菲律宾蛤仔C型凝集素免疫功能及分子识别机制的研究
发布时间：2021-10-28 09:18
C型凝集素作为凝集素家族中的主要成员之一,在识别外来微生物表面的碳水化合物基团和激活体液中免疫因子等方面具有重要作用。本论文中采用分子生物学、生物信息学和免疫学等多种技术,对菲律宾蛤仔C型凝集素RpCTL进行了结构和功能的研究,以及LPS注射、低温因子胁迫对C型凝集素的影响,探讨其在菲律宾蛤仔免疫系统中的作用。利用生物学分析6个菲律宾蛤仔C型凝集素基因（CTL-1、CTL-2、CTL-3、CTL-4、CTL-5和CTL-6）,并检测其在健康蛤仔的不同组织中表达分布和低温胁迫下的蛤仔的肝胰腺中的时空表达模式进行分析。结果表明,6个C型凝集素基因开放阅读框长度分别为588bp、408bp、462bp、1017bp、840bp和471bp,且预测分子量范围为15.47-39.28kDa,PI在4.33-6.17之间,推测出这些序列由4-6个外显子、3-6个内含子组成。蛋白质二级结构预测得出这些C型凝集素由3-9个α螺旋、3-9个β链、3-8个线圈组成。对结构域进行预测后发现,除CTL-2和CTL-3外,在CTL-1、CTL-4、CTL-5和CTL-6中鉴定出了信号肽。另外,这些凝集素开放阅读...
【文章来源】：大连海洋大学辽宁省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
菲律宾蛤仔C型凝集素的结构比较
11：使用 Psipred 预测 CTL 的二级结构。粉红色圆柱表示 α 螺旋; 黄色直箭头表示 β 链; 直线表示线圈。右侧SWISS-MODEL 预测二级结构后 CTL 的三级结构。2-3 The secondary structures of CTLs were predicted using Psipred. The pink cylinders demoted alpha helixes; the traight arrows indicated beta strands; the straight lines indicate coils. The tertiary structures of CTLs followed aftersecondary structures were predicted by SWISS-MODEL.
.2 C 型凝集素基因的同源序列比对及进化分析虽然 CTL 基因的基因组结构非常不同，如除 CTL-2 和 CTL-3 外，在 CTL-1、CTLL-5 和 CTL-6 中鉴定出了信号肽，但是他们都被预测出仅具有一个单一的 CRD。而集素家族的几个重要特征在CRD内与其它物种一致。另外CTL-1和CTL-2与其他构一致，都含有 6 个保守半胱氨酸残基，其中四个完全保守的半胱氨酸残基参与硫化物的形成，两个 Ca2+依赖的碳水化合物结合基序 EPN 和 WND 也在结构中发其他物种相同(图 2-4）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]文蛤C型凝集素基因（Mm-Lec1）的克隆与表达分析[J]. 张晶晶,李宏俊,秦艳杰,刘敏,叶晟. 海洋学报. 2016(06)
[2]温度和盐度对华贵栉孔扇贝免疫相关酶的联合效应[J]. 栗志民,钱佳慧,劳翠英,刘志刚. 海洋科学进展. 2015(02)
[3]我国海洋水产养殖的第三次浪潮[J]. 张福绥. 商周刊. 2014(13)
[4]我国海洋贝类的养殖概况与发展问题[J]. 谢玉坎. 科学种养. 2014(02)
[5]温度对贝类免疫系统的影响及其机理研究进展[J]. 许友卿,吴卫君,蒋伟明,丁兆坤. 水产科学. 2012(03)
[6]温度突变对大海马（Hippocampus kuda）幼体生长、组分及酶活力的影响[J]. 孙彬,陈舜,徐永健,戴广谱. 海洋与湖沼. 2012(01)
[7]无脊椎动物先天免疫模式识别受体研究进展[J]. 王金星,赵小凡. 生物化学与生物物理进展. 2004(02)
[8]热带海洋珍珠贝类立克次体（RLO）病研究——Ⅷ.养殖大珠母贝贝苗养成期群体RLO病流行病学研究[J]. 吴信忠,潘金培,江静波. 海洋学报(中文版). 2003(02)
[9]双壳贝类参与免疫防御的体液因子[J]. 孙虎山,李光友. 海洋科学. 2001(04)
[10]我国沿海滩涂的研究[J]. 彭建,王仰麟. 北京大学学报(自然科学版). 2000(06)
本文编号：3462610
【文章来源】：大连海洋大学辽宁省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
菲律宾蛤仔C型凝集素的结构比较
11：使用 Psipred 预测 CTL 的二级结构。粉红色圆柱表示 α 螺旋; 黄色直箭头表示 β 链; 直线表示线圈。右侧SWISS-MODEL 预测二级结构后 CTL 的三级结构。2-3 The secondary structures of CTLs were predicted using Psipred. The pink cylinders demoted alpha helixes; the traight arrows indicated beta strands; the straight lines indicate coils. The tertiary structures of CTLs followed aftersecondary structures were predicted by SWISS-MODEL.
.2 C 型凝集素基因的同源序列比对及进化分析虽然 CTL 基因的基因组结构非常不同，如除 CTL-2 和 CTL-3 外，在 CTL-1、CTLL-5 和 CTL-6 中鉴定出了信号肽，但是他们都被预测出仅具有一个单一的 CRD。而集素家族的几个重要特征在CRD内与其它物种一致。另外CTL-1和CTL-2与其他构一致，都含有 6 个保守半胱氨酸残基，其中四个完全保守的半胱氨酸残基参与硫化物的形成，两个 Ca2+依赖的碳水化合物结合基序 EPN 和 WND 也在结构中发其他物种相同(图 2-4）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]文蛤C型凝集素基因（Mm-Lec1）的克隆与表达分析[J]. 张晶晶,李宏俊,秦艳杰,刘敏,叶晟. 海洋学报. 2016(06)
[2]温度和盐度对华贵栉孔扇贝免疫相关酶的联合效应[J]. 栗志民,钱佳慧,劳翠英,刘志刚. 海洋科学进展. 2015(02)
[3]我国海洋水产养殖的第三次浪潮[J]. 张福绥. 商周刊. 2014(13)
[4]我国海洋贝类的养殖概况与发展问题[J]. 谢玉坎. 科学种养. 2014(02)
[5]温度对贝类免疫系统的影响及其机理研究进展[J]. 许友卿,吴卫君,蒋伟明,丁兆坤. 水产科学. 2012(03)
[6]温度突变对大海马（Hippocampus kuda）幼体生长、组分及酶活力的影响[J]. 孙彬,陈舜,徐永健,戴广谱. 海洋与湖沼. 2012(01)
[7]无脊椎动物先天免疫模式识别受体研究进展[J]. 王金星,赵小凡. 生物化学与生物物理进展. 2004(02)
[8]热带海洋珍珠贝类立克次体（RLO）病研究——Ⅷ.养殖大珠母贝贝苗养成期群体RLO病流行病学研究[J]. 吴信忠,潘金培,江静波. 海洋学报(中文版). 2003(02)
[9]双壳贝类参与免疫防御的体液因子[J]. 孙虎山,李光友. 海洋科学. 2001(04)
[10]我国沿海滩涂的研究[J]. 彭建,王仰麟. 北京大学学报(自然科学版). 2000(06)
本文编号：3462610
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3462610.html
