刺参（Apostichopus japonicus）疣足组织和皮肤组织的比较转录组分析

发布时间：2021-12-30 06:05

　　刺参隶属棘皮动物门（Echinoermata）,广泛分布于包括俄罗斯,日本,朝鲜以及中国在内的沿岸海域。目前,我国刺参的养殖产业日渐完善,蓬勃发展,2013年年产量就已超200亿元。刺参的发育、病害防治、育种等方面的研究已经取得了很多成果,但对于刺参分子生物学方面的研究仍然不够完善。刺参背部的疣足作为一个具有呼吸和与外界信息交换的中空锥形肉刺状组织,学者们很早就开始对其进行研究。刺参疣足的数目、排数是重要的经济性状。但目前为止,对刺参疣足的研究大多停留在组织形态学、解剖生物学和功能方面,从分子生物学水平上对刺参疣足的研究比较少见。为获得刺参疣足相关基因,本文选取刺参疣足附近的背部皮肤为对照,利用RNA-Seq技术对刺参（Apostichopus japonicus）疣足组织和皮肤组织两个组织样本的的转录组数据进行研究,得到结果如下:1.应用双端125bp Illumina Hiseq2500测序,在疣足组织和皮肤组织样本中分别得到33,504,127和37,384,685条Raw reads。质量控制后分别有30,657,027条和36,444,908条Clean reads。高质量的... 

【文章来源】：大连海洋大学辽宁省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

刺参（Apostichopusjaponicus）

基于RNA-Seq技术的研究内容Fig1-2ThepipelineofRNA-Seqresearch

本研究的技术路线

【参考文献】：
期刊论文
[1]我国海参产业现状分析[J]. 徐永东,李可闻.  渔业信息与战略. 2013(02)
[2]刺参虾青素基因的克隆及不同体色个体间表达差异的分析[J]. 赵鹤凌,杨红生,赵欢,刘石林.  海洋科学. 2012(03)
[3]nr数据库分析及其本地化[J]. 邓泱泱,荔建琦,吴松锋,朱云平,陈耀文,贺福初.  计算机工程. 2006(05)
[4]国内外海参自然资源、养殖状况及存在问题[J]. 张春云,王印庚,荣小军,孙惠玲,董树刚.  海洋水产研究. 2004(03)

博士论文
[1]基于高通量测序的刺参白化发生和子代体色分离研究[D]. 马得友.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2013

硕士论文
[1]基于RNA-Seq技术的人转录组分析研究[D]. 陈超.中南大学 2011



本文编号：3557627