微囊藻毒素对凡纳滨对虾体液免疫相关基因表达的影响
发布时间：2021-10-30 05:27
微囊藻毒素（MCs）是一类具有生物活性的单环七肽肝毒素，目前已知的异构体超过80余种，其中毒性较强，研究较多的一种便是MC-LR。由于其能够长时间存留在水体中，并能够在生物体内累积，对人类饮水安全和水产养殖行业都提出了挑战。因此，目前的研究较多集中于水体中MC-LR的检测和MC-LR细胞毒性等两方面。凡纳滨对虾作为我国的主要经济水产动物，在养殖过程中常常受到蓝藻水华爆发的影响，水华产生的微囊藻毒素使得对虾大规模死亡，水产行业受到极大的影响。目前已知的研究证明微囊藻毒素可以影响浮萍[1]、大型溞[2]、克氏原螯虾[3]和白鲢[4]等多种水生生物的生理活动，甚至导致死亡。凡纳滨对虾同样作为受到MC直接影响的物种，MC对其造成影响的途径及毒性机理却尚不明晰。本研究通过第二代高通量测序、qRT-PCR等技术手段试图寻找到MC-LR对凡纳滨对虾体液免疫相关基因表达量的影响情况及其致毒机理。在对健康成虾分别注射MC-LR溶液和等量PBS溶液12h后，采集足量的对虾肝胰腺和血液样品，RNA抽提后得到总RNA样品。将样品进行mRNA纯化，分解成小片段，PCR扩增构建文库等一系列操作之后，通过Illum...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
转录本序列长度分布情况
图 2-2 7175 个转录本 GO 功能注释分类情况Fig. 2-2 Distributions of the Gene Ontology functional annotations for the three level-2classifications: biological process, cellular component, molecular function2.2.1.4 COG 注释结果将所有转录本采用 BLAST 比对 String 数据库，得到的结果进行 COG 分析得到相应的功能注释和归类。其中 COG 数据库中获得注释转录本 4588 条，KOG 数据库中获得注释转录本 5,327 条，NOG 数据库中获得注释转录本 77 条。根据功能的不同，以上注释转录本可分为信息存储和处理（information storage andprocessing）、细胞过程和信号传递（cellular processes and signaling）、新陈代谢（metabolism）及功能特征不明显（poorly characterized）等四大类，又可进一步细分为转录（transcription）、信号传递机制（signal transduction mechanisms）等 25小类。
图 2-4 KOG 功能分类Fig. 2-4 Distributions of KOG functional classifications for the isogenes2.2.1.5 KEGG 通路注释结果将所有转录本用 BLAST 与 KEGG 数据库进行比对，共得到 7,955 条转录本得到相应注释，可以归类到 311 条已知信号通路中。其中代谢通路（metabolic pathways）含有最多的与之对应的转录本，共计 1,278 条；次生代谢生物合成（Biosynthesis ofsecondary metabolites）、剪接体（Spliceosome）、RNA 转运（RNA transport）和癌症通路（Pathways in cancer）等也检测到较多转录本，数量分别为 372、243、224和 224 条。表 2-3 对应转录本较多的通路（Top 10）Table 2-3 Signaling pathway of KEGG (Top 10)
【参考文献】：
期刊论文
[1]微囊藻毒素对克氏原螯虾血细胞吞噬能力的影响[J]. 苏晓明,乐亚玲,刘利平. 广东农业科学. 2013(11)
[2]凡纳滨对虾Crustin-like基因的克隆及在副溶血弧菌感染条件下的表达分析[J]. 张艳艳,刘小林,黄海洪,钱昭英,王宪宗,相建海,李义军. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2012(12)
[3]Expression profiles of antimicrobial peptides （AMPs） and their regulation by Relish[J]. 王冬冬,李富花,李诗豪,温荣,相建海. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2012(04)
[4]微囊藻毒素-LR对睾丸支持细胞活性及凋亡基因表达的影响[J]. 易丹,张丰泉,李超锋,段丽菊,程学敏,陈姜,崔留欣,张慧珍. 现代预防医学. 2011(24)
[5]微囊藻毒素对大鼠睾丸支持细胞凋亡相关蛋白表达的影响[J]. 杨明峰,张丰泉,余晓齐,郭大众,易丹,李超锋,崔留欣,张慧珍. 环境与健康杂志. 2011(12)
[6]微囊藻毒素-LR对人肝癌HepG2细胞活性氧生成和脂质过氧化的影响[J]. 农清清,Takeuchi T,张志勇,何敏. 环境与健康杂志. 2011(08)
[7]微囊藻毒素-LR对罗非鱼肝脏活性氧自由基含量及相关抗氧化酶活性的影响[J]. 陈家长,宋超,胡庚东,瞿建宏,孟顺龙,范立民. 农业环境科学学报. 2011(08)
