大西洋中脊盲虾Rimicaris exoculata种群遗传和microRNA分析以及日本对虾抗病毒活性物质筛选

发布时间：2021-10-29 02:44

　　盲虾Rimicaris exoculata是大西洋中脊热液口特有物种。2011年南大西洋SMAR01站位大规模盲虾种群的发现,表明该种在跨度达9000多公里的大西洋中脊上形成几个大种群。因此,其种群间时间和空间的联系一直吸引着海洋生态学家的关注。之前盲虾种群联系的研究集中于北大西洋中脊的种群（只涉及到极少数的赤道以南的盲虾个体）,而且赤道附近巨大的Romanche转换断层被认为是热液口底栖生物迁移的阻限。本研究首次结合mtCOI基因和11个微卫星位点,运用系统发育分析、谱系生物地理学以及遗传变异参数的方法对南大西洋中脊盲虾种群进行较大规模的种群遗传分析。结果显示：（1）共获得SMAR01种群34个个体的mtCOI基因片段序列和32个个体的微卫星位点多态性数据,其中共获得mtCOI单倍型12个,包含1个优势单倍型（Hap₅）；在11个微卫星位点共检测到130个等位基因。（2） SMAR01种群整体表现为高的单倍型多样性（0.754）和低的核苷酸多样性（0.0024）,mtCOI单倍型网络分布图显示为星状结构,优势单倍型位于拓扑结构的中心,错配分布表明其群口历史符合突... 

【文章来源】：浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：138 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
引言
    1.1 热液口生物群落组成
    1.2 热液口种群联系的研究进展
        1.2.1 大西洋中脊
        1.2.2 太平洋东部
        1.2.3 影响种群迁移的因素
    1.3 甲壳动物中microRNA的研究进展
    1.4 次级代谢产物在海洋无脊椎动物抗病原侵染中的作用
    1.5 本研究的目的和意义
材料与方法
    2.1 材料
        2.1.1 试验用样品
        2.1.2 主要试剂和培养基
        2.1.3 主要分析软件
        2.1.4 主要仪器设备
    2.2 方法
结果与分析
    3.1 大西洋中脊热液口盲虾种群遗传分析
        3.1.1 大西洋中脊热液口盲虾样品采集及数据收集
        3.1.2 SMAR01站位基于mtCOI基因片段的遗传多样性分析
        3.1.3 SMAR01种群基于微卫星计算的遗传多样性
        3.1.4 Rimicaris exoculata跨越赤道阻限的迁移
    3.2 盲虾Rimicaris exoculata microRNA的分析
        3.2.1 RNA提取质量检测
        3.2.2 microRNA测序结果总览
        3.2.3 保守的microRNA
        3.2.4 R.exoculata特有的microRNA
        3.2.5 microRNA臂的选择
        3.2.6 microRNA异构体(3’或5’添加,替换等)
    3.3 日本对虾Marsupenaeus japonicas抗病毒小分子的筛选
        3.3.1 日本对虾WSSV病毒感染
        3.3.2 次级代谢产物筛选
        3.3.3 次级代谢产物的抗病毒作用
讨论
    4.1 大西洋中脊盲虾的种群遗传
    4.2 盲虾保守的microRNA
    4.3 日本对虾活性物质筛选
小结与展望
    小结
    展望
参考文献
附录 待发表的文章
个人简历
致谢



本文编号：3463809