中华绒螯蟹转铁蛋白在螺原体致病过程中的功能研究
发布时间:2022-01-08 07:13
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)即河蟹、大闸蟹,在我国淡水养殖业中占有相当大的比重,能够创造巨大的经济价值。近年来,伴随养殖规模不断扩大、养殖密度迅速增加,中华绒螯蟹的患病几率也大大增加,主要由细菌、病毒和寄生虫引起。其中,中华绒螯蟹螺原体(Spiroplasma ericheiris)作为一种新型致病菌,能引发中华绒螯蟹患“颤抖病”,所造成的危害最为严重。基于前期中华绒螯蟹血细胞免疫蛋白组学筛选结果可知,转铁蛋白(EsTTF)以及铁蛋白(EsFe1、EsFe2)在螺原体感染中华绒螯蟹后,在血细胞中的表达量发生显著变化。此外,先前已有报道证实转铁蛋白和铁蛋白曾参与了其他物种宿主的免疫反应。综上所述,我们推断EsTF、EsFe1和EsFe2极有可能在中华绒螯蟹的免疫防御机制中发挥的重要的作用。本论文首先通过基因克隆及生物信息学分析的方法,对EsTF的生物学特性进行了研究。其次,通过qRT-PCR的方法检测外源补充铁元素及螺原体刺激后EsTF、EsFe1和EsFe2的表达变化。依据实验结果,我们初步推断这三个蛋白以及铁元素可能在抵御螺原体侵染中华绒螯蟹的免疫反应中发挥了作...
【文章来源】:南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】:62 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.2?EsTF的TR_FER结构域示意图
框(OpenReadingFrame,ORF),是一段能编码730个氦基酸的多肽。结果显示??3’端有含有646匕口的非翻译区(1111的1151311〇11比§1〇11,1]丁1〇以及典型的0〇1丫八??的尾巴,5’端则包含135bp的UTR(图2.1)。预测该蛋白质分子量为79.59?kDa,??等电点为6.87。SMART网站预测该蛋白第21到第369个以及第371到709个??氨基酸残基均为TR_FER结构域(图2.2)。??0?100?200?300?400?500?600?700??图2.2?EsTF的TR_FER结构域示意图。??Fig.2.2?TR_FER?domain?of?EsTF?predicted?by?SMART.??2.3.3?EsTF基因编码蛋白信号肽预测??通过Signal?P在线软件可知,EsTF蛋白的信号肽位于卜19氨基酸,第20??个氨基酸位点是信号肽剪切位点(图2.3)。??9gnalP-4.1?prediction?(euknetworks):?Sequence?? ̄?C-score'? ̄??10?■?,?Sscore??????一广、?、?Y-score????08???v:?-??0.6?■?'Ji?-??“?:??02???-??0.0.iiiiiiiiiiiiililiiiiii_iiMniiWTMmM??MRAVFLCVSVA?LA?A?S?L?AHQVV?RLCV?PEOQIQPCT?EULRD?PSLANLT?VOCVSGPDRYQC?LEKLAAKEVDV^??0?10?20?30?4
占33.56%?(蓝色部分),延伸链占13.70°/。(红色部分),随机卷曲占52.74%?(紫??色部分)。在Transferrin蛋白整个多肽链中并没有突出的?螺旋结构,最主要??成分是随机卷曲的结构(图2.4)。??0?iee?2ee?3ee?柳?see?m??图2.4?EsTF氨基酸序列二级结构预测??Fig.2.4?EsTF?amino?acid?sequence?of?secondary?structure?prediction??2.3.5?EsTF基因序列同源性分析??通过DNAMAN多序列比对可以发现,EsTF的蛋白序列与美洲鲎(Ziww/w??/?〇細/zewws)以及蚤状潘(Dop/zw'apw/a:)序列的相似性在40%以上,并且具有相??同的TR_FER结构域,说明该蛋白的在进化中非常保守(图2.5)。??22??
