克氏原螯虾在盐胁迫条件下差异化的microRNA表达谱的研究

发布时间：2021-12-25 08:59

　　目的近年盐碱地克氏原螯虾养殖业逐渐兴起,但是盐碱地水质高盐度是最严重的非生物胁迫之一,基础理论研究又比较薄弱导致养殖不善,使得克氏原螯虾大面积死亡,有些种类即使能存活,但生长差,产量较低而且不稳定。因此,探明盐碱胁迫条件下克氏原螯虾对养殖水环境的应激机制性, 利用基因工程提高克氏原螯虾的耐盐性,培育出适合在盐化土地上生长的克氏原螯虾品种是有效利用盐碱化土地对于提高盐碱地的克氏原螯虾产量具有积极的指导作用。方法本实验通过对淡水中生长的克氏原螯虾（A型）和盐水中生长的克氏原螯虾（B型）进行Solexa高通量测序,构建了其小RNA文库,从而获得了差异化的miRNA表达谱。通过分析测序结果,筛选出了受盐胁迫下上调和下调的miRNA,并利用qRT-PCR的方法对测序的结果进行了验证。结果：（1）Solexa测序一共获得了469,044个长度为18-30 nt的小RNA序列。根据生物信息学的方法筛选长度在18-22nt的RNA,和十足目的动物基因组的比对,我们获得了78种在整个动物界保守的miRNA,在这78种miRNA中8种在A型螯虾的体内特异性表达,18种miRNA在B型螯虾的体内特异性的表达... 

【文章来源】：南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 绪论
    1 克氏原螯虾概况和研究综述
        1.1 克氏原螯虾生物学简介
        1.2 克氏原螯虾的经济价值
        1.3 盐碱地克氏原螯虾养殖业发展现状
    2 miRNA研究进展概述
        2.1 miRNA的定义及发现历程
        2.2 miRNA的加工成熟过程及作用机制
        2.3 miRNA的生物学意义及前景展望
第二章 克氏原螯虾在盐胁迫条件下差异化的microRNA表达谱的研究
    2.1 实验材料
    2.2 主要试剂与仪器
    2.3 实验方法
        2.3.1 A型和B型克氏原螯虾总RNA的提取
        2.3.2 Solexa测序
        2.3.3 miRNA的qRT-PCR定量检测
        2.3.4 盐度渐变(驯化)条件下的重复验证
    2.4 数值的统计分析
    2.5 实验结果
        2.5.1. 使用Solexa测序技术构建克氏原螯虾的小RNA文库
        2.5.2 克氏原螯虾的miRNA表达谱
        2.5.3 使用qRT-PCR技术确证克氏原螯虾miRNA
        2.5.4 盐度渐变实验结果
    2.6 讨论
第三章 不同芜萍饵料组分对两种社群规模的螯虾生长影响
    3.1 材料与方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 实验分组
        3.1.3 实验条件
        3.1.4 数据统计
    3.2 结果与分析
        3.2.1 最小社群实验结果分析
        3.2.2 较大社群实验结果分析
        3.2.3 小社群和较大社群的比较
    3.3 讨论
第四章 小群体的规模对克氏原螯虾生存和生长的影响
    4.1 材料与方法
        4.1.1 材料
        4.1.2 实验分组
        4.1.3 实验方法
        4.1.4 数据统计
    4.2 结果与分析
        4.2.1 死亡事件发生率及个体存活率结果分析
        4.2.2 个体生长指标结果及分析
    4.3. 讨论
        4.3.1 实验组群体规模设置
        4.3.2 各群体死亡事件发生率分析
        4.3.3 生长状况分析
    4.4. 小结和应用
        4.4.1 小结
        4.4.2 应用
第五章 总结与展望
参考文献
攻读硕士学位期间项目经历
攻读硕士学位期间发表论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]不同芜萍饵料组分对两种社群规模的螯虾生长影响[J]. 季鹏飞,严幸云,黄成,唐建清.  安徽农业科学. 2012(22)
[2]克氏原螯虾母性抚育行为及食仔行为对子代的影响[J]. 熊青海,韦维婷,夏爱军,黄成.  水产科技情报. 2011(03)
[3]池塘养蟹应种草[J]. 张金建,孙贵江,张喜贵,于剑.  黑龙江水产. 2010(04)
[4]小龙虾的市场经济价值论述[J]. 邓泽召.  现代商贸工业. 2010(13)
[5]克氏原螯虾同步化与非同步化育苗效果分析[J]. 刘伟杰,严维辉,张成亮,黄成,唐建清.  安徽农业科学. 2008(34)
[6]克氏原螯虾繁殖生物学研究[J]. 龚世园,吕建林,孙瑞杰,李浪平,何绪刚.  淡水渔业. 2008(06)
[7]盐度变化对克氏原螯虾渗透调节影响机制的初步研究[J]. 金彩霞,潘鲁青.  水生生物学报. 2008(06)
[8]克氏原螯虾的食性、繁殖和栖息习性研究[J]. 谢文星,董方勇,谢山,黄道明,梁友光,胡传林.  水利渔业. 2008(04)
[9]蟹种池塘套养克氏原螯虾技术[J]. 周瑞和.  渔业致富指南. 2007(22)
[10]河蟹、克氏原螯虾池塘生态套养技术[J]. 刘本凤.  渔业致富指南. 2007(21)



本文编号：3552167