基于DNA条形码的长江上游江津段鱼类早期资源种类鉴定
发布时间：2021-11-04 04:30
准确鉴定鱼卵的种类是开展鱼类早期资源研究和评估鱼类资源年际补充量重要的前提。本研究采用DNA条形码技术,选择Cyt b基因作为标记基因,使用合适的通用引物对其PCR扩增,经过测序和序列分析,对长江上游江津江段所采集到的漂流性卵和人工鱼巢上的粘性卵进行种类鉴定,以期为鱼类早期资源种类鉴定建立一种快速、准确的分子鉴定方法。其主要研究结果如下:1.基于DNA条形码鱼类早期资源种类鉴定技术的建立DNA条形码技术鉴定鱼卵种类的关键在于鱼卵DNA的提取、通用引物的筛选以及PCR扩增。本研究比较了3种单枚鱼卵DNA提取方式,3对通用引物的扩增效果和测序结果的准确度。最后选择快速提取鱼卵DNA法作为单枚鱼卵DNA的提取方法,通用引物对1 H15149/L14735作为扩增鱼类Cyt b基因上长度为464bp的DNA片段。再将未经纯化的PCR产物送至测序,将测序所得的序列处理后在NCBI数据库中利用自带的blast软件进行序列比对和物种鉴定。碱基相似度在98%之上的即可认为是同一种鱼。2.2014年长江上游江津段人工鱼巢上的粘性卵种类鉴定2014年4月29日、5月11日选取了长江上游江津段顺江、朱杨和龙...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 鱼类早期资源调查
1.2 鱼类物种鉴定方法
1.2.1 形态学鉴定方法
1.2.2 分子生物学鉴定方法
1.3 DNA条形码和Cyt b基因在物种鉴定中的应用
1.4 长江上游江津段产卵场概况
第二章 引言
2.1 选题意义
2.2 研究目标
2.3 研究内容
2.4 技术路线
第三章 基于DNA条形码鱼卵种类鉴定技术的建立
3.1 材料与试剂
3.1.1 实验材料
3.1.2 实验试剂
3.1.3 实验仪器与设备
3.2 实验方法
3.2.1 单枚鱼卵DNA提取方法
3.2.2 三对通用引物扩增体系
3.2.3 琼脂糖凝胶电泳
3.2.4 DNA序列分析
3.3 结果与分析
3.3.1 单枚鱼卵DNA提取方法的比较
3.3.2 三对通用引物扩增效果的比较
3.4 讨论
第四章 基于DNA条形码的长江重庆江津段粘性卵种类鉴定
4.1 材料与方法
4.1.1 采样点设置
4.1.2 鱼类早期资源的采集
4.1.3 鱼类早期资源的种类鉴定
4.2 结果与分析
4.2.1 2014年人工鱼巢采样点鱼类早期资源种类鉴定结果
4.2.2 2015年人工鱼巢采样点鱼类早期资源种类鉴定结果
4.3 讨论
第五章 基于DNA条形码的长江上游江津段漂流性卵种类鉴定
5.1 材料与方法
5.1.1 采样点设置
5.1.2 鱼类早期资源的采集
5.1.3 鱼类早期资源的种类鉴定
5.2 结果与分析
5.3 讨论
第六章 长江重庆江津段人工鱼巢产卵场水生生物和水质环境调查
6.1 材料与方法
6.1.1 水体基本理化性质测定
6.1.2 浮游生物样本采集、种类鉴定及计数
6.1.3 水质环境评价方法
6.2 结果与讨论
6.2.1 水体基本理化性质分析
6.2.2 浮游生物种类组成及多样性
6.3 讨论
第七章 结论
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表论文及参与科研项目
攻读硕士学位期间发表论文
参与科研项目
【参考文献】：
期刊论文
[1]长江上游宜宾江段渔业资源现状研究[J]. 熊飞,刘红艳,段辛斌,刘绍平,陈大庆. 西南大学学报(自然科学版). 2015(11)
[2]金沙江一期工程蓄水前长江上游产漂流性卵鱼类产卵场现状[J]. 段辛斌,田辉伍,高天珩,刘绍平,王珂,陈大庆. 长江流域资源与环境. 2015(08)
[3]长江上游江津和宜宾江段圆口铜鱼资源量估算[J]. 熊飞,刘红艳,段辛斌,刘绍平,陈大庆. 动物学杂志. 2014(06)
[4]磁县“四电六动”工作机制助力农技推广——记河北省磁县基层农技推广体系改革与建设[J]. 李树洋,王明海. 基层农技推广. 2014(10)
[5]人工鱼巢在固化河堤河道中提升鱼的繁殖能力的作用[J]. 吴宗耀. 基层农技推广. 2014(10)
[6]大茶湖浮游藻类调查与水质初步评价[J]. 王亚尼,周序协,张桂蓉,魏开建,阮宜兵. 华中农业大学学报. 2013(03)
[7]南海海域红斑后海螯虾（Metanephrops thomsoni）的分子识别与群体遗传分化[J]. 范艳波,王中铎,郭昱嵩,颜云榕,刘楚吾. 海洋与湖沼. 2013(01)
[8]我国32种鸟类DNA条形码分析[J]. 马明义,闫颖,王译伟,李静,蔡延森,李佳凌. 四川动物. 2012(05)
[9]基于Cytb基因的鱼类加工产品的鱼种鉴定[J]. 张洪沂,柴平海,梅艳巧,邓恬宁. 华北农学报. 2011(S2)
