坛紫菜光合作用相关基因的克隆及表达特征分析
发布时间：2021-10-31 22:04
坛紫菜（Pyropia haitanensis）是我国南方沿海广泛栽培的大型经济海藻,具有重要的经济价值及理论研究价值。坛紫菜的生活史世代包括形态结构完全不同的两个世代:丝状体世代与叶状体世代。两个世代在生理机制及光合固碳方面均存在明显差异。本论文从分子水平及酶学生理水平对坛紫菜不同生活史世代间以及不同失水胁迫水平下的光合固碳途径相关基因的表达水平和酶活性变化进行了比较研究,研究结果为坛紫菜不同生活史世代光合固碳机制的阐明及坛紫菜光合作用对失水胁迫的响应机制研究奠定了基础。主要研究结果如下:1、在坛紫菜转录组数据库中检索到73条与光合固碳途径相关的Unigene,其中C3途径49条,C4途径24条。2、采用RACE和普通PCR扩增相结合的方法,克隆获得了坛紫菜光合作用固碳途径中C3途径相关基因7条,C4途径相关基因6条。C3途径基因分别命名为PhPGK、PhFBA、PhcFBPase、PhTKT、PhSBP、PhRPIA、PhRPE,它们的序列长度分别为1871,1541,14...
【文章来源】：集美大学福建省
【文章页数】：127 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
卡尔文循环过程
34图 3.1 坛紫菜光合作用基因全长扩增产物的凝胶电泳图Fig. 3.1 Agarose gel electrophoresis of RACE products of photosynthesis genes in P. hait注：M:DL2000 DNA Marker；Fig.A-T、a-j表示基因的5′或3′及普通PCR基因片段（A-T从左到右依次是PhTKT5PhTKT 中间片段、PhALT5′、PhALT3′、PhNADP-ME5′、PhNADP-ME3′、PhAST5′、PhAST3′、PhRPIA5′、PhRPIA3PhPGK3′、PhPGK 中间片段、PhMDH5′、PhMDH3′、PhNAD-ME5′、PhNAD-ME3′、PhNAD-ME 中间片段、a依次是 PhFBA5′、PhFBA3′、PhSBP5′、PhSBP 中间片段、PhPK CDS 区扩增 1、PhPK5′、PhPK3′、PhPK CDPhRPE5′、PhRPE3′）
坛紫菜光合作用相关基因的3、Thr141、Ser146、Ser222、Ser340、Thr435 和细胞质中。坛紫菜一级结构分析，PhcPGK 基因编码的蛋白质包含 5约为 56.5 kD，理论等电点为 8.61。正电荷氨基酸残基（lu）总数为 53，不稳定系数为 43.1，脂肪系数为 89.49，，疏水性较强。PredictProteinjr 程序预测二级结构中构成占总氨基酸比例分别为 33.09%、16.91%和 50%。在线构进行预测，结果如图 3.3 所示。
【参考文献】：
期刊论文
[1]叶绿素荧光动力学参数作为植物抗盐性评价指标的有效性[J]. 刘强,王庆成,王占武. 广东农业科学. 2014(21)
[2]一个棉花果糖-1,6-二磷酸酶基因的克隆与表达特征[J]. 徐文亭,王诚,徐晓洋,蔡彩平,郭旺珍. 棉花学报. 2013(06)
[3]高温胁迫下银杏离体枝条叶片的叶绿素荧光特性[J]. 陈梅,唐运来. 中国南方果树. 2013(02)
[4]坛紫菜色素突变体色素基因的表达定量分析[J]. 黄惠珍,谢潮添,纪德华,徐燕,陈昌生. 水产学报. 2012(06)
[5]铁皮石斛磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆及表达分析[J]. 曾淑华,文国松,徐绍忠,查应红,杨生超,段承俐. 中草药. 2012(04)
[6]土壤水分胁迫对槟榔幼苗叶绿素荧光动力学参数的影响[J]. 陈歆,刘贝贝,韩丙军,周兆德,彭黎旭,杨福孙. 热带作物学报. 2012(02)
[7]高温对两种卡帕藻的酶活性、色素含量与叶绿素荧光的影响[J]. 赵素芬,何培民. 生态学报. 2011(22)
