粒体DNA 12S rRNA和COⅢ基因序列研究中国沿海7个长蛸（Octopus variabilis）野生群体的遗传多样性[J]. 徐梅英,李继姬,郭宝英,吕振明,周超,吴常文.  海洋与湖沼. 2011(03)
[6]条石鲷养殖群体线粒体控制区序列遗传变异分析[J]. 孙鹏,李杰,尹飞,彭士明,柳敏海,施兆鸿.  海洋渔业. 2011(01)
[7]基于12S rRNA部分序列分析的中国8种笛鲷科鱼类系统发育初探[J]. 唐优良,章群,余帆洋,周佳怡,司丛利,黄小彧,马奔.  海洋科学. 2011(02)
[8]基于16SrRNA部分序列探讨中国近海十三种石首鱼类的分子系统进化关系[J]. 张永,马春艳,马凌波,倪勇,沈盎绿.  海洋渔业. 2010(03)
[9]基于线粒体控制区全序列的长江中下游鳊的遗传多样性研究[J]. 杨凡,彭博,赵爽,章群.  广东农业科学. 2010(03)
[10]鳙的线粒体基因组核苷酸全序列分析(英文)[J]. 杨琴玲,李思发,徐嘉伟,陈琴,王成辉.  生物技术通报. 2009(02)

博士论文
[1]东亚鲤科鱼类的分子系统发育研究[D]. 王绪祯.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2005

硕士论文
[1]隆额网翅蝗线粒体基因组全序列的测定与分析[D]. 刘念.陕西师范大学 2006
[2]RNA的二级结构[D]. 郭颖.大连理工大学 2005



本文编号：3286450