[10]聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性和芯片生物分析技术用于渤海地区鱼种鉴定[J]. 李潇,曲焱焱,张丕乔,张津,张丽华,黄大亮,张玉奎. 色谱. 2011(07)
博士论文
[1]长江鱼类早期形态发育与种类鉴别[D]. 乔晔.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2005
硕士论文
[1]长江上游江津江段鱼类早期资源研究[D]. 唐锡良.西南大学 2010
[2]长江上游鱼类资源现状及早期资源调查研究[D]. 段辛斌.华中农业大学 2008
本文编号：3475007
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 鱼类早期资源调查
1.2 鱼类物种鉴定方法
1.2.1 形态学鉴定方法
1.2.2 分子生物学鉴定方法
1.3 DNA条形码和Cyt b基因在物种鉴定中的应用
1.4 长江上游江津段产卵场概况
第二章 引言
2.1 选题意义
2.2 研究目标
2.3 研究内容
2.4 技术路线
第三章 基于DNA条形码鱼卵种类鉴定技术的建立
3.1 材料与试剂
3.1.1 实验材料
3.1.2 实验试剂
3.1.3 实验仪器与设备
3.2 实验方法
3.2.1 单枚鱼卵DNA提取方法
3.2.2 三对通用引物扩增体系
3.2.3 琼脂糖凝胶电泳
3.2.4 DNA序列分析
3.3 结果与分析
3.3.1 单枚鱼卵DNA提取方法的比较
3.3.2 三对通用引物扩增效果的比较
3.4 讨论
第四章 基于DNA条形码的长江重庆江津段粘性卵种类鉴定
4.1 材料与方法
4.1.1 采样点设置
4.1.2 鱼类早期资源的采集
4.1.3 鱼类早期资源的种类鉴定
4.2 结果与分析
4.2.1 2014年人工鱼巢采样点鱼类早期资源种类鉴定结果
4.2.2 2015年人工鱼巢采样点鱼类早期资源种类鉴定结果
4.3 讨论
第五章 基于DNA条形码的长江上游江津段漂流性卵种类鉴定
5.1 材料与方法
5.1.1 采样点设置
5.1.2 鱼类早期资源的采集
5.1.3 鱼类早期资源的种类鉴定
5.2 结果与分析
5.3 讨论
第六章 长江重庆江津段人工鱼巢产卵场水生生物和水质环境调查
6.1 材料与方法
6.1.1 水体基本理化性质测定
6.1.2 浮游生物样本采集、种类鉴定及计数
6.1.3 水质环境评价方法
6.2 结果与讨论
6.2.1 水体基本理化性质分析
6.2.2 浮游生物种类组成及多样性
6.3 讨论
第七章 结论
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表论文及参与科研项目
攻读硕士学位期间发表论文
参与科研项目
【参考文献】：
期刊论文
[1]长江上游宜宾江段渔业资源现状研究[J]. 熊飞,刘红艳,段辛斌,刘绍平,陈大庆. 西南大学学报(自然科学版). 2015(11)
[2]金沙江一期工程蓄水前长江上游产漂流性卵鱼类产卵场现状[J]. 段辛斌,田辉伍,高天珩,刘绍平,王珂,陈大庆. 长江流域资源与环境. 2015(08)
[3]长江上游江津和宜宾江段圆口铜鱼资源量估算[J]. 熊飞,刘红艳,段辛斌,刘绍平,陈大庆. 动物学杂志. 2014(06)
[4]磁县“四电六动”工作机制助力农技推广——记河北省磁县基层农技推广体系改革与建设[J]. 李树洋,王明海. 基层农技推广. 2014(10)
[5]人工鱼巢在固化河堤河道中提升鱼的繁殖能力的作用[J]. 吴宗耀. 基层农技推广. 2014(10)
[6]大茶湖浮游藻类调查与水质初步评价[J]. 王亚尼,周序协,张桂蓉,魏开建,阮宜兵. 华中农业大学学报. 2013(03)
[7]南海海域红斑后海螯虾（Metanephrops thomsoni）的分子识别与群体遗传分化[J]. 范艳波,王中铎,郭昱嵩,颜云榕,刘楚吾. 海洋与湖沼. 2013(01)
[8]我国32种鸟类DNA条形码分析[J]. 马明义,闫颖,王译伟,李静,蔡延森,李佳凌. 四川动物. 2012(05)
[9]基于Cytb基因的鱼类加工产品的鱼种鉴定[J]. 张洪沂,柴平海,梅艳巧,邓恬宁. 华北农学报. 2011(S2)
[10]聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性和芯片生物分析技术用于渤海地区鱼种鉴定[J]. 李潇,曲焱焱,张丕乔,张津,张丽华,黄大亮,张玉奎. 色谱. 2011(07)
博士论文
[1]长江鱼类早期形态发育与种类鉴别[D]. 乔晔.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2005
硕士论文
[1]长江上游江津江段鱼类早期资源研究[D]. 唐锡良.西南大学 2010
[2]长江上游鱼类资源现状及早期资源调查研究[D]. 段辛斌.华中农业大学 2008
本文编号：3475007
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