基于转录组探讨牛磺酸和甲硫氨酸亚矾胺对高血氨症大弹涂鱼的影响
发布时间：2022-01-05 23:22
本研究采用生理生化、分子生物学及组学技术,探究了大弹涂鱼（Boleophthalmus pectinirostris）氨中毒的生理机制,并就牛磺酸和甲硫氨酸亚矾胺（MSO）对氨氮的缓释作用做出了评估。本研究由以下三个实验组成:（1）急性氨氮胁迫下大弹涂鱼差异基因的比较转录组研究。以大弹涂鱼（12.58±0.12 g）为实验材料,开展为期96 h的氨氮胁迫实验,对肝脏样品进行比较转录组高通量测序。结果发现,共组装得到87 654个Unigene;通过比较不同处理组之间的转录组数据,共有10 149个基因呈现差异性表达,其中上调的有4 727个,下调的有5 467个;对差异表达的基因进行GO功能的富集分析,获得4 121个基因富集。结果表明,氨氮胁迫会导致大弹涂鱼炎性反应,牛磺酸和MSO均可以对氨中毒进行缓解,但解毒机制并不相同。（2）急性氨氮胁迫对大弹涂鱼免疫相关基因表达的影响。以大弹涂鱼（15.14±0.05）g为实验材料,开展为期96 h的氨氮胁迫实验。结果发现,大弹涂鱼96 h氨氮LC50为8.99 mg/L;TNF与IL-6基因表达量在胁迫后先下调,并于12...
【文章来源】：浙江海洋大学浙江省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
自然界中的氮素循环Fig.1Nitrogencycleinnature
基于转录组探讨牛磺酸和甲硫氨酸亚矾铵对高血氨症大弹涂鱼的影响之六十到百分之八十左右。我们常说的水中的氨氮指的是总氨氮，类别组成，离子氨和非离子氨。对于鱼类来说离子氨的毒性较弱，是水中的非离子氨，因为它具有脂溶性可以通过鳃膜扩散进体内。主要来源于鱼类的尿液中含有的尿素，经过氨化作用形成非离子氨在水体中的循环与陆地中大同小异。主要的差异存在于在水产养殖高浮游植物的数量，增加初级生产力，所以需要定期的向水体中添样一来，氮肥中的含氮有机物在水中经过微生物的分解，就会形成氨化作用和硝化作用返还会大气中。在水产养殖中，水体环境较小、集约型循环水养殖环境、饵料投放等多种原因都可能会导致水中从而诱发鱼病。鱼类在养殖过程中经常会处于高氨的环境下，导致浓度升高，变成氨氮胁迫。无论是急性的氨氮胁迫还是慢性的氨氮鱼类的生长发育和生理过程，导致鱼类的生长减缓甚至停止，肝和会发生一定程度的病变［9］，易感病、免疫力低下等症状［10］。
图 2-1-1 Trinity 组装程序原理图Fig.2-1-1 Trinity assembly program schematic diagram.因功能注释 BLAST［54］软件将 Unigene 序列与 Non-Redundant Dataset (NR,w.ncbi.nlm.nih.gov)［55］、Swiss-Prot(http://www.expasy.ch/sprot)［56］、G(http://www.geneontology.org/GO)［57］、Clusters of Orthologous Groups(w.ncbi.nlm.nih.gov/COG)［58］、KOG（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/KOGNOG4.5（http://eggnogdb.embl.de/）［60］、Kyoto Encyclopaedia of Gene(KEGG, http://www.genome.jp/kegg)［61］数据库比对，使用 KOBAS2.0［e 在 KEGG 中的 KEGG Orthology 结果，预测完 Unigene 的氨基酸序列 HMMER［63］（http://hmmer.org/）软件与 Pfam［64］(http://pfam.xfam.org获得 Unigene 的注释信息。通过数据库比对，对 Unigene 进行注释分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]纹缟虾虎鱼对Cu2+、Cd2+和氨氮的毒性响应和敏感性分析[J]. 郝雅,朱丽岩,巩文静,韩萃,江田田. 生态毒理学报. 2016(06)
