安徽省淮河水系短颌鲚群体遗传多样性
发布时间：2021-09-04 02:45
短颌鲚（Coilia brachygnathus）是一种小型经济鱼类,同时也是大型肉食性鱼类和江豚（Neophocaena phocaenoides）的饵料,在食物链中占据重要地位,受过度捕捞、环境污染以及栖息地破坏等多种因素的影响,短颌鲚野生资源面临严重威胁。目前有关淮河短颌鲚遗传资源的数据仍然缺乏。本研究采用微卫星分子标记对安徽省淮河水系短颌鲚5个群体进行遗传多样性分析。结果显示,10个微卫星位点在所有短颌鲚样本中均具有高度多态性,多态信息含量（PIC）0.852～0.942;5个短颌鲚群体均显示出较高的遗传多样性水平,期望杂合度He为0.879～0.903,多态信息含量（PIC）0.851～0.881。分子方差分析（AMOVA）显示,大多数遗传变异存在于群体内（97.88%）,群体间的遗传变异仅为2.12%。5个群体遗传分化水平较低(Fst <0.05),其中,遗传分化系数最小的是浍河和颍河群体(Fst=0.004)且二者间遗传距离最近（Da=0.161）;遗传分化系数最大的是凤台和王家...
【文章来源】：动物学杂志. 2020,55(06)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
安徽省淮河水系5个短颌鲚群体的采样地点
基于Nei’s遗传距离用UPGMA法构建5个短颌鲚群体的系统发育树，5个群体具有共同的祖先型，宿州浍河和阜阳颍河短颌鲚群体最先聚类为一支，然后分别与怀远群体和阜南王家坝群体聚类，最后与凤台淮河峡山口段短颌鲚聚在一起，表明凤台短颌鲚群体与其他4个群体间遗传距离较远（图2）。Structure分析，K=3是比较理想的种群亚型类群数目，即5个短颌鲚群体最可能划分为3个不同的组群（图3），图中不同颜色分别代表不同的组群，其中浍河群体、怀远群体、颍河群体及王家坝群体遗传背景整体趋于一致，而与凤台群体遗传差异较大。
根据微卫星位点的等位基因频率，基于IAM、TPM和SMM3种不同的假设，对5个短颌鲚群体进行检验（表5）。在IAM模型假设下，凤台群体在Sign检验中呈现极显著的杂合度过剩（P<0.01),Wilcoxon检验的双尾检测结果显示除浍河群体外，其他4个群体均表现出极显著的杂合度过剩（P<0.01）；在TPM模型假设下，怀远群体和凤台群体在Sign检验中呈现显著的杂合度过剩（P<0.05），且Wilcoxon检验的双尾检测均表现出显著水平（P<0.05）；在SMM模型假设下，凤台群体在Sign检验中呈现极显著的杂合度缺失（P<0.01），凤台群体和浍河群体在Wilcoxon检验的双尾检测中均表现出显著水平（P<0.05）。3 讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]安徽省草鱼养殖群体遗传多样性及遗传结构分析[J]. 汪焕,江河,段国庆,周华兴,胡玉婷,凌俊,潘庭双,陈小雷. 安徽农业大学学报. 2020(01)
[2]湖栖鳍虾虎鱼微卫星DNA标记的开发与群体遗传多样性分析[J]. 黄承勤,黄英毅,黄欣,王中铎,郭昱嵩. 动物学杂志. 2020(01)
[3]基于线粒体ND2基因序列的少鳞鱚遗传多样性研究[J]. 郑德育,郭易佳,杨天燕,高天翔,郑瑶,袁冬皓,斯舒谨. 南方水产科学. 2019(05)
[4]长江刀鲚选育和野生群体遗传多样性的微卫星分析[J]. 于爱清,施永海,邓平平. 水产科技情报. 2019(03)
[5]基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析[J]. 李大命,张彤晴,唐晟凯,关浩勇,刘燕山,穆欢,黄越峰,潘建林. 江苏农业科学. 2018(20)
[6]淮河源区群体遗传多样性研究[J]. 方冬冬,顾钱洪,周传江,孟晓林,李学军,聂国兴. 水产科学. 2018(05)
[7]长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析[J]. 王旭歌,何勇凤,吴兴兵,杨德国. 动物学杂志. 2018(01)
[8]基于耳石微化学的长江靖江段长颌鲚与短颌鲚生境履历重建[J]. 陈婷婷,姜涛,卢明杰,刘洪波,杨健. 湖泊科学. 2016(01)
