高氨氮、低pH应激下日本囊对虾转录组分析及MjChi4基因的功能研究
发布时间：2021-07-29 16:17
日本囊对虾（Marsupenaeus japonicus）是最具养殖价值的对虾品种之一。高氨氮、低pH是影响其养殖效果的重要环境因子,由于工厂化养殖模式下饵料及排泄物的积累、人类活动及气候变暖致使水环境不断恶化,高氨氮和低pH胁迫对日本囊对虾养殖业造成的影响日趋严重。因此提高日本囊对虾的高氨氮、低pH抗性,选育对氨氮、pH胁迫具有较强抗性的新品种势在必行。但传统的育种方法成本高、周期长,对低遗传力性状改良效果不明显。所以本研究采用转录组测序方法,分析日本囊对虾响应高氨氮、低pH胁迫的分子机制,挖掘相关应激响应基因;克隆获得应激响应基因几丁质酶4（MjChi4）全长c DNA,利用qRT-PCR和RNA干扰分析,进一步验证其可能参与对虾抗高氨氮和抗低pH功能。本研究对加快日本囊对虾抗高氨氮、低pH新品种选育具有重要意义。主要研究结果如下:（1）高氨氮应激下日本囊对虾转录组分析采用RNA-seq方法对高氨氮胁迫下日本囊对虾的肝胰腺进行分析,从10个转录本中获得44,735,330–56,680,154个clean reads,有80.20%–82.38%的reads被映射到参考转录本。鉴定...
【文章来源】：广东海洋大学广东省
【文章页数】：92 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
注释基因的GO条目分类Fig2-1TheGOentriesclassificationofannotatedgenes
广东海洋大学硕士学位论文13图2-2注释基因的KOG功能分类Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes图2-3注释基因的KEGG通路分类Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA为细胞过程；B为环境信息处理；C为遗传信息处理；D为代谢；E为有机系统。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
广东海洋大学硕士学位论文13图2-2注释基因的KOG功能分类Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes图2-3注释基因的KEGG通路分类Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA为细胞过程；B为环境信息处理；C为遗传信息处理；D为代谢；E为有机系统。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
【参考文献】：
期刊论文
[1]斑节对虾耐氨氮和淡水应激性状的遗传参数估计[J]. 周发林,杨其彬,黄建华,姜松,杨丽诗,张汤生,江世贵. 南方水产科学. 2019(05)
[2]pH对日本囊对虾的急性毒性初步研究[J]. 梁彩凤,刘建勇. 渔业现代化. 2019(01)
[3]日本沼虾几丁质酶1C（MnCht1C）基因的克隆及表达分析[J]. 张文宜,张世勇,陈校辉,乔慧,蒋速飞,熊贻伟,金舒博,龚永生,傅洪拓. 基因组学与应用生物学. 2018(02)
[4]日本囊对虾（Marsupenaeus japonicus）秋繁同生群仔虾不同耐寒性能群体间的形态表型差异[J]. 王志铮,张晓霞,任夙艺,蒋宏雷,刘伟健,Donatha Kajuna,Msumenji Phiri. 海洋与湖沼. 2018(01)
[5]海洋酸化对海水青鳉性别分化的影响[J]. 宋露露,王晓杰,宋佳坤. 上海海洋大学学报. 2018(01)
[6]pH值、温度和盐度对墨吉明对虾蛋白酶和淀粉酶活力的影响[J]. 郭文浚,杨世平,刘慧玲,王成桂,孙成波. 饲料工业. 2017(24)
[7]凡纳滨对虾氨氮急性胁迫应激敏感群体和耐受群体对WSSV敏感性的差异分析[J]. 卢霞,栾生,曹宝祥,郝登春,孟宪红,曹家旺,代平,罗坤,孔杰. 渔业科学进展. 2018(01)
[8]水生甲壳类几丁质酶类基因家族功能与表达调控的研究进展[J]. 李旭光,周刚,周军,林海,李跃华,陆全平,付龙龙,张云贵. 水产养殖. 2017(04)
[9]不同放养密度对日本囊对虾生长性能的影响[J]. 林星,邱金海. 养殖与饲料. 2017(02)
[10]低pH胁迫对克氏原螯虾鳃和肝胰腺酶活力及组织结构的影响[J]. 陶易凡,强俊,王辉,徐跑,马昕羽,赵文强. 中国水产科学. 2016(06)
博士论文
[1]凡纳滨对虾生长和抗病性状的全基因组关联分析与基因组选择育种研究[D]. 王全超.中国科学院大学(中国科学院海洋研究所) 2017
[2]凡纳滨对虾分子标记的开发及其在遗传育种中的应用[D]. 于洋.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2014
