青鱼MAVS的克隆及功能初探
发布时间：2022-01-01 01:02
MAVS（线粒体抗病毒信号蛋白）在宿主细胞抵御微生物病原体的固有免疫应答中扮演着一个重要的角色。在这篇研究中,我们克隆了青鱼MAVS的cDNA全长序列,并对MAVS的功能进行了初步研究。青鱼MAVS全长cDNA由2352个核苷酸组成,由软件预测的MAVS蛋白包含有579个氨基酸,分子量为62.4kDa,等电点4.83。结构分析显示青鱼MAVS的功能性结构域包括N端CARD结构域（半胱氨酸蛋白酶激活和募集结构域）,中间富脯氨酸结构域,假定的TRAF2结合位点和C端跨膜结构域,这与哺乳动物的MAVS相类似。序列比对显示青鱼MAVS与其它已知的鱼类和哺乳动物的MAVS的CARD结构域有着很高的相似性（53.3%-97.6%）,这也暗示了鱼类和哺乳动物的MAVS的CARD结构域具有保守性。青鱼MAVS在所有选定的组织中都有稳定表达,包括鳃、肾脏、心脏、肠、肝脏、肌肉、皮肤和脾脏;在GCRV和SVCV病毒感染后,肠、肝脏和肌肉组织中的青鱼MAVS mRNA水平明显提高,但是在感染GCRV和SVCV病毒的青鱼脾脏中的MAVS转录水平却下降了。在免疫印迹分析中,我们检测出青鱼MAVS蛋白在HEK29...
【文章来源】：湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
5’FullRaceKit原理图
图 2-2：3’RACE 原理图步骤具体如下：鱼脾脏总 RNA 提取。参照步骤（2.1.4.1）据2.3.1得到的青鱼mavs基因中间段序列设计克隆3’UTR内
26图 3-1：青鱼 MAVS 的全长 cDNA。青鱼 MAVS 全长 cDNA 由 2352 个核苷酸组成，预测的青鱼 MAVS 蛋白包含 579 个氨基酸。画框的是 CARD 结构域（10-93aa）,划线的是富脯氨酸结构域（106-209aa）;TRAF2 结合位点（322-325aa）是用双线标记的区域而划红线的区域是TM 结构域（558-575aa）。蛋白结构域的预测是通过在线软件 Simple Modular ArchitectureResearch Tool (SMART) (http://smart.embl-heidelberg.de/) ， Pfam database search(http://pfam.sanger.ac.uk/search)和 NCBI 的 CDD（Conserved Domain Database）数据库，而域内特性是通过 PROSITE 数据库 (http://us.expasy.org/tools/scanprosite)预测出来的。3.2 青鱼 MAVS 的进化研究为了分析 MAVS 的进化，我们将青鱼 MAVS 全长序列以及它的功能结构域—CARD 结构域，跨膜结构域（TM）和富脯氨酸结构域与其它物种的 MAVS 进
本文编号：3561342
【文章来源】：湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
5’FullRaceKit原理图
图 2-2：3’RACE 原理图步骤具体如下：鱼脾脏总 RNA 提取。参照步骤（2.1.4.1）据2.3.1得到的青鱼mavs基因中间段序列设计克隆3’UTR内
26图 3-1：青鱼 MAVS 的全长 cDNA。青鱼 MAVS 全长 cDNA 由 2352 个核苷酸组成，预测的青鱼 MAVS 蛋白包含 579 个氨基酸。画框的是 CARD 结构域（10-93aa）,划线的是富脯氨酸结构域（106-209aa）;TRAF2 结合位点（322-325aa）是用双线标记的区域而划红线的区域是TM 结构域（558-575aa）。蛋白结构域的预测是通过在线软件 Simple Modular ArchitectureResearch Tool (SMART) (http://smart.embl-heidelberg.de/) ， Pfam database search(http://pfam.sanger.ac.uk/search)和 NCBI 的 CDD（Conserved Domain Database）数据库，而域内特性是通过 PROSITE 数据库 (http://us.expasy.org/tools/scanprosite)预测出来的。3.2 青鱼 MAVS 的进化研究为了分析 MAVS 的进化，我们将青鱼 MAVS 全长序列以及它的功能结构域—CARD 结构域，跨膜结构域（TM）和富脯氨酸结构域与其它物种的 MAVS 进
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