[2]孕鼠补充牛磺酸对生长受限胎鼠脑组织IL-6、IL-8、TNF-α和IL-1β水平的影响及临床意义探讨[J]. 王华伟,刘敬. 中国儿童保健杂志. 2017(01)
[3]蛋白营养对工业养殖大菱鲆（Scophthatmus maximus L.）幼鱼生长、氨氮排泄及肌肉氨基酸的效应[J]. 张静,高婷婷,李勇,赵宁宁,马骏. 渔业科学进展. 2016(06)
[4]饲料维生素C含量对圆斑星鲽幼鱼抗氨氮胁迫能力的影响[J]. 王贞杰,叶保民,常青,陈四清,刘长琳,胡建成,严俊丽,卢斌. 动物营养学报. 2016(12)
[5]基于转录组测序对茶树GST基因表达的研究[J]. 张亚真,韦康,王丽鸳,成浩. 茶叶科学. 2016(05)
[6]利用MISA工具对不同类型序列进行SSR标记位点挖掘的探讨[J]. 王希,陈丽,赵春雷. 中国农学通报. 2016(10)
[7]氨氮对斑马鱼3种酶活性和基因表达的影响[J]. 周莹,孙梨宗,刘志红,台培东,李玥莹. 沈阳师范大学学报(自然科学版). 2016(01)
[8]鱼类白介素（IL-1β）及干扰素（IFN）重组质粒构建及联合应用研究[J]. 闫春梅,郑伟,杜晓燕,肖志国,李忠强,熊占山,刘长有,李秀颖,刘慧吉. 黑龙江水产. 2015(06)
[9]氨氮胁迫对福瑞鲤幼鱼GST活性的影响[J]. 李利红,袁宏利,胡振平,武雨欣. 水产养殖. 2015(10)
[10]慢性氨氮胁迫对吉富罗非鱼幼鱼生长、免疫及代谢的影响[J]. 肖炜,李大宇,徐杨,邹芝英,祝璟琳,韩珏,杨弘. 南方水产科学. 2015(04)
博士论文
[1]血清标志物TNF-α及IL-6水平与妊娠期高血压的相关性研究[D]. 李园.山东大学 2017
[2]TNF-α通过microRNAs导致骨质疏松中骨髓间充质干细胞分化缺陷的机制研究[D]. 廖立.第四军医大学 2016
硕士论文
[1]芪参通络饮对稳定型心绞痛患者（气虚血瘀型）临床疗效观察及对血清GSH-Px、LPO的影响[D]. 王洋.黑龙江中医药大学 2017
[2]玉米高通量测序数据SNP检测流程的优化及应用[D]. 李坦.南京农业大学 2015
[3]养殖池塘中氨氮降解有益微生物的分离与鉴定[D]. 薛菲菲.中国海洋大学 2014
[4]摄食水平、氨氮胁迫对梭鱼幼鱼生长的影响及其毒理效应研究[D]. 黄厚见.上海海洋大学 2012
[5]先天性心脏病斑马鱼模型转录组测序分析[D]. 罗书萌.中国科学院北京基因组研究所 2012
本文编号：3571237
【文章来源】：浙江海洋大学浙江省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
自然界中的氮素循环Fig.1Nitrogencycleinnature
基于转录组探讨牛磺酸和甲硫氨酸亚矾铵对高血氨症大弹涂鱼的影响之六十到百分之八十左右。我们常说的水中的氨氮指的是总氨氮，类别组成，离子氨和非离子氨。对于鱼类来说离子氨的毒性较弱，是水中的非离子氨，因为它具有脂溶性可以通过鳃膜扩散进体内。主要来源于鱼类的尿液中含有的尿素，经过氨化作用形成非离子氨在水体中的循环与陆地中大同小异。主要的差异存在于在水产养殖高浮游植物的数量，增加初级生产力，所以需要定期的向水体中添样一来，氮肥中的含氮有机物在水中经过微生物的分解，就会形成氨化作用和硝化作用返还会大气中。在水产养殖中，水体环境较小、集约型循环水养殖环境、饵料投放等多种原因都可能会导致水中从而诱发鱼病。鱼类在养殖过程中经常会处于高氨的环境下，导致浓度升高，变成氨氮胁迫。无论是急性的氨氮胁迫还是慢性的氨氮鱼类的生长发育和生理过程，导致鱼类的生长减缓甚至停止，肝和会发生一定程度的病变［9］，易感病、免疫力低下等症状［10］。