[8]凡纳滨对虾免疫指标变化与其养殖环境理化因子的关系[J]. 张华军,李卓佳,张家松,郭志勋,文国樑,曹煜成,吴垠. 大连海洋大学学报. 2011(04)
[9]铜绿微囊藻对克氏原螯虾幼虾存活及成虾几种酶类的影响[J]. 乐亚玲,刘利平,李慷,晏军,DIANA J S. 水产学报. 2011(08)
[10]活性氧在微囊藻毒素-LR诱导细胞凋亡效应中的作用探讨[J]. 尹建勋,帅怡,王彦琴,肖萍,仲伟鉴. 环境与职业医学. 2011(07)
本文编号：3466142
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
转录本序列长度分布情况
图 2-2 7175 个转录本 GO 功能注释分类情况Fig. 2-2 Distributions of the Gene Ontology functional annotations for the three level-2classifications: biological process, cellular component, molecular function2.2.1.4 COG 注释结果将所有转录本采用 BLAST 比对 String 数据库，得到的结果进行 COG 分析得到相应的功能注释和归类。其中 COG 数据库中获得注释转录本 4588 条，KOG 数据库中获得注释转录本 5,327 条，NOG 数据库中获得注释转录本 77 条。根据功能的不同，以上注释转录本可分为信息存储和处理（information storage andprocessing）、细胞过程和信号传递（cellular processes and signaling）、新陈代谢（metabolism）及功能特征不明显（poorly characterized）等四大类，又可进一步细分为转录（transcription）、信号传递机制（signal transduction mechanisms）等 25小类。
图 2-4 KOG 功能分类Fig. 2-4 Distributions of KOG functional classifications for the isogenes2.2.1.5 KEGG 通路注释结果将所有转录本用 BLAST 与 KEGG 数据库进行比对，共得到 7,955 条转录本得到相应注释，可以归类到 311 条已知信号通路中。其中代谢通路（metabolic pathways）含有最多的与之对应的转录本，共计 1,278 条；次生代谢生物合成（Biosynthesis ofsecondary metabolites）、剪接体（Spliceosome）、RNA 转运（RNA transport）和癌症通路（Pathways in cancer）等也检测到较多转录本，数量分别为 372、243、224和 224 条。表 2-3 对应转录本较多的通路（Top 10）Table 2-3 Signaling pathway of KEGG (Top 10)
【参考文献】：
期刊论文
[1]微囊藻毒素对克氏原螯虾血细胞吞噬能力的影响[J]. 苏晓明,乐亚玲,刘利平. 广东农业科学. 2013(11)
[2]凡纳滨对虾Crustin-like基因的克隆及在副溶血弧菌感染条件下的表达分析[J]. 张艳艳,刘小林,黄海洪,钱昭英,王宪宗,相建海,李义军. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2012(12)
[3]Expression profiles of antimicrobial peptides （AMPs） and their regulation by Relish[J]. 王冬冬,李富花,李诗豪,温荣,相建海. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2012(04)
[4]微囊藻毒素-LR对睾丸支持细胞活性及凋亡基因表达的影响[J]. 易丹,张丰泉,李超锋,段丽菊,程学敏,陈姜,崔留欣,张慧珍. 现代预防医学. 2011(24)
[5]微囊藻毒素对大鼠睾丸支持细胞凋亡相关蛋白表达的影响[J]. 杨明峰,张丰泉,余晓齐,郭大众,易丹,李超锋,崔留欣,张慧珍. 环境与健康杂志. 2011(12)
[6]微囊藻毒素-LR对人肝癌HepG2细胞活性氧生成和脂质过氧化的影响[J]. 农清清,Takeuchi T,张志勇,何敏. 环境与健康杂志. 2011(08)
[7]微囊藻毒素-LR对罗非鱼肝脏活性氧自由基含量及相关抗氧化酶活性的影响[J]. 陈家长,宋超,胡庚东,瞿建宏,孟顺龙,范立民. 农业环境科学学报. 2011(08)
[8]凡纳滨对虾免疫指标变化与其养殖环境理化因子的关系[J]. 张华军,李卓佳,张家松,郭志勋,文国樑,曹煜成,吴垠. 大连海洋大学学报. 2011(04)
[9]铜绿微囊藻对克氏原螯虾幼虾存活及成虾几种酶类的影响[J]. 乐亚玲,刘利平,李慷,晏军,DIANA J S. 水产学报. 2011(08)
[10]活性氧在微囊藻毒素-LR诱导细胞凋亡效应中的作用探讨[J]. 尹建勋,帅怡,王彦琴,肖萍,仲伟鉴. 环境与职业医学. 2011(07)
本文编号：3466142
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