[3]pH、氨氮胁迫对中国对虾细胞凋亡和抗氧化系统影响机理的研究[D]. 王芸.上海海洋大学 2011
硕士论文
[1]pH胁迫对中华绒螯蟹幼蟹生长的影响及其营养干预研究[D]. 黄志鹏.华东师范大学 2018
[2]柑橘全爪螨几丁质酶基因RNAi载体构建及其在柑橘中的转化研究[D]. 李俊丽.西南大学 2013
[3]pH胁迫对三种养殖对虾生理生化指标的影响[D]. 赵先银.上海海洋大学 2011
[4]不同盐度和pH对中国对虾幼虾的影响[D]. 陈丽.河北大学 2001
本文编号：3309645
【文章来源】：广东海洋大学广东省
【文章页数】：92 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
注释基因的GO条目分类Fig2-1TheGOentriesclassificationofannotatedgenes
广东海洋大学硕士学位论文13图2-2注释基因的KOG功能分类Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes图2-3注释基因的KEGG通路分类Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA为细胞过程；B为环境信息处理；C为遗传信息处理；D为代谢；E为有机系统。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
广东海洋大学硕士学位论文13图2-2注释基因的KOG功能分类Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes图2-3注释基因的KEGG通路分类Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA为细胞过程；B为环境信息处理；C为遗传信息处理；D为代谢；E为有机系统。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
【参考文献】：
期刊论文
[1]斑节对虾耐氨氮和淡水应激性状的遗传参数估计[J]. 周发林,杨其彬,黄建华,姜松,杨丽诗,张汤生,江世贵. 南方水产科学. 2019(05)
[2]pH对日本囊对虾的急性毒性初步研究[J]. 梁彩凤,刘建勇. 渔业现代化. 2019(01)
[3]日本沼虾几丁质酶1C（MnCht1C）基因的克隆及表达分析[J]. 张文宜,张世勇,陈校辉,乔慧,蒋速飞,熊贻伟,金舒博,龚永生,傅洪拓. 基因组学与应用生物学. 2018(02)
[4]日本囊对虾（Marsupenaeus japonicus）秋繁同生群仔虾不同耐寒性能群体间的形态表型差异[J]. 王志铮,张晓霞,任夙艺,蒋宏雷,刘伟健,Donatha Kajuna,Msumenji Phiri. 海洋与湖沼. 2018(01)
[5]海洋酸化对海水青鳉性别分化的影响[J]. 宋露露,王晓杰,宋佳坤. 上海海洋大学学报. 2018(01)
[6]pH值、温度和盐度对墨吉明对虾蛋白酶和淀粉酶活力的影响[J]. 郭文浚,杨世平,刘慧玲,王成桂,孙成波. 饲料工业. 2017(24)
[7]凡纳滨对虾氨氮急性胁迫应激敏感群体和耐受群体对WSSV敏感性的差异分析[J]. 卢霞,栾生,曹宝祥,郝登春,孟宪红,曹家旺,代平,罗坤,孔杰. 渔业科学进展. 2018(01)
[8]水生甲壳类几丁质酶类基因家族功能与表达调控的研究进展[J]. 李旭光,周刚,周军,林海,李跃华,陆全平,付龙龙,张云贵. 水产养殖. 2017(04)
[9]不同放养密度对日本囊对虾生长性能的影响[J]. 林星,邱金海. 养殖与饲料. 2017(02)
[10]低pH胁迫对克氏原螯虾鳃和肝胰腺酶活力及组织结构的影响[J]. 陶易凡,强俊,王辉,徐跑,马昕羽,赵文强. 中国水产科学. 2016(06)
博士论文
[1]凡纳滨对虾生长和抗病性状的全基因组关联分析与基因组选择育种研究[D]. 王全超.中国科学院大学(中国科学院海洋研究所) 2017
[2]凡纳滨对虾分子标记的开发及其在遗传育种中的应用[D]. 于洋.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2014
[3]pH、氨氮胁迫对中国对虾细胞凋亡和抗氧化系统影响机理的研究[D]. 王芸.上海海洋大学 2011
硕士论文
[1]pH胁迫对中华绒螯蟹幼蟹生长的影响及其营养干预研究[D]. 黄志鹏.华东师范大学 2018
[2]柑橘全爪螨几丁质酶基因RNAi载体构建及其在柑橘中的转化研究[D]. 李俊丽.西南大学 2013
[3]pH胁迫对三种养殖对虾生理生化指标的影响[D]. 赵先银.上海海洋大学 2011
[4]不同盐度和pH对中国对虾幼虾的影响[D]. 陈丽.河北大学 2001
本文编号：3309645
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3309645.html
