分子标记技术在日本对虾育种中的应用研究
发布时间：2021-08-16 16:48
日本对虾是我国重要的对虾养殖种类，开展其良种选育工作具有重要的经济意义。本文以日本对虾育种群体为材料，用微卫星分子标记对不同选育群体进行遗传鉴定，并建立了基于微卫星信息的遗传参数估计方法，为进一步开展日本对虾分子辅助选育工作奠定了重要的技术基础。对日本对虾育种群体进行耐高温测试，分析高温耐受性与生长性状、近交水平的关系；利用SLAF测序法筛选与耐高温性状关联的SNP标记，为改良日本对虾高温耐受性提供分子辅助手段。利用8对微卫星引物对日本对虾养殖群体两个世代的遗传结构进行了分析，共计检测到108个等位基因，等位基因长度为196-528bp，各位点等位基因数为6-23个。亲本和子代群体每个位点平均等位基因数目分别为8.5个和11.5个，平均观测杂合度分别为0.7211和0.6319，平均期望杂合度分别为0.7748和0.7635，平均多态信息含量分别为0.7315和0.7286。根据标记信息利用最大似然法对两个世代的个体分别进行系谱结构推断，亲本群体划分为6个群体，群体间遗传距离为0.2773-2.356，均值为1.5097；子代群体划分为17个群体，群体间遗传距离为0-2.5929，均值...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2-1日本对虾基因组DNA电泳图
图2-1 日本对虾基因组DNA电泳图Fig. 2-1 Electrophoretogra for Genomes DNA of Masupenaeus japonicas图2-2 日本对虾基因组DNA的分光光度计检测结果图Fig. 2-2 Map Result of Genomes DNA of Masupenaeus japonicas by Spectrophotometry3.2 8 个微卫星位点扩增结果及多态性本研究通过读取 8 个微卫星位点的峰图（图 2-3，图 2-4 和图 2-5）来实现基因分型，每个峰簇代表 1 个等位基因。日本对虾是 2 倍体生物，对 1 个正常个体来说，在每个位点有 1 个（纯合子）或 2 个（杂合子）等位基因。对峰型来说，完美的峰型呈现为单一独立的峰，如图 2-3 中的两个位点。但实践中往往会出现簇状的峰，如图 2-4 中蓝峰和图 2-5 中三种颜色的峰
图 2-3 位点 MpSSR012（蓝）和 MpSSR031（绿）的峰图Fig. 2-3 Visualized Peaks on Locus MpSSR012 (blue) and MpSSR031 (green)
【参考文献】：
期刊论文
[1]斑节对虾形态性状对体质量影响的分析[J]. 孙苗苗,陈百尧,杨其彬,江世贵,周发林,苏天凤,黄建华. 海洋科学. 2013(05)
[2]微卫星标记中的无效等位基因[J]. 文亚峰,Kentaro Uchiyama,韩文军,Saneyoshi Ueno,谢伟东,徐刚标,Yoshihiko Tsumura. 生物多样性. 2013(01)
[3]脊尾白虾形态性状对体重的相关性及通径分析[J]. 李洋,刘萍,李健,高保全. 渔业科学进展. 2012(06)
[4]用微卫星标记分析不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性[J]. 何永琴,苏永全,毛勇,王军. 水产学报. 2012(10)
[5]中国对虾微卫星四重PCR技术的建立及其在模拟放流效果评估方面的应用[J]. 李伟亚,王伟继,孔杰,金显仕,阮晓红,罗坤. 海洋学报(中文版). 2012(05)
[6]利用微卫星标记进行6个建鲤家系遗传结构分析和家系鉴定[J]. 李建林,唐永凯,李红霞,俞菊华. 江苏农业学报. 2012(04)
[7]筛选杂交鲤亲子鉴定的微卫星标记(英文)[J]. 武耀,贾智英,李池陶,葛会争,石连玉. 农业生物技术学报. 2012(05)
[8]fSSR分析技术的建立及在大黄鱼（Larimichthys crocea）亲子鉴定中的应用[J]. 武祥伟,刘贤德,王志勇. 海洋通报. 2011(04)
[9]不同地理群体日本囊对虾遗传多样性微卫星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,刘堃. 水产科学. 2011(07)
[10]三个野生群体日本囊对虾遗传多样性的SSR分析[J]. 郭慧,申玉春. 生物技术通报. 2011(03)
博士论文
[1]微卫星标记辅助黄金鲈生长性状数量遗传与育种技术研究[D]. 曹小娟.华中农业大学 2011
[2]大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 叶华.湖南农业大学 2010
[3]中国明对虾和日本囊对虾遗传多样性及对虾科系统学初步研究[D]. 李玉龙.中国海洋大学 2009
[4]日本囊对虾基因组串联重复序列分析及微卫星标记的开发与应用[D]. 栾生.中国海洋大学 2006
[5]形态标记与微卫星标记在中国对虾遗传选育中的应用研究[D]. 董世瑞.中国海洋大学 2006
