鲳属鱼类的线粒体基因组演化及银鲳的遗传多样性分析
发布时间：2021-09-06 13:16
银鲳（Pampus argenteus）在中国各大海域（南海、东海、黄海及渤海）沿岸都广泛分布,但是随着捕捞量的逐年增加,消费需求的急剧增长,环境污染的不断恶化,银鲳野生资源量不断减少,可捕捞量呈显著下降的趋势。本研究测定和分析了银鲳的线粒体全基因组和鲳属鱼类的线粒体全基因组,开发了银鲳26个多态微卫星标记,从中我们筛选了15个多态微卫星标记分析中国沿海8个银鲳群体的遗传多样性。通过分析银鲳的线粒体全基因组结构和种群遗传多样性,可以更好的认识银鲳物种的进化潜力、种群遗传状况,为银鲳资源的保护和合理开发提供有力的理论支持,促进银鲳资源的可持续发展。1.银鲳线粒体全基因序列的测定和结构分析应用PCR直接测序的方法获得了银鲳（Pampus argenteus）的线粒体全基因组序列,银鲳线粒体全基因组序列全长为17098bp,主要包括2个非编码区（OL区和D-loop区）,2个r RNA基因,23个t RNA基因和13个蛋白质编码基因。全基因组的碱基含量为A 30.35%,C 25.55%,G 15.28%,T 28.82%,并且A+T为59.17%,存在明显的AT偏好性。大都数基因都位于重链...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
银鲳采集位置
2.2 结果与分析2.2.1 PCR 结果利用上述设计的 17 对引物成功扩增出了所需要的目的条带（电泳结果见图2-2）。对比发现 PCR 产物的分子量大小与引物设计的一致，且没有杂带、条带特异，可直接测序。
图 2-3 银鲳线粒体基因组结构图Fig.2-3 Organization in the mitochondrial genome of Pampus argenteus2.2.3 碱基组成特点
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国鲳属鱼类一新种（鲈形目,鲳科）（英文）[J]. 刘静,李春生. 动物分类学报. 2013(04)
[2]基于线粒体Cyt b基因的黄海南部和东海银鲳群体遗传结构分析[J]. 赵峰,庄平,章龙珍,施兆鸿. 水生生物学报. 2011(05)
[3]PCR引物设计方法综述[J]. 尤超,赵大球,梁乘榜,周春华. 现代农业科技. 2011(17)
[4]黑尾地鸦线粒体基因组序列测定与分析[J]. 柯杨,黄原,雷富民. 遗传. 2010(09)
[5]根据mtDNAD-loop序列分析东海银鲳群体遗传多样性[J]. 彭士明,施兆鸿,陈超,侯俊利. 海洋科学. 2010(02)
[6]基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性[J]. 彭士明,施兆鸿,侯俊利. 水产学报. 2010(01)
[7]我国鲳属鱼类养殖的发展潜力及前景展望[J]. 施兆鸿,彭士明,孙鹏,尹飞. 现代渔业信息. 2009(10)
[8]银鲳3个野生群体线粒体COⅠ基因的序列差异分析[J]. 彭士明,施兆鸿,侯俊利,张浩,赵峰. 上海海洋大学学报. 2009(04)
[9]银鲳4个地理种群遗传多样性的初步研究[J]. 孟彦羽,章龙珍,赵峰,施兆鸿,庄平. 海洋渔业. 2009(01)
[10]人工育苗条件下银鲳仔稚幼鱼摄食与生长特性[J]. 施兆鸿,马凌波,高露姣,于宏,柳敏海,陈波,傅荣兵. 海洋水产研究. 2007(04)
硕士论文
[1]银鲳微卫星标记开发及群体遗传结构分析[D]. 秦玉.浙江海洋学院 2013
[2]棘胸蛙线粒体基因组全序列的测序与分析[D]. 周妍.浙江师范大学 2009
[3]鳜鱼微卫星标记的开发及遗传多样性研究[D]. 匡刚桥.湖南农业大学 2007
本文编号：3387528
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
银鲳采集位置
2.2 结果与分析2.2.1 PCR 结果利用上述设计的 17 对引物成功扩增出了所需要的目的条带（电泳结果见图2-2）。对比发现 PCR 产物的分子量大小与引物设计的一致，且没有杂带、条带特异，可直接测序。
图 2-3 银鲳线粒体基因组结构图Fig.2-3 Organization in the mitochondrial genome of Pampus argenteus2.2.3 碱基组成特点
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国鲳属鱼类一新种（鲈形目,鲳科）（英文）[J]. 刘静,李春生. 动物分类学报. 2013(04)
[2]基于线粒体Cyt b基因的黄海南部和东海银鲳群体遗传结构分析[J]. 赵峰,庄平,章龙珍,施兆鸿. 水生生物学报. 2011(05)
[3]PCR引物设计方法综述[J]. 尤超,赵大球,梁乘榜,周春华. 现代农业科技. 2011(17)
[4]黑尾地鸦线粒体基因组序列测定与分析[J]. 柯杨,黄原,雷富民. 遗传. 2010(09)
[5]根据mtDNAD-loop序列分析东海银鲳群体遗传多样性[J]. 彭士明,施兆鸿,陈超,侯俊利. 海洋科学. 2010(02)
[6]基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性[J]. 彭士明,施兆鸿,侯俊利. 水产学报. 2010(01)
[7]我国鲳属鱼类养殖的发展潜力及前景展望[J]. 施兆鸿,彭士明,孙鹏,尹飞. 现代渔业信息. 2009(10)
[8]银鲳3个野生群体线粒体COⅠ基因的序列差异分析[J]. 彭士明,施兆鸿,侯俊利,张浩,赵峰. 上海海洋大学学报. 2009(04)
[9]银鲳4个地理种群遗传多样性的初步研究[J]. 孟彦羽,章龙珍,赵峰,施兆鸿,庄平. 海洋渔业. 2009(01)
[10]人工育苗条件下银鲳仔稚幼鱼摄食与生长特性[J]. 施兆鸿,马凌波,高露姣,于宏,柳敏海,陈波,傅荣兵. 海洋水产研究. 2007(04)
硕士论文
[1]银鲳微卫星标记开发及群体遗传结构分析[D]. 秦玉.浙江海洋学院 2013
[2]棘胸蛙线粒体基因组全序列的测序与分析[D]. 周妍.浙江师范大学 2009
[3]鳜鱼微卫星标记的开发及遗传多样性研究[D]. 匡刚桥.湖南农业大学 2007
本文编号：3387528
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