图 2-1-1 Trinity 组装程序原理图Fig.2-1-1 Trinity assembly program schematic diagram.因功能注释 BLAST［54］软件将 Unigene 序列与 Non-Redundant Dataset (NR,w.ncbi.nlm.nih.gov)［55］、Swiss-Prot(http://www.expasy.ch/sprot)［56］、G(http://www.geneontology.org/GO)［57］、Clusters of Orthologous Groups(w.ncbi.nlm.nih.gov/COG)［58］、KOG（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/KOGNOG4.5（http://eggnogdb.embl.de/）［60］、Kyoto Encyclopaedia of Gene(KEGG, http://www.genome.jp/kegg)［61］数据库比对，使用 KOBAS2.0［e 在 KEGG 中的 KEGG Orthology 结果，预测完 Unigene 的氨基酸序列 HMMER［63］（http://hmmer.org/）软件与 Pfam［64］(http://pfam.xfam.org获得 Unigene 的注释信息。通过数据库比对，对 Unigene 进行注释分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]纹缟虾虎鱼对Cu2+、Cd2+和氨氮的毒性响应和敏感性分析[J]. 郝雅,朱丽岩,巩文静,韩萃,江田田. 生态毒理学报. 2016(06)
[2]孕鼠补充牛磺酸对生长受限胎鼠脑组织IL-6、IL-8、TNF-α和IL-1β水平的影响及临床意义探讨[J]. 王华伟,刘敬. 中国儿童保健杂志. 2017(01)
[3]蛋白营养对工业养殖大菱鲆（Scophthatmus maximus L.）幼鱼生长、氨氮排泄及肌肉氨基酸的效应[J]. 张静,高婷婷,李勇,赵宁宁,马骏. 渔业科学进展. 2016(06)
[4]饲料维生素C含量对圆斑星鲽幼鱼抗氨氮胁迫能力的影响[J]. 王贞杰,叶保民,常青,陈四清,刘长琳,胡建成,严俊丽,卢斌. 动物营养学报. 2016(12)
[5]基于转录组测序对茶树GST基因表达的研究[J]. 张亚真,韦康,王丽鸳,成浩. 茶叶科学. 2016(05)
[6]利用MISA工具对不同类型序列进行SSR标记位点挖掘的探讨[J]. 王希,陈丽,赵春雷. 中国农学通报. 2016(10)
[7]氨氮对斑马鱼3种酶活性和基因表达的影响[J]. 周莹,孙梨宗,刘志红,台培东,李玥莹. 沈阳师范大学学报(自然科学版). 2016(01)
[8]鱼类白介素（IL-1β）及干扰素（IFN）重组质粒构建及联合应用研究[J]. 闫春梅,郑伟,杜晓燕,肖志国,李忠强,熊占山,刘长有,李秀颖,刘慧吉. 黑龙江水产. 2015(06)
[9]氨氮胁迫对福瑞鲤幼鱼GST活性的影响[J]. 李利红,袁宏利,胡振平,武雨欣. 水产养殖. 2015(10)
[10]慢性氨氮胁迫对吉富罗非鱼幼鱼生长、免疫及代谢的影响[J]. 肖炜,李大宇,徐杨,邹芝英,祝璟琳,韩珏,杨弘. 南方水产科学. 2015(04)
博士论文
[1]血清标志物TNF-α及IL-6水平与妊娠期高血压的相关性研究[D]. 李园.山东大学 2017
[2]TNF-α通过microRNAs导致骨质疏松中骨髓间充质干细胞分化缺陷的机制研究[D]. 廖立.第四军医大学 2016
硕士论文
[1]芪参通络饮对稳定型心绞痛患者（气虚血瘀型）临床疗效观察及对血清GSH-Px、LPO的影响[D]. 王洋.黑龙江中医药大学 2017
[2]玉米高通量测序数据SNP检测流程的优化及应用[D]. 李坦.南京农业大学 2015
[3]养殖池塘中氨氮降解有益微生物的分离与鉴定[D]. 薛菲菲.中国海洋大学 2014
[4]摄食水平、氨氮胁迫对梭鱼幼鱼生长的影响及其毒理效应研究[D]. 黄厚见.上海海洋大学 2012
[5]先天性心脏病斑马鱼模型转录组测序分析[D]. 罗书萌.中国科学院北京基因组研究所 2012
本文编号：3571237
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3571237.html
