念珠藻葛仙米藻蓝蛋白α与β亚基基因克
发布时间：2021-12-24 16:27
天然抗氧化剂对于清除人体内自由基、保障健康具有重要作用。藻蓝蛋白（phycocyanin, PC）是蓝藻等藻类细胞内的一类特殊色素蛋白,具捕获光能的功能。体外研究发现,藻蓝蛋白具有较显著的抗氧化、抑癌细胞增殖等生物活性。试验利用食源性的拟球状念珠藻葛仙米（Nostoc sphaeroides）的基因组DNA为材料,借助PCR扩增克隆葛仙米藻蓝蛋白两个重要亚基α与β基因,Ns-PC-α和Ns-PC-β。结果表明,葛仙米基因组中,Ns-PC-α和Ns-PC-β基因编码框长度分别为492 bp和522 bp;Ns-PC-α和Ns-PC-β基因以双顺反子形式存在,Ns-PC-α位于Ns-PC-β下游。Ns-PC-α和Ns-PC-β分别编码由163与173个氨基酸组成的蛋白。Ns-PC-α和Ns-PC-β亚基蛋白多肽链中共含有3个半胱氨酸残基（Ns-PC-α的第85位与Ns-PC-β中的第83位氨基酸残基和第154位氨基酸残基）,很可能是藻蓝胆素的结合位点。原核表达显示Ns-PC-α和Ns-PC-β分子量为近18 kD,Ns-PC-α比Ns-PC-β略小,与预测结果一致。模拟其高级结构,发现Ns...
【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
干季和湿季组的门分类组成
将所有样品根据季节分为干季(Dry)和湿季(Wet)2组(图2)。在门分类水平上，两组的优势分类群显示出相似的组成结构(图2)。绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes)在干季的丰度分别为9.81%、7.66%、6.56%和5.40%，高于这些分类群在湿季所占6.79%、6.26%、4.96%和0.55%的丰度(图2)。使用软件STAMP(v2.1.3)(Parks et al.,2014)对干、湿两季的菌群丰度进行显著差异分析(p<0.05)，发现细菌的相对丰度在干季显著高于湿季，而古菌在湿季则显著高于干季(图3A)。以及发现共有30个门、61个纲、75个目、88个科、115个属和41个种在2组之间显示出显著差异。显著差异的门分类(图3B)主要包括浮霉菌门(Planctomycetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、螺旋体门(Spirochaetes)、Latescibacteria和酸杆菌门(Acidobacteria)。其中只有放线菌门(Actinobacteria)表现为在干季组显著低于湿季组。在纲水平(图3C)，显著差异主要表现在γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、酸微菌纲(Acidimicrobiia)、硝化螺旋菌纲(Nitrospira)、Holophagae、噬纤维菌纲(Cytophagia)和厌氧绳菌纲(Anaerolineae)，前三者在湿季组中显著高于干季组，而后三者在干季组中显著高于湿季组(图3C)。
图6 微生物群落结构与pH,盐度(Salinity),温度(Temp),氧化还原电位(Eh)等环境因子的RDA香农指数和Chao1指数均表明干季红树林沉积物的微生物α多样性显著高于湿季(图4)。Ladau等(2013)的研究表明温带海洋中的微生物多样性在干季达到峰值。红树林位于海洋和陆地的交界处，受到潮汐的反复冲刷，因此受海洋环境的影响较大，北部湾红树林地处亚热带地区，这可能是红树林沉积物中微生物α多样性在干季较高的原因。PCoA也显示相比于同一采样区域，同一季节采集的样品之间具有更相似的微生物群落结构(图5)。以上α多样性和β多样性的分析表明了红树林沉积物的微生物群落结构在干季和湿季之间有较大的差异。
【参考文献】：
期刊论文
[1]芍药苷减轻四氯化碳诱导的急性肝损伤[J]. 郭心怡,尹昕茹,袁红梅,万敬员. 基因组学与应用生物学. 2018(08)
[2]油茶饼提取物的抗氧化活性研究及酚类化合物含量的测定[J]. 叶洲辰,吴友根,于靖,周开兵,林尤奋,王健,陈健妙,胡新文. 分子植物育种. 2017(09)
[3]七种藤黄科植物树皮抗氧化性及游离型总多酚、总黄酮含量的测定[J]. 刘子金,杨小波,苏凡,李东海,岑举人. 分子植物育种. 2016(12)
[4]葛仙米藻胆蛋白提高小鼠免疫功能的研究(英文)[J]. 程超,徐会,李伟,张秋萍,汪兴平. 食品科学. 2016(05)
[5]藻蓝蛋白抗氧化作用及其药理活性研究进展[J]. 夏冬,孙军燕,刘娜娜,刘冰,杜振宁. 海洋科学. 2015(07)
[6]重组别藻蓝蛋白（holo-apcB）的抗氧化活性研究[J]. 周孙林,陈华新,姜鹏,李富超,唐东山. 现代食品科技. 2014(08)
