新疆额尔齐斯河贝加尔雅罗鱼线粒体基因组分析和遗传多样性研究

发布时间：2021-10-08 22:25

　　贝加尔雅罗鱼（Leuciscus baicalensis）属于硬骨鱼纲（Osteichthyes）幅鳍亚纲（Subclass Neopterygii）骨鳔总目鲤形目（Cypriniformes）鲤科（Cyprinidae）雅罗鱼亚科雅罗鱼属（Leuciscus）。本文以贝加尔雅罗鱼为研究对象,研究了其线粒体基因组,此外,运用DNA条形码技术对不同地点的贝加尔雅罗鱼线粒体DNA的D-Loop进行了遗传分析,分析了它们的多样性。主要结果如下：1.线粒体全基因组研究贝加尔雅罗鱼线粒体基因组全长16606bp,主要包括37个基因（13个蛋白质编码基因,2个rRNA基因,22个tRNA基因）和1个非编码控制区。几乎所有的蛋白质编码都是以ATG开头,除了COX1是以GTG起始的。而终止密码子比较多变,有TAA、TA、T和TAG。全序列的测定为贝加尔雅罗鱼的分类鉴定和遗传学研究提供了理论基础。此外,本文利用贝加尔雅罗鱼和其他共欧美地区、拉丁美洲地区、东亚地区的20种雅罗鱼亚科物种的11个蛋白质编码序列,构建了20种雅罗鱼亚科物种的系统发育树。2.额尔齐斯河贝加尔雅罗鱼遗传多样性研究运用线粒体控制区序... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语表
第一章 文献综述
    1. 额尔齐斯河的自然概况
        1.1 地理位置
        1.2 水系特征
        1.3 额尔齐斯河土著鱼类
    2. 雅罗鱼概述
        2.1 资源量方面研究
        2.2 生物学特性研究进展
        2.3 遗传学方面研究
        2.4 系统发育地位
    3. 线粒体基因组的结构特点
        3.1 大小
        3.2 线粒体遗传系统
        3.3 线粒体结构
        3.4 进化速率
    4. 遗传多样性
        4.1 遗传多样性的内涵
        4.2 遗传多样性的研究方法
    5. 选题的目的与意义
第二章 贝加尔雅罗鱼线粒体全基因组序列
    1. 材料与方法
        1.1 材料
        1.2 DNA提取
        1.3 总DNA检测
        1.4 引物设计和PCR扩增
        1.5 序列拼接和提交
        1.6 线粒体基因组组成分析
        1.7 雅罗鱼亚科鱼类系统学分析
    2 结果与讨论
        2.1 PCR结果
        2.2 贝加尔雅罗鱼线粒体基因组全序列
        2.3 贝加尔雅罗鱼蛋白质编码基因特点
        2.4 贝加尔雅罗鱼tRNA基因特点
        2.5 贝加尔雅罗鱼rRNA基因特点
        2.6 贝加尔雅罗鱼D-Loop区特点
        2.7 雅罗鱼亚科系统发育学研究
第三章 额尔齐斯河贝加尔雅罗鱼遗传多样性研究
    1. 采样与方法
        1.1 材料
        1.2 方法
    2. 结果
        2.1 贝加尔雅罗鱼D-Loop序列
        2.2 贝加尔雅罗鱼遗传多样性分析
        2.3 贝加尔雅罗鱼遗传结构分析
        2.4 贝加尔雅罗鱼种群历史动态
        2.5 贝加尔雅罗鱼群体遗传变异分析
    3. 讨论
        3.1 贝加尔雅罗鱼遗传多样性和遗传结构
        3.2 贝加尔雅罗鱼种群历史动态
        3.3 贝加尔雅罗鱼群体多样性信息在自然保护中的作用
小结
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]加拿大–西北大西洋地区掌形藻的种群遗传结构与动态变化[J]. 李晶晶,张杰,胡自民,段德麟.  生物多样性. 2013(03)
[2]铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性[J]. 袁娟,张其中,李飞,朱成科,罗芬.  水生生物学报. 2010(01)
[3]新疆3种雅罗鱼生长模型的比较研究[J]. 霍堂斌,马波,唐富江,姜作发,蔡林钢,阿达克白克·可尔江,刘立志.  水产学杂志. 2008(02)
[4]新疆额尔齐斯河渔业资源保护与管理的探讨[J]. 朱新英,李政,周波,艾山江.  水产学杂志. 2008(01)
[5]7种重要经济鱼类的ISSR扩增结果分析[J]. 吴兴兵,许璞,张伟明,戴卫平,林建华,许广平,杨家新.  水生生物学报. 2008(03)
[6]长江口邻近水域刀鲚的线粒体控制区序列变异与遗传多样性[J]. 杨金权,胡雪莲,唐文乔,林弘都.  动物学杂志. 2008(01)
[7]闽江和漓江暗鳜mtDNA控制区序列差异分析[J]. 赵丽丽,赵金良,曹阳.  动物学杂志. 2007(01)
[8]鲤科25种鱼类线粒体COⅡ基因序列差异及其系统进化关系[J]. 凌去非,李思发.  水产学报. 2006(06)
[9]青海湖裸鲤繁殖群体线粒体基因组D-loop区序列多态性[J]. 陈大庆,张春霖,鲁成,张信.  中国水产科学. 2006(05)
[10]我国额尔齐斯河流域鱼类资源衰退的原因与对策[J]. 李尽梅.  中国水产. 2006(09)

博士论文
[1]海带线粒体及部分核基因组结构特征研究[D]. 张静.中国海洋大学 2011
[2]长江流域几种重要鱼类的分子标记筛选开发及群体遗传分析[D]. 廖小林.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2006



本文编号：3425083