[8]Profiling of the transcriptome of Porphyra yezoensis with Solexa sequencing technology[J]. YANG Hui,MAO YunXiang ,KONG FanNa,YANG GuanPin,MA Fei & WANG Li College of Marine Life Sciences,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Chinese Science Bulletin. 2011(20)
[9]不同草莓品种对温度的光合响应研究[J]. 程云清,刘剑锋,倪福太,王占武,王淑范. 中国农学通报. 2011(16)
[10]基于叶绿素荧光技术的紫菜光适应特征研究[J]. 张涛,沈宗根,姚春燕,陆勤勤,姜红霞,朱建一,许璞. 海洋学报(中文版). 2011(03)
博士论文
[1]C3/C4光合作用差异表达基因的鉴定与分析[D]. 陈太钰.华中农业大学 2012
[2]紫菜叶状体遗传分析与PEPCK、PEPC在不同世代间的表达分析[D]. 何林文.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2012
[3]番茄景天庚酮糖-1，7-二磷酸酯酶基因的克隆及遗传转化[D]. 王美玲.山东农业大学 2011
[4]紫菜光合碳同化途径相关基因的表达分析[D]. 王超.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2011
[5]菊花光合作用对高温胁迫的响应机理研究[D]. 孙宪芝.山东农业大学 2008
[6]紫菜壳孢子萌发过程及其世代差异研究[D]. 范晓蕾.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2007
[7]条斑紫菜光系统Ⅱ的分离鉴定及Rubisco的研究[D]. 高政权.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2005
硕士论文
[1]浒苔中C3和C4途径关键酶的研究[D]. 许建方.国家海洋局第一海洋研究所 2013
[2]秸秆喷施快速腐熟剂后还田对玉米生长及产量的影响[D]. 冷麟良.吉林农业大学 2012
[3]小球藻Rubisco活化酶基因的克隆及表达特性研究[D]. 邓意龙.宁波大学 2012
[4]杜氏盐藻RbcS基因家族新成员的克隆及功能研究[D]. 冯玖玲.郑州大学 2010
[5]两种短命植物与典型的C3和C4植物在结构及光合关键酶定位方面的比较研究[D]. 刘彭.新疆大学 2007
[6]高速公路尘污染对植物叶片光合作用的影响[D]. 黄峰.武汉理工大学 2007
本文编号：3468938
【文章来源】：集美大学福建省
【文章页数】：127 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
卡尔文循环过程
34图 3.1 坛紫菜光合作用基因全长扩增产物的凝胶电泳图Fig. 3.1 Agarose gel electrophoresis of RACE products of photosynthesis genes in P. hait注：M:DL2000 DNA Marker；Fig.A-T、a-j表示基因的5′或3′及普通PCR基因片段（A-T从左到右依次是PhTKT5PhTKT 中间片段、PhALT5′、PhALT3′、PhNADP-ME5′、PhNADP-ME3′、PhAST5′、PhAST3′、PhRPIA5′、PhRPIA3PhPGK3′、PhPGK 中间片段、PhMDH5′、PhMDH3′、PhNAD-ME5′、PhNAD-ME3′、PhNAD-ME 中间片段、a依次是 PhFBA5′、PhFBA3′、PhSBP5′、PhSBP 中间片段、PhPK CDS 区扩增 1、PhPK5′、PhPK3′、PhPK CDPhRPE5′、PhRPE3′）
坛紫菜光合作用相关基因的3、Thr141、Ser146、Ser222、Ser340、Thr435 和细胞质中。坛紫菜一级结构分析，PhcPGK 基因编码的蛋白质包含 5约为 56.5 kD，理论等电点为 8.61。正电荷氨基酸残基（lu）总数为 53，不稳定系数为 43.1，脂肪系数为 89.49，，疏水性较强。PredictProteinjr 程序预测二级结构中构成占总氨基酸比例分别为 33.09%、16.91%和 50%。在线构进行预测，结果如图 3.3 所示。
