尼罗罗非鱼MHC Iα和β 2 m基因cDNA的克
发布时间：2022-01-04 07:46
主要组织相容性复合体（Major Histocompatibility Complex，MHC）是存在于所有已知脊椎动物体内、与免疫功能密切相关的基因家族，由它编码的一类细胞表面转膜蛋白，能结合并呈递内源抗原和外源抗原给T淋巴细胞，激发机体免疫反应。本文以尼罗罗非鱼为研究对象，采用同源克隆、RACE-PCR、qPCR等技术，克隆了尼罗罗非鱼MHC α和β2m基因的cDNA，分析了MHC α和β2mcDNA的多态性，以及MHC α和β2m基因在健康尼罗罗非鱼各组织（脑、鳃、肝脏、肠、胃、肾脏、心脏、脾脏、皮肤和肌肉）中的分布以及感染无乳链球菌后基因在鳃、肾脏、心脏和脾脏中表达量的变化。结果如下：一、尼罗罗非鱼MHC α全长cDNA的克隆、多态性及组织表达分析获得的尼罗罗非鱼MHC α cDNA全长为1533bp,其开放阅读框（Open Reading Frame, ORF）为1053bp。编码的蛋白质分子包含信号肽、MHC结构域、IGc1结构域和跨膜区，并存在丰富的磷酸化位点。对氨基酸序列进行功能结构域分析的结果显示，1-18位为信号肽，209-283位为功能区（IGc1区），303-3...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
尼罗罗非鱼鳃组织总RNA，M:DL2000核酸分子量标准；1-3为不同个体的尼罗罗非M123
基酸序列进行功能结构域分析的结果显示，1-18 位为信号肽，209-283 位为功能区（IGc1 区），303-325 位为蛋白质的跨膜螺旋区（图 1-2）。图.1-2 尼罗罗非鱼 MHC α 蛋白质结构预测注：红色区域表示信号肽，黑灰色方框表示 MHC-I 结构域，绿色圆形区域表示 IGc1 结构域，蓝色表示跨膜螺旋区。Fig. 1-2 Nile tilapia MHC α protein structure prediction.Note: Red area indicates the signal peptide, black and gray box represents MHC-I domains, green circular2000 bp1000 bp18SSS28SM 1 2 3
图 1-6 目的基因和内参基因的标准曲线a:为目的基因的标准曲线，b:内参基因的标准曲线。Fig.1-6The standard curve of target gene and reference gene.a: the standard curve of the target gene, b: the standard curve of the reference gene.2.5 目的基因和内参基因的扩增曲线采用 qPCR 技术，分别检测目的基因和内参基因在不同样本中的表达丰度通过 ABI PRISM 7300 荧光定量 PCR 仪（美国 Applied Biosystems）分析得到环数与荧光强度的关系，结果见图 1-7。a.
【参考文献】：
期刊论文
[1]尼罗罗非鱼主要组织相容性复合体IA基因克隆与多态分析[J]. 李同明,周芬娜,崔志峰,季相山,王慧. 山东大学学报(理学版). 2013(11)
[2]罗非鱼链球菌病综合治疗方法初探[J]. 唐群,曾桂中,陆之泽. 广西畜牧兽医. 2013(03)
[3]赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析[J]. 沈铭辉,郑乐云,杜佳莹,王军. 厦门大学学报(自然科学版). 2013(01)
[4]红笛鲷主要组织相容性复合物Ⅰα抗原基因的克隆与表达分析[J]. 张新中,鲁义善,吴灶和,简纪常. 水产学报. 2012(10)
[5]圆斑星鲽MHCⅠα基因的克隆与组织表达分析[J]. 王娟,王宏伟,刘星,李宏俊,苏浩,高祥刚,赫崇波. 水产科学. 2011(08)
[6]军曹鱼MHC-Ⅰα基因全长cDNA的克隆及其组织表达分析[J]. 张鹤,茅莉娜,冯娟,管越强,许海东,苏友禄. 南方水产科学. 2011(01)
[7]建鲤MHC classⅠ基因全长cDNA的克隆与序列分析[J]. 周凯,张成锋,王建新,李冰,朱健. 淡水渔业. 2011(01)
[8]团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析[J]. 马晓茜,刘至治,李思发,唐文乔,杨金权. 上海海洋大学学报. 2011(01)
[9]广东与海南养殖罗非鱼无乳链球菌的分离、鉴定与特性分析[J]. 卢迈新,黎炯,叶星,邓国成,江小燕,田园园,赖翠玲. 微生物学通报. 2010(05)
