基于线粒体控制区的商城肥鲵谱系地理学和保护遗传学研究

发布时间：2021-10-29 04:22

　　商城肥鲵为我国特有的有尾两栖动物,也是大别山区的特有种,其分布区极其狭窄。本研究利用Genebank中的商城肥鲵和新疆北鲵的线粒体基因全序列成功设计出扩增线粒体基因组控制区（mtDNA D-loop）的引物,并扩增了来自大别山区的白马尖-鹞落坪-明堂山（BYM）、天堂寨-马鬃岭（TM）、王寨-黄柏山-九峰尖（KHJ）、金刚台周边地区（JGT）四个地理种群175个商城肥鲵样品的D-loop序列,分析了它的遗传多样性、谱系地理学模式和保护遗传学等方面,得出如下的一些主要成果：（1）商城肥鲵的遗传多样性较低在TM种群中,有10个单倍型,其单倍型多样性为0.7853士0.0587,核苷酸多样性为0.0050士0.0034,都显示较高的遗传多样性；而与它相比,在KHJ种群中,仅有2个单倍型,其单倍型多样性为0.1079士0.0680,核苷酸多样性为0.0001士0.0003,都显示出很低的遗传多样性。综合来看,四个种群的遗传多样性中,TM种群的最高,而KHJ种群的最低,其他两个种群居中。另外,总体上与其他濒危动物,如大鲵（Andrias davidianus）等相比,商城肥鲵的遗传多样性水平相对... 

【文章来源】：安徽大学安徽省 211工程院校

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1 谱系地理学
        1.1 谱系地理学定义
        1.2 谱系地理学研究内容与进展
        1.3 谱系地理学研究进展
    2 保护遗传学
        2.1 保护遗传学的概念和研究内容
        2.2 保护遗传学的产生发展
        2.3 保护遗传学研究领域
            2.3.1 物种保护相关单元确定
            2.3.2 遗传多样性
            2.3.3 近交、远交衰退
    3 分子标记的选用
    4 大别山区简介
        4.1 大别山区地理环境
        4.2 关于大别山物种的研究背景
    5 第四纪冰期综述
    6 商城肥鲵概况
        6.1 分类历史简介
        6.2 形态特征、生活习性与分布
        6.3 资源现状
第二章 基于控制区对商城肥鲵的遗传多样性及谱系地理学研究
    1 材料和方法
        1.1 实验试剂与仪器
        1.2 样品采集与保存
        1.3 溶液及凝胶配制
        1.4 总DNA提取
        1.5 引物设计
        1.6 目标片段扩增、测序
        1.7 数据整理和分析
            1.7.1 序列拼接与比对
            1.7.2 遗传多样性分析
            1.7.3 遗传结构与谱系地理学分析
            1.7.4 种群动态分析
    2 结果
        2.1 样品采集情况
        2.2 线粒体基因扩增与测序结果
        2.3 数据的整理和分析结果
            2.3.1 遗传多样性分析
            2.3.2 遗传结构分析
            2.3.3 谱系地理学分析
            2.3.4 种群动态分析
    3 讨论
        3.1 商城肥鲵的遗传多样性
        3.2 商城肥鲵的谱系地理学研究
        3.3 商城肥鲵种群动态分析
        3.4 商城肥鲵的保护遗传学分析
        3.5 关于大别山区物种特异性分析
第三章 总结
参考文献
致谢
攻读学位期间已发表的论文目录


【参考文献】：
期刊论文
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[3]安徽岳西大别山区爬行动物新记录——平胸龟（Platysternon megacephalum）[J]. 潘涛,汪文革,汪龙春,陈智勇,张保卫.  安徽大学学报(自然科学版). 2013(04)
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[6]大别山山地次生林鸟类群落集团结构的季节变化[J]. 刘彬,周立志,汪文革,沈三宝,韩德民.  动物学研究. 2009(03)
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本文编号：3463953