海带（Saccharina japonica）褐藻胶合成途径若干基因的克
发布时间：2021-10-08 11:56
褐藻胶作为褐藻细胞壁的特征性组分，具有多种生物活性，广泛应用于食品、医药和纺织等多个行业。相对假单胞菌属和固氮菌属微生物而言，褐藻的褐藻胶生物合成途径尚不明确，研究其合成通路基因的结构与功能，不仅对于研究褐藻纲的系统进化具有重要的科学意义，同时也将为分子辅助育种、基因工程等研究提供必要的功能基因研究基础。本论文利用生物信息学方法，对“国际千种植物转录组计划”数据库和海带基因组数据库进行检索和注释，对褐藻胶生物胶合成途径的基因（PMI、PMM、MPG、algD和algG）进行了候选基因的同源性、结构域、三维结构等分析，初步完成了对其基因功能的预测，基本构建完成了海带等的褐藻胶生物合成途径；通过研究褐藻胶合成途径基因的拷贝数变化、多基因家族特殊的基因排布方式以及基因的系统进化关系等，探讨了藻类褐藻胶合成通路基因的进化起源和多基因家族的适应性变异和演化过程。结果显示：海带等褐藻的褐藻胶合成途径与微生物基本一致，但其第一步反应（可逆性催化甘露糖-6-磷酸和果糖-6-磷酸之间的相互转化）和第三步反应（可逆性催化甘露糖-1-磷酸和GDP-甘露糖之间的相互转化）的酶则由Type I类型双功能PMI基...
【文章来源】：中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：136 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
海带的生活史（实验室资料）
图 1-3 藻类中褐藻胶生物合成通路简图Fig. 1-3 Schematic representation of the alginate biosynthesis pathway in the brown algae3.3 褐藻胶合成通路关键基因研究概况3.3.1 磷酸甘露糖异构酶（PMI）研究概况（1）磷酸甘露糖异构酶（PMI）功能磷酸甘露糖异构酶（Phosphomannose isomerase；PMI；EC 5.3.1.8）是一种依赖于金属离子发挥作用的酶，在生物体中可逆性催化甘露糖-6-磷酸（M-6-P）和果糖-6-磷酸（F-6-P）之间的相互转化（Cleasby et al., 1996；Jensen et al., 1998），是甘露醇代谢和褐藻胶合成过程中的起到关键作用的酶（Roux et al., 2007; Pindeet al., 1975; Wills et al., 2001）。同时 PMI 通过果糖-6-磷酸与甘露糖-6-磷酸的互相转化将葡萄糖代谢和 TCA 循环与甘露糖代谢关联在一起。磷酸甘露糖异构酶 PMI 是褐藻胶合成过程中的第一个发挥作用的酶，对于
24图 2-1 PMI 基因氨基酸序列比对Fig. 2-1 Multiple sequence alignments of PMI amino sequences注：Conserved Domain I 和 Conserved Domain II 代表 PMI 基因的保守区域2.2.4 三维结构预测在线分析软件 SWISS-MODEL 依据同源建模原理来进行蛋白质三维结构预
【参考文献】：
期刊论文
[1]藻类磷酸甘露糖异构酶基因的序列结构特点及系统进化分析[J]. 张亚兰,王绪敏,王大鹏,夏艳,刘涛,池姗. 海洋湖沼通报. 2013(01)
[2]一种适合于红藻的总RNA提取方法[J]. 李天勇,任磊,周冠,刘翠,迟珊,刘涛. 海洋湖沼通报. 2012(04)
[3]海带遗传改良技术现状及发展趋势[J]. 刘涛,赵翠,池姗,冯荣芳,崔秋红,刘翠. 中国农业科技导报. 2011(05)
[4]系统发生分析程序MrBayes 3.1使用方法介绍[J]. 王勇,陈克平,姚勤. 安徽农业科学. 2009(33)
[5]PAGE在海洋酸性寡糖分析中的应用[J]. 于广利,迟连利,管华诗,李桂玲,陈娥功,蒋新. 中国海洋药物. 2001(03)
