太平洋牡蛎类FUT2基因的克隆与时空表达
发布时间：2021-12-23 21:41
诺如病毒（Norovirus，NoV）是人类急性病毒性肠胃炎的主要病原体，常引起严重的公共卫生与食品安全事件。研究表明NoV依靠识别组织血型抗原（histo-blood group antigens，HBGAs）上的寡糖感染人体。太平洋牡蛎作为NoV感染人体的重要载体之一，体内存在的类A型组织血型抗原（A-like HBGA）能够特异性富集NoV，并且富集NoV的含量存在季节性变化趋势，这种季节性变化趋势是否由类A型HBGA含量变化引起，类A型HBGA的合成关键基因是否影响其含量变化，目前尚未见报道。本研究以太平洋牡蛎类A型HBGA合成途径中的关键酶α-1,2-岩藻糖基转移酶（类FUT2）为研究对象，开展了类FUT2基因克隆与时空表达的研究，以期在分子水平上揭示太平洋牡蛎季节性富集NoV的机理。本研究通过同源克隆的方法获得太平洋牡蛎类FUT2基因的cDNA序列（GenBank登录号KJ184342）。研究结果表明，太平洋牡蛎类FUT2基因cDNA全长为1941bp，包含180bp的5非翻译区、编码361个氨基酸的1086bp的开放阅读框以及675bp的3非翻译区。分子进化聚类分析结果显...
【文章来源】：中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
诺如病毒基因组结构示意图[15]
3.2.2 非结构蛋白ORF1 共 5.0 kb 左右，编码 200.0 kDa 左右的聚合非结构蛋白，由类 3C 的蛋白酶剪切成 6 个蛋白质元件，按照 N-C 的顺序，依次为蛋白 48（p48）、NTP 酶（NTPase）、蛋白 22（p22）、病毒基因组连接蛋白（VPg）、类 3C 蛋白酶（3CLpro）和 RNA 依赖的 RNA 聚合酶（RdRp）。该 ORF1 的 C 端蛋白较为保守，而 5’端基因序列和编码的蛋白在不同诺如病毒中变化很大。因此 C 端成为科研工作者扩增诺如病毒基因的常用位点。NTPase 又称为 p41，研究发现 NTPase 在胞外可以结合 ATP，但当 168 位的氨基酸突变后，该酶便失去活性。NTPase 没有解双链螺旋活性，故其虽可水解ATP，却不能使异源的双链 RNA:DNA 解螺旋。VPg 为 15 kDa 左右，可以共价结合诺如病毒基因组和亚基因组 mRNA，且缺少该蛋白的基因组 RNA 不具有感
11图 1-4 1 型和 2 型碳水化合物形成 ABO 血型抗原结构图[63]注：Gal-GlcNAc 为 N-乙酰乳糖胺，Gal-Glc 为乳糖基Fig. 1-4 NoV and H HBGA interaction
【参考文献】：
期刊论文
[1]长白和蓝塘猪印记基因IGF2和H19的时空表达研究[J]. 吴嫦丽,许继国,吴同山,卫恒习,李莉,李紫聪,吴珍芳,张守全. 华南农业大学学报. 2013(03)
[2]栉孔扇贝wnt4基因cDNA克隆及表达分析[J]. 李海龙,刘建国,刘晓玲,张志峰. 中国水产科学. 2013(02)
[3]受孔雀石绿胁迫的近江牡蛎HSP90基因的表达变化[J]. 陈晨,张其中. 四川动物. 2011(06)
[4]国内诺如病毒胃肠炎暴发流行特征分析[J]. 桑少伟,赵仲堂,索继江,邢玉斌,贾宁,高岩,杜明梅,谢丽君,邓春燕,任世旺,刘运喜. 中华医院感染学杂志. 2011(20)
[5]内参基因在虾夷扇贝定量PCR中表达稳定性的比较[J]. 鲍相渤,刘卫东,姜冰,苏浩,李云峰,单忠国,于赫男,赫崇波. 水产科学. 2011(10)
[6]浙江省诺如病毒引起急性胃肠炎暴发的流行病学研究[J]. 徐旭卿,王臻,郑亚明,刘碧瑶. 疾病监测. 2011(09)
