红鳍东方鲀卵巢与精巢的蛋白质组比较分析

发布时间：2021-07-27 17:34

　　为研究红鳍东方鲀Takifugu rubripes性腺发生的相关机制,选择3龄体质量约2.0 kg的红鳍东方鲀成熟卵巢与精巢组织,利用非标记定量技术（Lable-free）对卵巢与精巢两种组织蛋白质组进行定性与定量分析,并运用GO、KEGG分析等方法对差异表达的蛋白进行富集分析。结果表明:非标记定量显示,在两组织间卵巢中特有的蛋白为150个,精巢中特有的蛋白为132个,有172个在卵巢中表达较高的蛋白及161个在精巢中表达较高的蛋白,在卵巢中存在与卵巢发育相关的高表达蛋白ELAVL2、RNA helicase、LSM4和FRUYP1,而在精巢中特异表达蛋白GSDF影响精巢发育;经GO分析发现,RNA结合（RNA binding）可能影响卵巢发育,两组织差异蛋白在膜组成部分（Integral component of membrane）具有最大差值;GO功能显著性富集分析得出,转移酶活性（Transferase activity）在两组织之间差异最显著;KEGG通路分析显示,核糖体通路（Ribosome）在两组织间差异蛋白最多,该通路也可能与性腺发育相关,通路中核糖体蛋白L10A被证实与... 

【文章来源】：大连海洋大学学报. 2020,35(06)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

鉴定蛋白对应肽段分布图

对差异蛋白进行KEGG通路分析显示,仅有126 个差异蛋白富集到KEGG通路上。确定差异蛋白参与的最主要生化代谢通路和信号转导通路为核糖体(Ribosome)、吞噬体(Phagosome)、亨廷顿氏病(Huntington’s disease)等,其中,核糖体通路中差异蛋白最多(见电子版附录A图A3)。核糖体通路中注释到的蛋白如图6所示,该通路在两组之间的差异可从GO富集分析中反映出来,其大部分差异蛋白发生在卵巢。而吞噬体通路有10个差异蛋白,其中7个差异蛋白在精巢中高表达或特有,这些富集大量差异蛋白的通路有可能是引起组织差异的某些生物过程。图3 细胞组分中差异蛋白的GO富集

细胞组分中差异蛋白的GO富集

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3306234