稻田和池塘两种模式下金边鲤与建鲤肠道菌群差异分析
发布时间：2021-07-27 09:43
利用MiSeq高通量测序技术测定16S rRNA基因序列,分析比较池塘金边鲤、稻田金边鲤、池塘建鲤和稻田建鲤4组鲤鱼肠道菌群的结构组成和丰度差异。试验结果显示,池塘金边鲤组、稻田金边鲤组、池塘建鲤组和稻田建鲤组分别获得了377、250、367和455个运算分类单元,其中运算分类单元聚类分析发现,稻田建鲤组与另外3组差异最大;菌群多样性分析发现,池塘金边鲤组的辛普森指数显著高于其他3组（P<0.05）,而稻田建鲤组及稻田金边鲤组的香农指数分别为1.56±0.22和2.53±0.82,均高于对应的池塘组,但差异不显著（P>0.05）;此外,池塘金边鲤组中变形菌门（89.56%）和气单胞菌属（82.68%）在其肠道菌群组成中占有绝对优势（P<0.05）,而另外3组在门分类水平和属分类水平的菌群结构和相对丰度较为相似,优势菌门均为变形菌门、梭杆菌门和厚壁菌门,主要优势菌属为鲸杆菌属、气单胞菌属和乳球菌属;京都基因和基因组百科全书（KEGG）功能预测比较分析发现,各组样品的肠道微生物富集到了多个相同的代谢途径以及部分信号传导、调节和修复机制相关信号通路。本研究结果发现,在稻田和...
【文章来源】：水产科学. 2020,39(04)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
各组样品优势操作分类单元丰度热图
各组样品前50信号通路维恩图
在正常的生长环境下,生物体内的大多数微生物在调节机体的各种生命功能方面起着积极的作用[11]。大量水产养殖研究表明,由于水生动物生活环境的特殊性,养殖模式、池塘水质、饲料类型等环境影响因素以及发育阶段、肠道结构、营养水平和系统发育地位等变化均可打破微生物与生物之间的平衡,从而影响水生动物消化道中微生物的种类和数量[12-14]。研究证实,微生物环境可以通过水环境、饲料等引起草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群结构发生改变[15-16]。此外,同一养殖环境下的不同鱼类,其肠道微生物群落的组成还可能会受到食性、栖息地和基因型的影响[17-19]。孟晓林等[20]发现,不同质量浓度的铜可影响鲤鱼肠道菌群的多样性和结构组成,并对鲤鱼肠道上皮免疫屏障造成损伤。本研究发现,不同生长环境下的金边鲤和建鲤肠道菌群均存在一定的差异,提示养殖环境会对鲤鱼的肠道微生物群落结构产生不同程度的影响。该结果与李建柱[21]的研究结果基本一致,即在鱼菜共生模式下,草鱼、鲫鱼(Carassius auratus)、鲢鱼(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙鱼(Aristichthys nobilis)等4种不同的鲤科鱼类肠道微生物的菌落组成和优势菌落具有一定的相似性,但是与其他养殖模式中鱼类的肠道微生物菌落却具有差异性[21]。大量研究证实,鱼类的肠道菌群受多种因素的影响,但这些因素的独立或协同作用机制有待进一步研究。3.2 不同品种鲤鱼肠道微生物优势菌群比较分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]2种活菌饲料对金鲫幼鱼肠道及水体微生态的影响[J]. 马小康,吴小嫚,胡乐琴. 水产科学. 2018(03)
[2]水体铜对鲤肠道菌群结构及免疫力的影响[J]. 孟晓林,朱振祥,李帅,胡文攀,明红,聂国兴. 河南师范大学学报(自然科学版). 2018(03)
[3]海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析[J]. 王元,周俊芳,韦信贤,马荣荣,赵姝,李新苍,房文红. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2018(02)
[4]斑马鱼肠道细菌的16S rDNA分子鉴定及PCR-SSCP分析[J]. 胡秀彩,吕爱军,孙敬锋,石洪玥,YEONG Yiksung,裴超,张超,李莉. 大连海洋大学学报. 2018(01)
[5]稻田养鱼前景浅析[J]. 张学军. 南方农业. 2018(02)
[6]肠道菌群与草鱼个体大小相关性研究[J]. 王微微,高丽丽,王小敏,徐运娥,周安. 安徽农业科学. 2017(33)
[7]盐碱池塘养殖鲤肠道菌群的分子分析[J]. 黄进强,刘哲,王建福,蔡原,冯志云. 农业生物技术学报. 2013(06)
[8]主养草鱼池塘三种混养模式下鱼类肠道菌群PCR-DGGE比较[J]. 王琴,熊邦喜,朱玉婷,施培松,余育和. 农业生物技术学报. 2012(03)
博士论文