[7]重庆地区儿童诺如病毒基因型别特点研究[J]. 廖炀,陈军华,刘作义,彭哲,幸琳琳,张爱华,朱朝敏. 重庆医科大学学报. 2011(02)
[8]诺如病毒研究进展[J]. 南海,沈权,华修国,崔立. 上海畜牧兽医通讯. 2010(05)
[9]山东半岛地区贝类中诺如病毒污染状况与病毒鉴定初报[J]. 苏来金,马丽萍,徐仰丽,徐静,周德庆. 中国人兽共患病学报. 2010(05)
[10]长牡蛎养殖技术及常见问题[J]. 廉伟,毛玉泽. 现代农业科技. 2010(05)
本文编号：3549240
【文章来源】：中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
诺如病毒基因组结构示意图[15]
3.2.2 非结构蛋白ORF1 共 5.0 kb 左右，编码 200.0 kDa 左右的聚合非结构蛋白，由类 3C 的蛋白酶剪切成 6 个蛋白质元件，按照 N-C 的顺序，依次为蛋白 48（p48）、NTP 酶（NTPase）、蛋白 22（p22）、病毒基因组连接蛋白（VPg）、类 3C 蛋白酶（3CLpro）和 RNA 依赖的 RNA 聚合酶（RdRp）。该 ORF1 的 C 端蛋白较为保守，而 5’端基因序列和编码的蛋白在不同诺如病毒中变化很大。因此 C 端成为科研工作者扩增诺如病毒基因的常用位点。NTPase 又称为 p41，研究发现 NTPase 在胞外可以结合 ATP，但当 168 位的氨基酸突变后，该酶便失去活性。NTPase 没有解双链螺旋活性，故其虽可水解ATP，却不能使异源的双链 RNA:DNA 解螺旋。VPg 为 15 kDa 左右，可以共价结合诺如病毒基因组和亚基因组 mRNA，且缺少该蛋白的基因组 RNA 不具有感
11图 1-4 1 型和 2 型碳水化合物形成 ABO 血型抗原结构图[63]注：Gal-GlcNAc 为 N-乙酰乳糖胺，Gal-Glc 为乳糖基Fig. 1-4 NoV and H HBGA interaction
【参考文献】：
期刊论文
[1]长白和蓝塘猪印记基因IGF2和H19的时空表达研究[J]. 吴嫦丽,许继国,吴同山,卫恒习,李莉,李紫聪,吴珍芳,张守全. 华南农业大学学报. 2013(03)
[2]栉孔扇贝wnt4基因cDNA克隆及表达分析[J]. 李海龙,刘建国,刘晓玲,张志峰. 中国水产科学. 2013(02)
[3]受孔雀石绿胁迫的近江牡蛎HSP90基因的表达变化[J]. 陈晨,张其中. 四川动物. 2011(06)
[4]国内诺如病毒胃肠炎暴发流行特征分析[J]. 桑少伟,赵仲堂,索继江,邢玉斌,贾宁,高岩,杜明梅,谢丽君,邓春燕,任世旺,刘运喜. 中华医院感染学杂志. 2011(20)
[5]内参基因在虾夷扇贝定量PCR中表达稳定性的比较[J]. 鲍相渤,刘卫东,姜冰,苏浩,李云峰,单忠国,于赫男,赫崇波. 水产科学. 2011(10)
[6]浙江省诺如病毒引起急性胃肠炎暴发的流行病学研究[J]. 徐旭卿,王臻,郑亚明,刘碧瑶. 疾病监测. 2011(09)
[7]重庆地区儿童诺如病毒基因型别特点研究[J]. 廖炀,陈军华,刘作义,彭哲,幸琳琳,张爱华,朱朝敏. 重庆医科大学学报. 2011(02)
[8]诺如病毒研究进展[J]. 南海,沈权,华修国,崔立. 上海畜牧兽医通讯. 2010(05)
[9]山东半岛地区贝类中诺如病毒污染状况与病毒鉴定初报[J]. 苏来金,马丽萍,徐仰丽,徐静,周德庆. 中国人兽共患病学报. 2010(05)
[10]长牡蛎养殖技术及常见问题[J]. 廉伟,毛玉泽. 现代农业科技. 2010(05)
本文编号：3549240
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3549240.html