[6]海藻多糖及其生物活性[J]. 徐明芳,高孔荣,刘婉乔. 水产科学. 1996(06)
[7]褐藻胶的生物合成途径与细胞学研究[J]. 严小军. 海洋科学. 1993(06)
[8]海带和马尾藻中褐藻胶的糖醛酸组成与序列结构的研究[J]. 郑乃余,张燕霞,范晓. 海洋与湖沼. 1992(04)
博士论文
[1]杂交海带培育与应用研究[D]. 李晓捷.中国海洋大学 2008
硕士论文
[1]海带EST-SSR标记开发及TPS基因的克隆和比较遗传学研究[D]. 王国良.中国海洋大学 2010
本文编号：3424113
【文章来源】：中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：136 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
海带的生活史（实验室资料）
图 1-3 藻类中褐藻胶生物合成通路简图Fig. 1-3 Schematic representation of the alginate biosynthesis pathway in the brown algae3.3 褐藻胶合成通路关键基因研究概况3.3.1 磷酸甘露糖异构酶（PMI）研究概况（1）磷酸甘露糖异构酶（PMI）功能磷酸甘露糖异构酶（Phosphomannose isomerase；PMI；EC 5.3.1.8）是一种依赖于金属离子发挥作用的酶，在生物体中可逆性催化甘露糖-6-磷酸（M-6-P）和果糖-6-磷酸（F-6-P）之间的相互转化（Cleasby et al., 1996；Jensen et al., 1998），是甘露醇代谢和褐藻胶合成过程中的起到关键作用的酶（Roux et al., 2007; Pindeet al., 1975; Wills et al., 2001）。同时 PMI 通过果糖-6-磷酸与甘露糖-6-磷酸的互相转化将葡萄糖代谢和 TCA 循环与甘露糖代谢关联在一起。磷酸甘露糖异构酶 PMI 是褐藻胶合成过程中的第一个发挥作用的酶，对于
24图 2-1 PMI 基因氨基酸序列比对Fig. 2-1 Multiple sequence alignments of PMI amino sequences注：Conserved Domain I 和 Conserved Domain II 代表 PMI 基因的保守区域2.2.4 三维结构预测在线分析软件 SWISS-MODEL 依据同源建模原理来进行蛋白质三维结构预
【参考文献】：
期刊论文
[1]藻类磷酸甘露糖异构酶基因的序列结构特点及系统进化分析[J]. 张亚兰,王绪敏,王大鹏,夏艳,刘涛,池姗. 海洋湖沼通报. 2013(01)
[2]一种适合于红藻的总RNA提取方法[J]. 李天勇,任磊,周冠,刘翠,迟珊,刘涛. 海洋湖沼通报. 2012(04)
[3]海带遗传改良技术现状及发展趋势[J]. 刘涛,赵翠,池姗,冯荣芳,崔秋红,刘翠. 中国农业科技导报. 2011(05)
[4]系统发生分析程序MrBayes 3.1使用方法介绍[J]. 王勇,陈克平,姚勤. 安徽农业科学. 2009(33)
[5]PAGE在海洋酸性寡糖分析中的应用[J]. 于广利,迟连利,管华诗,李桂玲,陈娥功,蒋新. 中国海洋药物. 2001(03)
[6]海藻多糖及其生物活性[J]. 徐明芳,高孔荣,刘婉乔. 水产科学. 1996(06)
[7]褐藻胶的生物合成途径与细胞学研究[J]. 严小军. 海洋科学. 1993(06)
[8]海带和马尾藻中褐藻胶的糖醛酸组成与序列结构的研究[J]. 郑乃余,张燕霞,范晓. 海洋与湖沼. 1992(04)
博士论文
[1]杂交海带培育与应用研究[D]. 李晓捷.中国海洋大学 2008
硕士论文
[1]海带EST-SSR标记开发及TPS基因的克隆和比较遗传学研究[D]. 王国良.中国海洋大学 2010
本文编号：3424113
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3424113.html
