不同环境下鳢肠道菌群特征及饲料中添加乳酸菌的效果研究

发布时间：2021-07-23 01:54

　　鱼类肠道微生物在鱼类营养以及健康方面具有重要的作用,肠道微生物不仅能促使鱼类肠道的正常消化、吸收,还能抑制有害菌的入侵,提高巨噬细胞活性,增强机体免疫功能。本文研究不同环境下养殖和野生鳢肠道微生物群落结构特征、以及添加乳酸菌对鳢肠道微生物和生长的影响,为鳢的健康养殖和全雄杂交鳢良种良法推广提供基础。1. 不同环境下鳢的肠道微生物群落结构研究。采用Illumina Hi Seq 2500对不同养殖环境中成熟健康杂交鳢以及野生鳢肠道内容物微生物进行测序及信息分析。结果表明:不同环境（分别为珠海斗门、佛山南海、佛山顺德杏坛、阳江四个地点）鳢肠道内容物样品间OTU个数具有一定的差别,表明了不同环境下鳢肠道内容物中微生物多样性具有差异;研究样品中优势菌群主要是:红球菌属Rhodococcus、梭菌属Clostridium、微杆菌Microbacterium、弧菌属Vibrio、气单胞菌属Aeromonas、邻单胞菌属Plesiomonas等,梭菌属、红球菌属在所有样品中都存在,但不同环境下所占的比例不同;热图分析发现,鳢肠道微生物群落中还包含了变形杆菌属Proteus、乳杆菌属Lactobaci... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：59 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

各样品OTU个数分布图

上海海洋大学硕士学位论文11图1-3样品稀释曲线Figure1-3sampledilutioncurve1.2.2.2肠道微生物Alpha多样性如表1-2：每个样品的Coverage均达到了99%，说明了每个样品序列几乎全被检测出且达到饱和状态，OTU覆盖率数值越高，样本物种检测概率越高。Coverage指数反映此次样品中肠道微生物菌群结构组成以及多样性的真实性，每个样品的Coverage值都接近百分百，证实了此次试验数据的可靠性。Chao1和Ace指数衡量物种丰富度，Shannon和Simpson指数衡量物种多样性[70]。比较31个样品，发现CA50的Chao1值最大，高达364.1818，说明这个样品里的微生物菌群丰富度最大；CA44的Simpson值最小，为0.0185；Shannon值最大，为4.5222，说明此样品的肠道微生物群落多样性最大。

上海海洋大学硕士学位论文14势菌群主要有肠球菌属Enterococcus、乳杆菌属Lactobacillus、拟杆菌属Bacteroides、Prevotella(属于拟杆菌属)、Bosea(属于变形杆菌属Proteus)、Phreatobacter(属于变形杆菌属)、Rhodobacter(属于变形杆菌属)等；而佛山南海池塘养殖鳢肠道中的优势菌群则为：棒杆菌属Corynebacterium、短杆菌属Brevibacterium、Cloacibacterium(属于拟杆菌属)、梭菌属、Massilia(属于变形杆菌属)、罗斯氏菌属Rothia等；珠海斗门养殖鳢肠道微生物优势菌群相对集中，只有弧菌属和梭菌属；佛山顺德杏坛养殖鳢肠道的优势菌群有假单胞菌属Pseudomonas、泛菌属Pantoea、短波单胞菌属Brevundimonas等；在阳江采集的野生鳢肠道内容物中，优势菌群有葡萄球菌Staphylococcus、梭菌属、气单胞菌属等。图1-4物种丰度聚类热图Figure1-4speciesabundanceclusteringheatmap注：颜色代表物种丰度程度，横向聚类为样品信息，纵向聚类为微生物物种信息，最左侧为微生物物种聚类树，最上方为样品聚类树。Note:Colorrepresentsthedegreeofspeciesabundance,horizontalclusteringissampleinformation,


本文编号：3298349