【参考文献】：
期刊论文
[1]叶绿素荧光动力学参数作为植物抗盐性评价指标的有效性[J]. 刘强,王庆成,王占武. 广东农业科学. 2014(21)
[2]一个棉花果糖-1,6-二磷酸酶基因的克隆与表达特征[J]. 徐文亭,王诚,徐晓洋,蔡彩平,郭旺珍. 棉花学报. 2013(06)
[3]高温胁迫下银杏离体枝条叶片的叶绿素荧光特性[J]. 陈梅,唐运来. 中国南方果树. 2013(02)
[4]坛紫菜色素突变体色素基因的表达定量分析[J]. 黄惠珍,谢潮添,纪德华,徐燕,陈昌生. 水产学报. 2012(06)
[5]铁皮石斛磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆及表达分析[J]. 曾淑华,文国松,徐绍忠,查应红,杨生超,段承俐. 中草药. 2012(04)
[6]土壤水分胁迫对槟榔幼苗叶绿素荧光动力学参数的影响[J]. 陈歆,刘贝贝,韩丙军,周兆德,彭黎旭,杨福孙. 热带作物学报. 2012(02)
[7]高温对两种卡帕藻的酶活性、色素含量与叶绿素荧光的影响[J]. 赵素芬,何培民. 生态学报. 2011(22)
[8]Profiling of the transcriptome of Porphyra yezoensis with Solexa sequencing technology[J]. YANG Hui,MAO YunXiang ,KONG FanNa,YANG GuanPin,MA Fei & WANG Li College of Marine Life Sciences,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Chinese Science Bulletin. 2011(20)
[9]不同草莓品种对温度的光合响应研究[J]. 程云清,刘剑锋,倪福太,王占武,王淑范. 中国农学通报. 2011(16)
[10]基于叶绿素荧光技术的紫菜光适应特征研究[J]. 张涛,沈宗根,姚春燕,陆勤勤,姜红霞,朱建一,许璞. 海洋学报(中文版). 2011(03)
博士论文
[1]C3/C4光合作用差异表达基因的鉴定与分析[D]. 陈太钰.华中农业大学 2012
[2]紫菜叶状体遗传分析与PEPCK、PEPC在不同世代间的表达分析[D]. 何林文.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2012
[3]番茄景天庚酮糖-1，7-二磷酸酯酶基因的克隆及遗传转化[D]. 王美玲.山东农业大学 2011
[4]紫菜光合碳同化途径相关基因的表达分析[D]. 王超.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2011
[5]菊花光合作用对高温胁迫的响应机理研究[D]. 孙宪芝.山东农业大学 2008
[6]紫菜壳孢子萌发过程及其世代差异研究[D]. 范晓蕾.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2007
[7]条斑紫菜光系统Ⅱ的分离鉴定及Rubisco的研究[D]. 高政权.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2005
硕士论文
[1]浒苔中C3和C4途径关键酶的研究[D]. 许建方.国家海洋局第一海洋研究所 2013
[2]秸秆喷施快速腐熟剂后还田对玉米生长及产量的影响[D]. 冷麟良.吉林农业大学 2012
[3]小球藻Rubisco活化酶基因的克隆及表达特性研究[D]. 邓意龙.宁波大学 2012
[4]杜氏盐藻RbcS基因家族新成员的克隆及功能研究[D]. 冯玖玲.郑州大学 2010
[5]两种短命植物与典型的C3和C4植物在结构及光合关键酶定位方面的比较研究[D]. 刘彭.新疆大学 2007
[6]高速公路尘污染对植物叶片光合作用的影响[D]. 黄峰.武汉理工大学 2007
本文编号：3468938
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