[9]长江短颌鲚耳石Sr/Ca值变化特征及其江海洄游履历[J]. 徐钢春,顾若波,刘洪波,姜涛,杜富宽,聂志娟,杨健,徐跑. 水产学报. 2014(07)
[10]中国5个矮马品种的瓶颈效应分析[J]. 杨胜林,徐龙鑫,杨海兵,李爱萍. 中国畜牧兽医. 2013(01)
博士论文
[1]淮河水系的形成与演变研究[D]. 吴梅.中国地质大学(北京) 2013
本文编号：3382398
【文章来源】：动物学杂志. 2020,55(06)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
安徽省淮河水系5个短颌鲚群体的采样地点
基于Nei’s遗传距离用UPGMA法构建5个短颌鲚群体的系统发育树，5个群体具有共同的祖先型，宿州浍河和阜阳颍河短颌鲚群体最先聚类为一支，然后分别与怀远群体和阜南王家坝群体聚类，最后与凤台淮河峡山口段短颌鲚聚在一起，表明凤台短颌鲚群体与其他4个群体间遗传距离较远（图2）。Structure分析，K=3是比较理想的种群亚型类群数目，即5个短颌鲚群体最可能划分为3个不同的组群（图3），图中不同颜色分别代表不同的组群，其中浍河群体、怀远群体、颍河群体及王家坝群体遗传背景整体趋于一致，而与凤台群体遗传差异较大。
根据微卫星位点的等位基因频率，基于IAM、TPM和SMM3种不同的假设，对5个短颌鲚群体进行检验（表5）。在IAM模型假设下，凤台群体在Sign检验中呈现极显著的杂合度过剩（P<0.01),Wilcoxon检验的双尾检测结果显示除浍河群体外，其他4个群体均表现出极显著的杂合度过剩（P<0.01）；在TPM模型假设下，怀远群体和凤台群体在Sign检验中呈现显著的杂合度过剩（P<0.05），且Wilcoxon检验的双尾检测均表现出显著水平（P<0.05）；在SMM模型假设下，凤台群体在Sign检验中呈现极显著的杂合度缺失（P<0.01），凤台群体和浍河群体在Wilcoxon检验的双尾检测中均表现出显著水平（P<0.05）。3 讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]安徽省草鱼养殖群体遗传多样性及遗传结构分析[J]. 汪焕,江河,段国庆,周华兴,胡玉婷,凌俊,潘庭双,陈小雷. 安徽农业大学学报. 2020(01)
[2]湖栖鳍虾虎鱼微卫星DNA标记的开发与群体遗传多样性分析[J]. 黄承勤,黄英毅,黄欣,王中铎,郭昱嵩. 动物学杂志. 2020(01)
[3]基于线粒体ND2基因序列的少鳞鱚遗传多样性研究[J]. 郑德育,郭易佳,杨天燕,高天翔,郑瑶,袁冬皓,斯舒谨. 南方水产科学. 2019(05)
[4]长江刀鲚选育和野生群体遗传多样性的微卫星分析[J]. 于爱清,施永海,邓平平. 水产科技情报. 2019(03)
[5]基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析[J]. 李大命,张彤晴,唐晟凯,关浩勇,刘燕山,穆欢,黄越峰,潘建林. 江苏农业科学. 2018(20)
[6]淮河源区群体遗传多样性研究[J]. 方冬冬,顾钱洪,周传江,孟晓林,李学军,聂国兴. 水产科学. 2018(05)
[7]长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析[J]. 王旭歌,何勇凤,吴兴兵,杨德国. 动物学杂志. 2018(01)
[8]基于耳石微化学的长江靖江段长颌鲚与短颌鲚生境履历重建[J]. 陈婷婷,姜涛,卢明杰,刘洪波,杨健. 湖泊科学. 2016(01)
[9]长江短颌鲚耳石Sr/Ca值变化特征及其江海洄游履历[J]. 徐钢春,顾若波,刘洪波,姜涛,杜富宽,聂志娟,杨健,徐跑. 水产学报. 2014(07)
[10]中国5个矮马品种的瓶颈效应分析[J]. 杨胜林,徐龙鑫,杨海兵,李爱萍. 中国畜牧兽医. 2013(01)
博士论文
[1]淮河水系的形成与演变研究[D]. 吴梅.中国地质大学(北京) 2013
本文编号：3382398
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3382398.html