[7]藻蓝蛋白抑制血管平滑肌细胞过度增殖性管腔狭窄的机制研究[J]. 褚现明,冷敏,安毅,李冰,李丹,李永红,徐庆科,李健. 中国药理学通报. 2012(10)
[8]利用改良CTAB法提取澳洲坚果成熟叶片高质量DNA[J]. 郭凌飞,邹明宏,曾辉,杜丽清,陆超忠. 分子植物育种. 2007(S1)
[9]葛仙米藻蓝蛋白抗氧化作用研究[J]. 汪兴平,谢笔均,潘思轶,陈德文,赵利霞. 食品科学. 2007(12)
本文编号：3550818
【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
干季和湿季组的门分类组成
将所有样品根据季节分为干季(Dry)和湿季(Wet)2组(图2)。在门分类水平上，两组的优势分类群显示出相似的组成结构(图2)。绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes)在干季的丰度分别为9.81%、7.66%、6.56%和5.40%，高于这些分类群在湿季所占6.79%、6.26%、4.96%和0.55%的丰度(图2)。使用软件STAMP(v2.1.3)(Parks et al.,2014)对干、湿两季的菌群丰度进行显著差异分析(p<0.05)，发现细菌的相对丰度在干季显著高于湿季，而古菌在湿季则显著高于干季(图3A)。以及发现共有30个门、61个纲、75个目、88个科、115个属和41个种在2组之间显示出显著差异。显著差异的门分类(图3B)主要包括浮霉菌门(Planctomycetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、螺旋体门(Spirochaetes)、Latescibacteria和酸杆菌门(Acidobacteria)。其中只有放线菌门(Actinobacteria)表现为在干季组显著低于湿季组。在纲水平(图3C)，显著差异主要表现在γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、酸微菌纲(Acidimicrobiia)、硝化螺旋菌纲(Nitrospira)、Holophagae、噬纤维菌纲(Cytophagia)和厌氧绳菌纲(Anaerolineae)，前三者在湿季组中显著高于干季组，而后三者在干季组中显著高于湿季组(图3C)。
图6 微生物群落结构与pH,盐度(Salinity),温度(Temp),氧化还原电位(Eh)等环境因子的RDA香农指数和Chao1指数均表明干季红树林沉积物的微生物α多样性显著高于湿季(图4)。Ladau等(2013)的研究表明温带海洋中的微生物多样性在干季达到峰值。红树林位于海洋和陆地的交界处，受到潮汐的反复冲刷，因此受海洋环境的影响较大，北部湾红树林地处亚热带地区，这可能是红树林沉积物中微生物α多样性在干季较高的原因。PCoA也显示相比于同一采样区域，同一季节采集的样品之间具有更相似的微生物群落结构(图5)。以上α多样性和β多样性的分析表明了红树林沉积物的微生物群落结构在干季和湿季之间有较大的差异。
【参考文献】：
期刊论文
[1]芍药苷减轻四氯化碳诱导的急性肝损伤[J]. 郭心怡,尹昕茹,袁红梅,万敬员. 基因组学与应用生物学. 2018(08)
[2]油茶饼提取物的抗氧化活性研究及酚类化合物含量的测定[J]. 叶洲辰,吴友根,于靖,周开兵,林尤奋,王健,陈健妙,胡新文. 分子植物育种. 2017(09)
[3]七种藤黄科植物树皮抗氧化性及游离型总多酚、总黄酮含量的测定[J]. 刘子金,杨小波,苏凡,李东海,岑举人. 分子植物育种. 2016(12)
[4]葛仙米藻胆蛋白提高小鼠免疫功能的研究(英文)[J]. 程超,徐会,李伟,张秋萍,汪兴平. 食品科学. 2016(05)
[5]藻蓝蛋白抗氧化作用及其药理活性研究进展[J]. 夏冬,孙军燕,刘娜娜,刘冰,杜振宁. 海洋科学. 2015(07)
[6]重组别藻蓝蛋白（holo-apcB）的抗氧化活性研究[J]. 周孙林,陈华新,姜鹏,李富超,唐东山. 现代食品科技. 2014(08)
[7]藻蓝蛋白抑制血管平滑肌细胞过度增殖性管腔狭窄的机制研究[J]. 褚现明,冷敏,安毅,李冰,李丹,李永红,徐庆科,李健. 中国药理学通报. 2012(10)
[8]利用改良CTAB法提取澳洲坚果成熟叶片高质量DNA[J]. 郭凌飞,邹明宏,曾辉,杜丽清,陆超忠. 分子植物育种. 2007(S1)
[9]葛仙米藻蓝蛋白抗氧化作用研究[J]. 汪兴平,谢笔均,潘思轶,陈德文,赵利霞. 食品科学. 2007(12)
本文编号：3550818
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