基于DArT技术的大黄鱼生长相关分子标记筛选
发布时间：2021-08-29 22:58
大黄鱼（Larimichthys crocea，Large yellow croaker）是我国主要的海产经济鱼类。主要产于我国浙江、福建、广东沿海。近二十年来，由于过度捕捞，野生大黄鱼在我国频临绝迹。为了保护大黄鱼鱼种质资源和满足消费者需求，大黄鱼人工养殖活动逐渐展开。因多年未加选育的累代养殖，养殖大黄鱼生长缓慢，性早熟、免疫力低下，等，因此急需对养殖大黄鱼进行遗传改良。然而，大黄鱼经济性状，如生长、性别决定、抗病力、和抗逆性等大多数表现为数量性状。传统选育方法是依据表型进行选择，周期长、效率低，因此需利用分子标记技术从基因型层面，筛选与经济性状相关分子标记，辅助选育，以提高育种效率。其中生长作为重要的经济性状之一，可直接降低养殖成本和劳动力投入，有助于经济效益的提高。本研究构建了大黄鱼基因组文库，并采用分离群体分组分析法结合DArT技术筛选生长相关的特异性标记。主要研究结果如下：以“东海1号”为实验材料，测量了199个个体的体长，最大值为16.30cm、最小值为11.50cm，均值为13.45cm，标准偏差1.3367，峰度为0.192，偏度为-0.210，Shapiro-Will...
【文章来源】：宁波大学浙江省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
大黄鱼体长正态分布频率直方图
x816 12.00 x827 16.302.2 大黄鱼基因组 DNA 提取CTAB法提取的大黄鱼基因组DNA的1%琼脂糖电泳检测结果见图2.1。结果显示基因组DNA大小在10kb以上，无拖尾现象，DNA未降解且无蛋白质与RNA残留。使用紫外分光光度计检测，所提取的基因组DNA的OD260/OD280约在1.79~2.12之间，由此说明DNA质量较高，符合后续实验要求。图2.1 基因组DNA 电泳图Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DNAM：1kb Marker；1~3：极端大群体 DNA；4~6：极端小群体 DNAM:1Kb Marker; 1 3:extreme big group DNA; 4~ 6:extreme small group DNA2.3 大黄鱼基因组 DNA 的酶切大黄鱼混合的基因组DNA，7种降低基因组复杂性方法（PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI）的酶切带型见图2.2，各组酶切均未出现条带酶切效果较完全。其分子量在0.25-10kb之间。图2.2 基因组酶切图Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM：1kb Marker；1：PstI/AluI；2：
2.3 大黄鱼基因组 DNA 的酶切大黄鱼混合的基因组DNA，7种降低基因组复杂性方法（PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI）的酶切带型见图2.2，各组酶切均未出现条带酶切效果较完全。其分子量在0.25-10kb之间。图2.2 基因组酶切图Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM：1kb Marker；1：PstI/AluI；2：PstI/BanII；3：PstI/Bsp1286I；4：PstI/BstNI；5：PstI/HaeIII ；6：PstI/RsaI；7：PstI/TaqIM：1kb Marker；1：PstI/AluI；2：PstI/BanII；3：PstI/Bsp1286I；4：PstI/BstNI；5：PstI/HaeIII ；6：PstI/RsaI；7：PstI/TaqI
【参考文献】：
期刊论文
[1]大黄鱼快长相关微卫星标记的筛选与验证[J]. 刘贤德,隋班良,王志勇,蔡明夷. 水生生物学报. 2013(06)
[2]非编码DNA序列的功能及其鉴定[J]. 秦丹,徐存拴. 遗传. 2013(11)
[3]大黄鱼（Larimichthys crocea）Ⅰ型干扰素基因的特征与表达分析[J]. 李婵,姚翠鸾. 海洋与湖沼. 2013(02)
[4]黄姑鱼♀与大黄鱼♂杂交试验与AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,刘颖,王志勇. 集美大学学报(自然科学版). 2012(04)
[5]水产动物重要经济性状的分子基础及其遗传改良[J]. 桂建芳,朱作言. 科学通报. 2012(19)
[6]Molecular basis and genetic improvement of economically important traits in aquaculture animals[J]. GUI JianFang* & ZHU ZuoYan State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China. Chinese Science Bulletin. 2012(15)
[7]大黄鱼（Larimichthys crocea）IGF-Ⅰ基因的克隆及序列分析[J]. 常抗美,郑孝亮,刘慧慧,张建设,吴常文. 海洋与湖沼. 2012(01)
[8]中国重要海洋动物遗传多样性的研究进展[J]. 崔朝霞,张峘,宋林生,尤锋. 生物多样性. 2011(06)
[9]全基因组关联研究中的交互作用研究现状[J]. 李放歌,王志鹏,户国,李辉. 遗传. 2011(09)
[10]大黄鱼性腺线性化cDNA文库的构建及生殖免疫相关基因的筛选[J]. 陈芸,周鹏,张子平,王艺磊. 生物技术通报. 2011(07)
博士论文
[1]大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 叶华.湖南农业大学 2010
