黄颡鱼干扰素调节因子的鉴定及表达分析

发布时间：2022-01-02 17:41

　　黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）是我国重要的名优新淡水养殖品种。但近年来,随着养殖规模的扩大和养殖密度的提高,病害发生日趋严重,制约着黄颡鱼养殖业的健康发展。干扰素（interferon,IFN）反应是鱼类抵抗病原感染的第一道防线。干扰素调节因子（interferon regulatory factors,IRFs）调节干扰素及干扰素刺激效应基因的表达,在免疫反应中发挥重要作用。本研究克隆、鉴定了黄颡鱼IRF家族的13个基因。采用生物信息学方法分析了 IRFs基因的序列特征,通过荧光定量PCR检测了 IRF在正常黄颡鱼组织中的分布特点。分别用鲇爱德华氏菌（Edwardsiellaictaluri）、polyI:C和LPS诱导黄颡鱼,在诱导后不同时间段分析了脾和头肾中IRF表达量的变化。进一步针对IRF3、IRF7和IRF9开展了初步的功能研究:通过构建融合绿色荧光蛋白（GFP）或红色荧光蛋白（DsRed）的真核表达载体,研究了三者的亚细胞定位,以及IRF9和STAT1A、STAT1B、STAT2的定位关系。在过表达IRF3、IRF7和IRF9的细胞中,检测了 I... 

【文章来源】：湖北大学湖北省

【文章页数】：121 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
缩略语表
第1章 绪论
    1.1 鱼类干扰素简介
    1.2 干扰素调控因子简介
        1.2.1 脊椎动物干扰素调控因子简介
        1.2.2 鱼类干扰素调控因子简介
        1.2.3 干扰素调控因子的表达分布特点
        1.2.4 干扰素调控因子的功能
        1.2.5 鱼类干扰素调控因子的研究进展
    1.3 STATs功能简介
    1.4 鲇爱德华氏菌简介
    1.5 黄颡鱼研究概况
    1.6 本研究的目的与意义
第2章 材料和方法
    2.1 实验仪器和材料
        2.1.1 主要仪器
        2.1.2 实验材料
        2.1.3 载体和引物
        2.1.4 试剂和培养基的配制
    2.2 实验方法
        2.2.1 黄颡鱼IRF基因ORF的克隆
        2.2.2 黄颡鱼IRF基因的表达分析
        2.2.3 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9亚细胞定位
        2.2.4 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9在细胞内对干扰素的诱导表达
第3章 结果分析
    3.1 黄颡鱼IRF基因cDNA的克隆及序列分析
        3.1.1 黄颡鱼PfIRF1 cDNA的序列分析
        3.1.2 黄颡鱼PfIRF2A cDNA的序列分析
        3.1.3 黄颡鱼PfIRF2B cDNA的序列分析
        3.1.4 黄颡鱼PfIRF3 cDNA的序列分析
        3.1.5 黄颡鱼PfIRF4A cDNA的序列分析
        3.1.6 黄颡鱼PfIRF4B cDNA的序列分析
        3.1.7 黄颡鱼PfIRF4C cDNA的序列分析
        3.1.8 黄颡鱼PfIRF5 cDNA的序列分析
        3.1.9 黄颡鱼PfIRF6 cDNA的序列分析
        3.1.10 黄颡鱼PfIRF7 cDNA的序列分析
        3.1.11 黄颡鱼PfIRF8 cDNA的序列分析
        3.1.12 黄颡鱼PfIRF9 cDNA的序列分析
        3.1.13 黄颡鱼PfIRF10 cDNA的序列分析
        3.1.14 黄颡鱼PfIRF基因系统进化分析
    3.2 黄颡鱼IRF基因的表达分析
        3.2.1 正常黄颡鱼各组织中IRF基因的表达分析
        3.2.2 polyI:C诱导后黄颡鱼IRF基因的表达分析
        3.2.3 LPS诱导后黄颡鱼IRF基因的表达分析
        3.2.4 鲇爱德华氏菌诱导后黄颡鱼IRF基因的表达分析
    3.3 亚细胞定位
        3.3.1 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9亚细胞定位
        3.3.2 PfSTAT1A、PfSTAT1B、PfSTAT2亚细胞定位
        3.3.3 PfSTAT1A、PfSTAT1B、PfSTAT2与PfIRF9的共定位
    3.4 黄颡鱼PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9对EPC细胞IFN的诱导表达
第4章 讨论
    4.1 黄颡鱼IRF基因的序列特征
    4.2 黄颡鱼IRF基因的表达特性
    4.3 黄颡鱼IRF3、IRF7和IRF9的初步功能分析
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]斑马鱼IRF11基因的鉴定、亚细胞定位及表达特征[J]. 熊亚玮,张义兵,桂建芳.  水生生物学报. 2017(01)
[2]Gene cloning and induced expression pattern of IRF4 and IRF10 in the Asian swamp eel（Monopterus albus）[J]. Qiao-Qing XU,Dai-Qin YANG,Rui TUO,Jing WAN,Ming-Xian CHANG,Pin NIE.  Zoological Research. 2014(05)
[3]3种免疫增强剂对黄颡鱼非特异性免疫机能的影响[J]. 姚嘉赟,徐洋,盛鹏程,尹文林,蔺凌云,袁雪梅,潘晓艺,郝贵杰,沈锦玉.  安徽农业科学. 2014(10)
[4]黄颡鱼鮰爱德华氏菌的分离及鉴定[J]. 隗黎丽,吴华东,阮记明.  江西农业大学学报. 2014(01)
[5]2010年水产养殖病害发生情况与2011年流行趋势分析[J]. 陈爱平,刘富林,吴凡修.  中国水产. 2011(03)
[6]黄颡鱼鲇爱德华氏菌的分离鉴定及其致病性研究[J]. 徐进,罗晓松,曾令兵.  淡水渔业. 2009(06)
[7]黄颡鱼HSC70基因及其组织表达分析[J]. 张娟,张其中,张占会,崔淼.  水生生物学报. 2009(03)
[8]黄颡鱼生物学特性及养殖技术[J]. 王俊鹏.  内陆水产. 2008(08)

硕士论文
[1]鱼类干扰素调节因子4（IRF4）、5（IRF5）的抗病毒功能研究[D]. 艾克特.长江大学 2017



本文编号：3564604