[1]鲤鱼早期发育阶段肠道菌群的分析及其免疫相关性研究[D]. 王蕾.山东师范大学 2017
[2]几种水生动物肠道细菌的分子生态学分析[D]. 李可俊.上海交通大学 2007
硕士论文
[1]四川省两种养殖模式下大鳞副泥鳅肠道微生物菌群特征、肠道酶活及肌肉氨基酸组分的比较[D]. 段元亮.四川农业大学 2017
[2]鱼菜共生模式中微生物群落结构及多样性的研究[D]. 李建柱.华中农业大学 2016
[3]水雍菜浮床养殖模式下黄颡鱼肠道及环境微生物多样性的研究[D]. 石焱.华中农业大学 2015
本文编号：3305540
【文章来源】：水产科学. 2020,39(04)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
各组样品优势操作分类单元丰度热图
各组样品前50信号通路维恩图
在正常的生长环境下,生物体内的大多数微生物在调节机体的各种生命功能方面起着积极的作用[11]。大量水产养殖研究表明,由于水生动物生活环境的特殊性,养殖模式、池塘水质、饲料类型等环境影响因素以及发育阶段、肠道结构、营养水平和系统发育地位等变化均可打破微生物与生物之间的平衡,从而影响水生动物消化道中微生物的种类和数量[12-14]。研究证实,微生物环境可以通过水环境、饲料等引起草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群结构发生改变[15-16]。此外,同一养殖环境下的不同鱼类,其肠道微生物群落的组成还可能会受到食性、栖息地和基因型的影响[17-19]。孟晓林等[20]发现,不同质量浓度的铜可影响鲤鱼肠道菌群的多样性和结构组成,并对鲤鱼肠道上皮免疫屏障造成损伤。本研究发现,不同生长环境下的金边鲤和建鲤肠道菌群均存在一定的差异,提示养殖环境会对鲤鱼的肠道微生物群落结构产生不同程度的影响。该结果与李建柱[21]的研究结果基本一致,即在鱼菜共生模式下,草鱼、鲫鱼(Carassius auratus)、鲢鱼(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙鱼(Aristichthys nobilis)等4种不同的鲤科鱼类肠道微生物的菌落组成和优势菌落具有一定的相似性,但是与其他养殖模式中鱼类的肠道微生物菌落却具有差异性[21]。大量研究证实,鱼类的肠道菌群受多种因素的影响,但这些因素的独立或协同作用机制有待进一步研究。3.2 不同品种鲤鱼肠道微生物优势菌群比较分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]2种活菌饲料对金鲫幼鱼肠道及水体微生态的影响[J]. 马小康,吴小嫚,胡乐琴. 水产科学. 2018(03)
[2]水体铜对鲤肠道菌群结构及免疫力的影响[J]. 孟晓林,朱振祥,李帅,胡文攀,明红,聂国兴. 河南师范大学学报(自然科学版). 2018(03)
[3]海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析[J]. 王元,周俊芳,韦信贤,马荣荣,赵姝,李新苍,房文红. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2018(02)
[4]斑马鱼肠道细菌的16S rDNA分子鉴定及PCR-SSCP分析[J]. 胡秀彩,吕爱军,孙敬锋,石洪玥,YEONG Yiksung,裴超,张超,李莉. 大连海洋大学学报. 2018(01)
[5]稻田养鱼前景浅析[J]. 张学军. 南方农业. 2018(02)
[6]肠道菌群与草鱼个体大小相关性研究[J]. 王微微,高丽丽,王小敏,徐运娥,周安. 安徽农业科学. 2017(33)
[7]盐碱池塘养殖鲤肠道菌群的分子分析[J]. 黄进强,刘哲,王建福,蔡原,冯志云. 农业生物技术学报. 2013(06)
[8]主养草鱼池塘三种混养模式下鱼类肠道菌群PCR-DGGE比较[J]. 王琴,熊邦喜,朱玉婷,施培松,余育和. 农业生物技术学报. 2012(03)
博士论文
[1]鲤鱼早期发育阶段肠道菌群的分析及其免疫相关性研究[D]. 王蕾.山东师范大学 2017
[2]几种水生动物肠道细菌的分子生态学分析[D]. 李可俊.上海交通大学 2007
硕士论文
[1]四川省两种养殖模式下大鳞副泥鳅肠道微生物菌群特征、肠道酶活及肌肉氨基酸组分的比较[D]. 段元亮.四川农业大学 2017
[2]鱼菜共生模式中微生物群落结构及多样性的研究[D]. 李建柱.华中农业大学 2016
[3]水雍菜浮床养殖模式下黄颡鱼肠道及环境微生物多样性的研究[D]. 石焱.华中农业大学 2015
本文编号：3305540
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