【参考文献】:
期刊论文
[1]虾蟹新型病原螺原体的发现和研究[J]. 王文. 南京师大学报(自然科学版). 2016(01)
[2]家蝇转铁蛋白基因的克隆和生物信息学分析[J]. 龚晓林,张洁,李显航,刘红美. 生物信息学. 2012(04)
[3]长江水系中华绒螯蟹种质资源研究进展[J]. 李晓晖,许志强,葛家春,朱清顺,潘建林. 水产养殖. 2009(10)
[4]中华绒螯蟹营养需求的研究现状和进展[J]. 陈立侨,李二超. 饲料工业. 2009(10)
[5]螺原体的分类及其生物多样性研究进展[J]. 于汉寿,刘淑园,阮康勤,陈永萱,王志伟. 微生物学报. 2009(05)
[6]Liver iron transport[J]. Ross M Graham,Anita CG Chua,Carly E Herbison,John K Olynyk,Debbie Trinder. World Journal of Gastroenterology. 2007(35)
[7]铁元素的生理功能及其研究进展[J]. 石文艳,潘晓亮,万鹏程. 畜牧兽医科技信息. 2005(03)
[8]中华绒螯蟹颤抖病研究进展[J]. 方敏,宋林生,崔朝霞. 海洋科学. 2005(01)
[9]锌铜铁对水产动物免疫机能的影响[J]. 许安阳,王安利. 水产科学. 2004(09)
[10]湖泊放养长江水系中华绒螯蟹的性成熟规律研究[J]. 李思发,王成辉,赵乃刚. 水生生物学报. 2001(04)
硕士论文
[1]河蟹血细胞中螺原体侵染相关蛋白筛选及Rab7、14-3-3蛋白功能研究[D]. 候利波.南京师范大学 2016
[2]铁对幼建鲤消化吸收功能、免疫功能和抗氧化能力的影响[D]. 凌娟.四川农业大学 2009
本文编号:3576121
【文章来源】:南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】:62 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.2?EsTF的TR_FER结构域示意图
框(OpenReadingFrame,ORF),是一段能编码730个氦基酸的多肽。结果显示??3’端有含有646匕口的非翻译区(1111的1151311〇11比§1〇11,1]丁1〇以及典型的0〇1丫八??的尾巴,5’端则包含135bp的UTR(图2.1)。预测该蛋白质分子量为79.59?kDa,??等电点为6.87。SMART网站预测该蛋白第21到第369个以及第371到709个??氨基酸残基均为TR_FER结构域(图2.2)。??0?100?200?300?400?500?600?700??图2.2?EsTF的TR_FER结构域示意图。??Fig.2.2?TR_FER?domain?of?EsTF?predicted?by?SMART.??2.3.3?EsTF基因编码蛋白信号肽预测??通过Signal?P在线软件可知,EsTF蛋白的信号肽位于卜19氨基酸,第20??个氨基酸位点是信号肽剪切位点(图2.3)。??9gnalP-4.1?prediction?(euknetworks):?Sequence?? ̄?C-score'? ̄??10?■?,?Sscore??????一广、?、?Y-score????08???v:?-??0.6?■?'Ji?-??“?:??02???-??0.0.iiiiiiiiiiiiililiiiiii_iiMniiWTMmM??MRAVFLCVSVA?LA?A?S?L?AHQVV?RLCV?PEOQIQPCT?EULRD?PSLANLT?VOCVSGPDRYQC?LEKLAAKEVDV^??0?10?20?30?4
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【参考文献】:
期刊论文
[1]虾蟹新型病原螺原体的发现和研究[J]. 王文. 南京师大学报(自然科学版). 2016(01)
[2]家蝇转铁蛋白基因的克隆和生物信息学分析[J]. 龚晓林,张洁,李显航,刘红美. 生物信息学. 2012(04)
[3]长江水系中华绒螯蟹种质资源研究进展[J]. 李晓晖,许志强,葛家春,朱清顺,潘建林. 水产养殖. 2009(10)
[4]中华绒螯蟹营养需求的研究现状和进展[J]. 陈立侨,李二超. 饲料工业. 2009(10)
[5]螺原体的分类及其生物多样性研究进展[J]. 于汉寿,刘淑园,阮康勤,陈永萱,王志伟. 微生物学报. 2009(05)
[6]Liver iron transport[J]. Ross M Graham,Anita CG Chua,Carly E Herbison,John K Olynyk,Debbie Trinder. World Journal of Gastroenterology. 2007(35)
[7]铁元素的生理功能及其研究进展[J]. 石文艳,潘晓亮,万鹏程. 畜牧兽医科技信息. 2005(03)
[8]中华绒螯蟹颤抖病研究进展[J]. 方敏,宋林生,崔朝霞. 海洋科学. 2005(01)
[9]锌铜铁对水产动物免疫机能的影响[J]. 许安阳,王安利. 水产科学. 2004(09)
[10]湖泊放养长江水系中华绒螯蟹的性成熟规律研究[J]. 李思发,王成辉,赵乃刚. 水生生物学报. 2001(04)
硕士论文
[1]河蟹血细胞中螺原体侵染相关蛋白筛选及Rab7、14-3-3蛋白功能研究[D]. 候利波.南京师范大学 2016
[2]铁对幼建鲤消化吸收功能、免疫功能和抗氧化能力的影响[D]. 凌娟.四川农业大学 2009
本文编号:3576121
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