杂色鲍在不同外界因子胁迫下HIF信号通路相关基因的研究
发布时间：2021-12-17 02:01
近些年,全球气候的变暖已经对自然和社会环境产生了深远的影响。在海洋生态系统中,水温的升高可能会导致一系列的负面影响,如微生物的大量繁殖和溶解氧的降低。这些环境因素的改变最终将导致水生生物暴露于缺氧的环境中。一般情况下,外界环境的改变往往会诱发机体内一系列的生理生化的变化来适应这一改变。而这一适应的过程,在很大程度上都依赖于编码这些理化反应相关蛋白基因的表达水平的改变。缺氧诱导因子1(Hypoxia inducible factor 1,HIF-1)包括α和β两个亚基,是缺氧环境下的一个主要的转录因子,可以通过对不同基因表达水平的调节来适应缺氧的环境。本研究首次对杂色鲍(Haliotis diversicolor)的HIF-1α、HIF-1β和硒结合蛋白1(Selenium-binding protein 1,SBP1)基因进行了报道,并分别将杂色鲍的HIF-1α、HIF-1β和SBP1基因命名为HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1。同时,采用生物信息学的方法分析了杂色鲍的HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1基因的特征。另外,我们还利用实时定量PCR和RNA干扰等...
【文章来源】： 集美大学福建省
【文章页数】：80 页
【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 引言
1.1 HIF信号通路相关基因的结构与功能的研究进展
1.1.1 HIF信号通路核心基因HIF-1
1.1.2 SBP1、NOS及TNF-α基因
1.2 HIF-1 的表达调控及靶基因引起的生物学效应研究进展
1.2.1 HIF-1 的表达调控
1.2.2 HIF-1 的靶基因
1.2.3 红细胞生成或铁代谢
1.2.4 血管生成
1.2.5 葡萄糖代谢
1.2.6 细胞增殖/生存及细胞凋亡
1.3 HIF信号通路相关基因在水生动物中的研究进展
1.4 本研究的内容和目的意义
1.4.1 研究的内容
1.4.2 目的与意义
第2章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 实验动物
2.1.2 主要仪器与试剂
2.1.3 引物
2.2 实验方法
2.2.1 总RNA的提取（RDP法）及去除DNA的污染
2.2.2 合成RT-PCR cDNA第一链和RT-PCR扩增获取基因片段
2.2.3 SMART-RACE技术获取基因全长
2.2.4 割胶纯化基因片段
2.2.5 与PET19-T质粒载体连接
2.2.6 JM109感受态细胞的转化及筛选
2.2.7 质粒插入片段的PCR检测
2.2.8 质粒测序
2.2.9 目的基因的生物信息学分析
2.2.10 缺氧、高温、缺氧&高温及弧菌注射的应激实验
2.2.11 dsRNA的合成
2.2.12 杂色鲍血细胞的培养实验
2.2.13 RNA干扰
2.2.14 实时荧光定量PCR反应体系及条件
第3章 结果
3.1 总RNA的抽提结果
3.2 RT-PCR扩增结果
3.3 杂色鲍HIF信号通路相关基因的序列分析
3.3.1 HdHIF-1α基因的序列分析
3.3.2 HdHIF-1β基因的序列分析
3.3.3 HdSBP1基因的序列分析
3.4 杂色鲍HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1基因在不同组织器官中的表达分析
3.5 杂色鲍HIF信号通路相关基因在不同应激下的表达分析
3.5.1 杂色鲍HdHIF-1α基因在不同应激下的表达分析
3.5.2 杂色鲍HdHIF-1β基因在不同应激下的表达分析
3.5.3 杂色鲍HdSBP1基因在不同应激下的表达分析
3.5.4 杂色鲍HdNOS基因在不同应激下的表达分析
3.5.5 杂色鲍HdTNFα基因在不同应激下的表达分析
3.6 HdHIF-1α基因的RNA干扰之后表达
第4章 讨论
4.1 HdHIF-1 基因
4.2 HdSBP1、HdNOS及HdTNF-α基因
4.3 HIF-1 基因干扰后若干靶基因的表达
第5章 结论与展望
致谢
参考文献
在学期间发表的学术论文
【参考文献】：
期刊论文
[1]温度对杂色鲍不同群体生长率与存活率的影响 [J]. 游伟伟,林焕阳,骆轩,王德祥,林壮炳,柯才焕. 台湾海峡. 2011(04)
[2]杂色鲍对高温和低盐耐受力的初步研究 [J]. 刘贤德,闫玉华,王志勇,蔡明夷,柯才焕. 集美大学学报(自然科学版). 2008(04)
[3]HIF-1与肿瘤乏氧及其治疗中应用的研究进展 [J]. 潘松旦,马胜林. 浙江临床医学. 2008(10)
[4]COPD患者治疗前后血清hs-CRP、TNF-α、IL-6、IL-8检测的临床意义 [J]. 胡蓉. 放射免疫学杂志. 2007(06)
[5]工厂化养殖杂色鲍致病菌副溶血弧菌的分离鉴定及其生理特性 [J]. 邓先余,王智学,孙成波,陈晓艳,何建国. 海洋科学. 2007(11)
