海南鹿角珊瑚属DNA条形码和系统进化研究

发布时间：2021-11-03 04:38

　　鹿角珊瑚属（Acropora）是印度-太平洋区系的第一大造礁石珊瑚属,种类最多,变异大,仅依靠传统形态学很难鉴定。本次实验利用两种核DNA （PaxC内含子和ITS）和两种线粒体DNA （CR和COI）分子标记对海南周边海域7种鹿角珊瑚进行DNA条形码筛选和系统进化分析,结果显示:1)本研究的7种鹿角珊瑚的核DNA分子序列的遗传多样性和遗传距离均高于线粒体基因,其中ITS序列的遗传多样性和遗传距离都相对高于其他分子标记。基于核DNA分子标记的鼻形鹿角珊瑚（Acropora nasuta）和石松鹿角珊瑚（Acropora selago）的种间遗传距离都是最小的,且二者形态学特征也相似,说明两种鹿角珊瑚种间亲缘关系较近。2)两种核DNA分子标记（PaxC内含子和ITS）构建的系统发育树都能将7种鹿角珊瑚分成树枝类、密簇类、密簇伞房类和伞房类。PaxC能将伞房鹿角珊瑚（Acropora corymosa）、多孔鹿角珊瑚（Acropora millepora）、细枝鹿角珊瑚（Acropora nana）和宽片鹿角珊瑚（Acropora lutkeni）鉴定到种,而ITS只能将宽片鹿角珊瑚鉴定到... 

【文章来源】：海南大学海南省 211工程院校

【文章页数】：53 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１样品采集点图

举值大于５０。??进化树显示，本实验所获的７种鹿角珊瑚ＰｏｘＣ？序列聚成４个可靠分支（见??图３）：?Ｉ）树枝类（宽片鹿角珊瑚），ＩＩ）密簇和密簇伞房类（鼻形鹿角珊瑚、强??壮鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚），ＩＩＩ）细枝鹿角珊瑚、ＩＶ）伞房类（伞房鹿角珊瑚??和多孔鹿角珊瑚）。其中伞房鹿角珊瑚、多孔鹿角珊瑚、细枝鹿角珊瑚、宽片鹿??角珊瑚均单独聚集在一起，成功分类到种阶元。??在进化支ＩＩ内，密簇类的鼻形鹿角珊瑚和密簇伞房类的石松鹿角珊瑚、强??壮鹿角珊瑚聚在一起，尽管强壮鹿角珊瑚与其它两种珊瑚的八序列有着微小??程度的重叠，但大部分的强壮鹿角珊瑚样品明显聚成一个亚支，与其它两种鹿角??珊瑚分离。鼻形鹿角珊瑚、强壮鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚群体形态极其相似，在??进化树上也混聚在一个分支上，因此很难对其进行种的划分。??分支ＩＶ包含多孔鹿角珊瑚和伞房鹿角珊瑚两个种的

２０图４ＩＴＳ贝叶斯进化树??注：不同颜色代表不同种，颜色代表同ＰｏｘＣ??Ｆｉｇ．?４?Ｂａｙｅｓｉａｎ?ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ＩＴＳ??


本文编号：3473061