硕士论文
[1]凡纳滨对虾引进群体分子系谱构建及中国对虾分子标志家系放流效果评估[D]. 张凯.中国海洋大学 2013
[2]利用分子标记评估中国对虾放流效果研究[D]. 李伟亚.上海海洋大学 2012
[3]日本囊对虾遗传多样性的AFLP和SSR分析[D]. 郭慧.广东海洋大学 2011
[4]中国东南沿海日本囊对虾群体遗传学的研究[D]. 赵斌丽.集美大学 2008
[5]三个STR基因座荧光标记复合扩增的研究及其法医学应用[D]. 刘志勇.四川大学 2006
本文编号：3346039
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2-1日本对虾基因组DNA电泳图
图2-1 日本对虾基因组DNA电泳图Fig. 2-1 Electrophoretogra for Genomes DNA of Masupenaeus japonicas图2-2 日本对虾基因组DNA的分光光度计检测结果图Fig. 2-2 Map Result of Genomes DNA of Masupenaeus japonicas by Spectrophotometry3.2 8 个微卫星位点扩增结果及多态性本研究通过读取 8 个微卫星位点的峰图（图 2-3，图 2-4 和图 2-5）来实现基因分型，每个峰簇代表 1 个等位基因。日本对虾是 2 倍体生物，对 1 个正常个体来说，在每个位点有 1 个（纯合子）或 2 个（杂合子）等位基因。对峰型来说，完美的峰型呈现为单一独立的峰，如图 2-3 中的两个位点。但实践中往往会出现簇状的峰，如图 2-4 中蓝峰和图 2-5 中三种颜色的峰
图 2-3 位点 MpSSR012（蓝）和 MpSSR031（绿）的峰图Fig. 2-3 Visualized Peaks on Locus MpSSR012 (blue) and MpSSR031 (green)
【参考文献】：
期刊论文
[1]斑节对虾形态性状对体质量影响的分析[J]. 孙苗苗,陈百尧,杨其彬,江世贵,周发林,苏天凤,黄建华. 海洋科学. 2013(05)
[2]微卫星标记中的无效等位基因[J]. 文亚峰,Kentaro Uchiyama,韩文军,Saneyoshi Ueno,谢伟东,徐刚标,Yoshihiko Tsumura. 生物多样性. 2013(01)
[3]脊尾白虾形态性状对体重的相关性及通径分析[J]. 李洋,刘萍,李健,高保全. 渔业科学进展. 2012(06)
[4]用微卫星标记分析不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性[J]. 何永琴,苏永全,毛勇,王军. 水产学报. 2012(10)
[5]中国对虾微卫星四重PCR技术的建立及其在模拟放流效果评估方面的应用[J]. 李伟亚,王伟继,孔杰,金显仕,阮晓红,罗坤. 海洋学报(中文版). 2012(05)
[6]利用微卫星标记进行6个建鲤家系遗传结构分析和家系鉴定[J]. 李建林,唐永凯,李红霞,俞菊华. 江苏农业学报. 2012(04)
[7]筛选杂交鲤亲子鉴定的微卫星标记(英文)[J]. 武耀,贾智英,李池陶,葛会争,石连玉. 农业生物技术学报. 2012(05)
[8]fSSR分析技术的建立及在大黄鱼（Larimichthys crocea）亲子鉴定中的应用[J]. 武祥伟,刘贤德,王志勇. 海洋通报. 2011(04)
[9]不同地理群体日本囊对虾遗传多样性微卫星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,刘堃. 水产科学. 2011(07)
[10]三个野生群体日本囊对虾遗传多样性的SSR分析[J]. 郭慧,申玉春. 生物技术通报. 2011(03)
博士论文
[1]微卫星标记辅助黄金鲈生长性状数量遗传与育种技术研究[D]. 曹小娟.华中农业大学 2011
[2]大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 叶华.湖南农业大学 2010
[3]中国明对虾和日本囊对虾遗传多样性及对虾科系统学初步研究[D]. 李玉龙.中国海洋大学 2009
[4]日本囊对虾基因组串联重复序列分析及微卫星标记的开发与应用[D]. 栾生.中国海洋大学 2006
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硕士论文
[1]凡纳滨对虾引进群体分子系谱构建及中国对虾分子标志家系放流效果评估[D]. 张凯.中国海洋大学 2013
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[4]中国东南沿海日本囊对虾群体遗传学的研究[D]. 赵斌丽.集美大学 2008
[5]三个STR基因座荧光标记复合扩增的研究及其法医学应用[D]. 刘志勇.四川大学 2006
本文编号：3346039
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