[10]MHC基因对地方保护猪种抗病选育的应用前景[J]. 唐利洲,于龙,丁伟. 畜牧与饲料科学. 2010(02)
硕士论文
[1]赤点石斑鱼MHC基因的克隆与多态性分析[D]. 杜佳莹.厦门大学 2008
[2]大菱鲆受哈维氏弧菌感染后的基因差异表达研究[D]. 王传娟.中国海洋大学 2007
[3]草鱼β2m基因的分子克隆与MHC class Ⅰ多态性分析及其重组蛋白的鉴定[D]. 杨天耀.中国农业大学 2005
本文编号：3567974
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
尼罗罗非鱼鳃组织总RNA，M:DL2000核酸分子量标准；1-3为不同个体的尼罗罗非M123
基酸序列进行功能结构域分析的结果显示，1-18 位为信号肽，209-283 位为功能区（IGc1 区），303-325 位为蛋白质的跨膜螺旋区（图 1-2）。图.1-2 尼罗罗非鱼 MHC α 蛋白质结构预测注：红色区域表示信号肽，黑灰色方框表示 MHC-I 结构域，绿色圆形区域表示 IGc1 结构域，蓝色表示跨膜螺旋区。Fig. 1-2 Nile tilapia MHC α protein structure prediction.Note: Red area indicates the signal peptide, black and gray box represents MHC-I domains, green circular2000 bp1000 bp18SSS28SM 1 2 3
图 1-6 目的基因和内参基因的标准曲线a:为目的基因的标准曲线，b:内参基因的标准曲线。Fig.1-6The standard curve of target gene and reference gene.a: the standard curve of the target gene, b: the standard curve of the reference gene.2.5 目的基因和内参基因的扩增曲线采用 qPCR 技术，分别检测目的基因和内参基因在不同样本中的表达丰度通过 ABI PRISM 7300 荧光定量 PCR 仪（美国 Applied Biosystems）分析得到环数与荧光强度的关系，结果见图 1-7。a.
【参考文献】：
期刊论文
[1]尼罗罗非鱼主要组织相容性复合体IA基因克隆与多态分析[J]. 李同明,周芬娜,崔志峰,季相山,王慧. 山东大学学报(理学版). 2013(11)
[2]罗非鱼链球菌病综合治疗方法初探[J]. 唐群,曾桂中,陆之泽. 广西畜牧兽医. 2013(03)
[3]赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析[J]. 沈铭辉,郑乐云,杜佳莹,王军. 厦门大学学报(自然科学版). 2013(01)
[4]红笛鲷主要组织相容性复合物Ⅰα抗原基因的克隆与表达分析[J]. 张新中,鲁义善,吴灶和,简纪常. 水产学报. 2012(10)
[5]圆斑星鲽MHCⅠα基因的克隆与组织表达分析[J]. 王娟,王宏伟,刘星,李宏俊,苏浩,高祥刚,赫崇波. 水产科学. 2011(08)
[6]军曹鱼MHC-Ⅰα基因全长cDNA的克隆及其组织表达分析[J]. 张鹤,茅莉娜,冯娟,管越强,许海东,苏友禄. 南方水产科学. 2011(01)
[7]建鲤MHC classⅠ基因全长cDNA的克隆与序列分析[J]. 周凯,张成锋,王建新,李冰,朱健. 淡水渔业. 2011(01)
[8]团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析[J]. 马晓茜,刘至治,李思发,唐文乔,杨金权. 上海海洋大学学报. 2011(01)
[9]广东与海南养殖罗非鱼无乳链球菌的分离、鉴定与特性分析[J]. 卢迈新,黎炯,叶星,邓国成,江小燕,田园园,赖翠玲. 微生物学通报. 2010(05)
[10]MHC基因对地方保护猪种抗病选育的应用前景[J]. 唐利洲,于龙,丁伟. 畜牧与饲料科学. 2010(02)
硕士论文
[1]赤点石斑鱼MHC基因的克隆与多态性分析[D]. 杜佳莹.厦门大学 2008
[2]大菱鲆受哈维氏弧菌感染后的基因差异表达研究[D]. 王传娟.中国海洋大学 2007
[3]草鱼β2m基因的分子克隆与MHC class Ⅰ多态性分析及其重组蛋白的鉴定[D]. 杨天耀.中国农业大学 2005
本文编号：3567974
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