[2]基于生物芯片标记技术的五种濒危冷杉保护遗传学研究[D]. 饶龙兵.中国林业科学研究院 2009
硕士论文
[1]大黄鱼三种胃肠肽基因的克隆及表达特性研究[D]. 崔文涛.浙江海洋学院 2013
[2]大黄鱼Follisatin基因克隆及表达分析[D]. 刘小飞.宁波大学 2012
[3]白菜类作物DArT标记体系的建立[D]. 冯艳丽.中国农业科学院 2009
[4]大黄鱼遗传连锁图谱的构建[D]. 宁岳.集美大学 2007
本文编号：3371535
【文章来源】：宁波大学浙江省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
大黄鱼体长正态分布频率直方图
x816 12.00 x827 16.302.2 大黄鱼基因组 DNA 提取CTAB法提取的大黄鱼基因组DNA的1%琼脂糖电泳检测结果见图2.1。结果显示基因组DNA大小在10kb以上，无拖尾现象，DNA未降解且无蛋白质与RNA残留。使用紫外分光光度计检测，所提取的基因组DNA的OD260/OD280约在1.79~2.12之间，由此说明DNA质量较高，符合后续实验要求。图2.1 基因组DNA 电泳图Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DNAM：1kb Marker；1~3：极端大群体 DNA；4~6：极端小群体 DNAM:1Kb Marker; 1 3:extreme big group DNA; 4~ 6:extreme small group DNA2.3 大黄鱼基因组 DNA 的酶切大黄鱼混合的基因组DNA，7种降低基因组复杂性方法（PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI）的酶切带型见图2.2，各组酶切均未出现条带酶切效果较完全。其分子量在0.25-10kb之间。图2.2 基因组酶切图Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM：1kb Marker；1：PstI/AluI；2：
2.3 大黄鱼基因组 DNA 的酶切大黄鱼混合的基因组DNA，7种降低基因组复杂性方法（PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI）的酶切带型见图2.2，各组酶切均未出现条带酶切效果较完全。其分子量在0.25-10kb之间。图2.2 基因组酶切图Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM：1kb Marker；1：PstI/AluI；2：PstI/BanII；3：PstI/Bsp1286I；4：PstI/BstNI；5：PstI/HaeIII ；6：PstI/RsaI；7：PstI/TaqIM：1kb Marker；1：PstI/AluI；2：PstI/BanII；3：PstI/Bsp1286I；4：PstI/BstNI；5：PstI/HaeIII ；6：PstI/RsaI；7：PstI/TaqI
【参考文献】：
期刊论文
[1]大黄鱼快长相关微卫星标记的筛选与验证[J]. 刘贤德,隋班良,王志勇,蔡明夷. 水生生物学报. 2013(06)
[2]非编码DNA序列的功能及其鉴定[J]. 秦丹,徐存拴. 遗传. 2013(11)
[3]大黄鱼（Larimichthys crocea）Ⅰ型干扰素基因的特征与表达分析[J]. 李婵,姚翠鸾. 海洋与湖沼. 2013(02)
[4]黄姑鱼♀与大黄鱼♂杂交试验与AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,刘颖,王志勇. 集美大学学报(自然科学版). 2012(04)
[5]水产动物重要经济性状的分子基础及其遗传改良[J]. 桂建芳,朱作言. 科学通报. 2012(19)
[6]Molecular basis and genetic improvement of economically important traits in aquaculture animals[J]. GUI JianFang* & ZHU ZuoYan State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China. Chinese Science Bulletin. 2012(15)
[7]大黄鱼（Larimichthys crocea）IGF-Ⅰ基因的克隆及序列分析[J]. 常抗美,郑孝亮,刘慧慧,张建设,吴常文. 海洋与湖沼. 2012(01)
[8]中国重要海洋动物遗传多样性的研究进展[J]. 崔朝霞,张峘,宋林生,尤锋. 生物多样性. 2011(06)
[9]全基因组关联研究中的交互作用研究现状[J]. 李放歌,王志鹏,户国,李辉. 遗传. 2011(09)
[10]大黄鱼性腺线性化cDNA文库的构建及生殖免疫相关基因的筛选[J]. 陈芸,周鹏,张子平,王艺磊. 生物技术通报. 2011(07)
博士论文
[1]大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 叶华.湖南农业大学 2010
[2]基于生物芯片标记技术的五种濒危冷杉保护遗传学研究[D]. 饶龙兵.中国林业科学研究院 2009
硕士论文
[1]大黄鱼三种胃肠肽基因的克隆及表达特性研究[D]. 崔文涛.浙江海洋学院 2013
[2]大黄鱼Follisatin基因克隆及表达分析[D]. 刘小飞.宁波大学 2012
[3]白菜类作物DArT标记体系的建立[D]. 冯艳丽.中国农业科学院 2009
[4]大黄鱼遗传连锁图谱的构建[D]. 宁岳.集美大学 2007
本文编号：3371535
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