[6]Caspase Family Proteases and Apoptosis [J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[7]缺氧诱导因子-1在缺氧诱导一氧化氮合成酶基因表达中的作用 [J]. 潘德顺,陈伟强,张德兴. 解剖学研究. 2004(02)
[8]养殖对虾细菌性红体病的初步研究 [J]. 周永灿,张本,陈雪芬,钱家英. 海洋科学. 2003(05)
[9]我国鲍养殖病害研究进展 [J]. 陈信忠,龚艳清. 福建水产. 2002(02)
[10]网箱养殖石斑鱼暴发性溃疡病病原菌分离、鉴定及致病性研究 [J]. 朱传华,何建国,黄志坚. 中山大学学报(自然科学版). 2000(S1)
本文编号：3539206
【文章来源】： 集美大学福建省
【文章页数】：80 页
【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 引言
1.1 HIF信号通路相关基因的结构与功能的研究进展
1.1.1 HIF信号通路核心基因HIF-1
1.1.2 SBP1、NOS及TNF-α基因
1.2 HIF-1 的表达调控及靶基因引起的生物学效应研究进展
1.2.1 HIF-1 的表达调控
1.2.2 HIF-1 的靶基因
1.2.3 红细胞生成或铁代谢
1.2.4 血管生成
1.2.5 葡萄糖代谢
1.2.6 细胞增殖/生存及细胞凋亡
1.3 HIF信号通路相关基因在水生动物中的研究进展
1.4 本研究的内容和目的意义
1.4.1 研究的内容
1.4.2 目的与意义
第2章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 实验动物
2.1.2 主要仪器与试剂
2.1.3 引物
2.2 实验方法
2.2.1 总RNA的提取（RDP法）及去除DNA的污染
2.2.2 合成RT-PCR cDNA第一链和RT-PCR扩增获取基因片段
2.2.3 SMART-RACE技术获取基因全长
2.2.4 割胶纯化基因片段
2.2.5 与PET19-T质粒载体连接
2.2.6 JM109感受态细胞的转化及筛选
2.2.7 质粒插入片段的PCR检测
2.2.8 质粒测序
2.2.9 目的基因的生物信息学分析
2.2.10 缺氧、高温、缺氧&高温及弧菌注射的应激实验
2.2.11 dsRNA的合成
2.2.12 杂色鲍血细胞的培养实验
2.2.13 RNA干扰
2.2.14 实时荧光定量PCR反应体系及条件
第3章 结果
3.1 总RNA的抽提结果
3.2 RT-PCR扩增结果
3.3 杂色鲍HIF信号通路相关基因的序列分析
3.3.1 HdHIF-1α基因的序列分析
3.3.2 HdHIF-1β基因的序列分析
3.3.3 HdSBP1基因的序列分析
3.4 杂色鲍HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1基因在不同组织器官中的表达分析
3.5 杂色鲍HIF信号通路相关基因在不同应激下的表达分析
3.5.1 杂色鲍HdHIF-1α基因在不同应激下的表达分析
3.5.2 杂色鲍HdHIF-1β基因在不同应激下的表达分析
3.5.3 杂色鲍HdSBP1基因在不同应激下的表达分析
3.5.4 杂色鲍HdNOS基因在不同应激下的表达分析
3.5.5 杂色鲍HdTNFα基因在不同应激下的表达分析
3.6 HdHIF-1α基因的RNA干扰之后表达
第4章 讨论
4.1 HdHIF-1 基因
4.2 HdSBP1、HdNOS及HdTNF-α基因
4.3 HIF-1 基因干扰后若干靶基因的表达
第5章 结论与展望
致谢
参考文献
在学期间发表的学术论文
【参考文献】：
期刊论文
[1]温度对杂色鲍不同群体生长率与存活率的影响 [J]. 游伟伟,林焕阳,骆轩,王德祥,林壮炳,柯才焕. 台湾海峡. 2011(04)
[2]杂色鲍对高温和低盐耐受力的初步研究 [J]. 刘贤德,闫玉华,王志勇,蔡明夷,柯才焕. 集美大学学报(自然科学版). 2008(04)
[3]HIF-1与肿瘤乏氧及其治疗中应用的研究进展 [J]. 潘松旦,马胜林. 浙江临床医学. 2008(10)
[4]COPD患者治疗前后血清hs-CRP、TNF-α、IL-6、IL-8检测的临床意义 [J]. 胡蓉. 放射免疫学杂志. 2007(06)
[5]工厂化养殖杂色鲍致病菌副溶血弧菌的分离鉴定及其生理特性 [J]. 邓先余,王智学,孙成波,陈晓艳,何建国. 海洋科学. 2007(11)
[6]Caspase Family Proteases and Apoptosis [J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[7]缺氧诱导因子-1在缺氧诱导一氧化氮合成酶基因表达中的作用 [J]. 潘德顺,陈伟强,张德兴. 解剖学研究. 2004(02)
[8]养殖对虾细菌性红体病的初步研究 [J]. 周永灿,张本,陈雪芬,钱家英. 海洋科学. 2003(05)
[9]我国鲍养殖病害研究进展 [J]. 陈信忠,龚艳清. 福建水产. 2002(02)
[10]网箱养殖石斑鱼暴发性溃疡病病原菌分离、鉴定及致病性研究 [J]. 朱传华,何建国,黄志坚. 中山大学学报(自然科学版). 2000(S1)
本文编号：3539206
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