基于线粒体COI基因序列研究口虾蛄群体的遗传多样性及微卫星引物的开发

发布时间：2022-01-08 15:44

　　口虾蛄隶属于虾蛄科，口虾蛄属，广泛分布于印度洋-太平洋海域。口虾蛄因其肉味鲜美和营养丰富，是一种具有较高经济价值的优良野生品种。对采自皮口、绥中、青岛和广州4个海域的口虾蛄群体的线粒体CO I基因序列进行扩增和测序，比较并分析了其遗传多样性和系统进化关系。研究获得585bp的口虾蛄线粒体CO I基因序列，变异位点54个，占总位点数的9.2%。CO I基因序列A+T含量（64.8%）显著高于G+T含量（35.2%），符合节肢动物线粒体DNA碱基组成的特点。转换与颠换的平均比值是7.84，碱基替换未达到饱和。100个样本的线粒体CO I基因序列共定义35个单倍型，单倍型多样性（Hd）为0.9616，平均核苷酸多样性（π）为0.02027。4个群体均具有高的单倍型多样性和低的核苷酸多样性的特点，说明4个海域口虾蛄的遗传多样性均处于中等水平，但广州海域的遗传多样性水平最高。AMOVA分析表明，来自于群体间的遗传差异（84.53%）明显高于来自群体内的差异（15.47%）。遗传分化系数（Fst）表明皮口、绥中、青岛3个海域间几乎没有发生分化（Fst＜0），而广州海域口虾蛄遗传分化较大。从Genb... 

【文章来源】：大连海洋大学辽宁省

【文章页数】：48 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

同工酶实验操作流程

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RFLP标记基本原理

【参考文献】：
期刊论文
[1]口虾蛄乙酸乙酯提取物联合阿霉素或顺铂对人肝癌HepG2细胞的增殖抑制效应研究[J]. 邵松军,李明勇,张湘宁,黄培春.  中国医药生物技术. 2013(05)
[2]口虾蛄提取物对人鼻咽癌细胞迁移和体外血管生成拟态的抑制作用[J]. 孔霞,尚九龙,李丽,吴孟晏,别延红,顾帝水.  中国病理生理杂志. 2013(06)
[3]黄海海域口虾蛄种群的遗传多样性[J]. 张代臻,丁鸽,周婷婷,杨文娟,李佳,彭旭,唐伯平.  动物学杂志. 2013(02)
[4]浙江南部近岸海域春季口虾蛄（Oratosquilla oratoria）生物量的时空分布[J]. 潘国良,张龙,朱增军,王忠明,张洪亮.  海洋与湖沼. 2013(02)
[5]江苏连云港与盐城海域口虾蛄种群的遗传多样性[J]. 张代臻,丁鸽,彭旭,周婷婷,杨文娟,曹金,李佳,刘超,黄楠,殷剑锋,唐伯平.  四川动物. 2013(01)
[6]三疣梭子蟹微卫星标记与生长相关性状的相关性分析[J]. 刘磊,李健,刘萍,赵法箴,高保全,杜盈,马春艳.  水产学报. 2012(07)
[7]脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 贾舒雯,刘萍,韩智科,李健,潘鲁青.  水产学报. 2011(12)
[8]口虾蛄肝胰脏超氧化物歧化酶的分离纯化及部分性质的研究[J]. 柯佳颖,陈细香,陈寅山,戴聪杰.  水产科学. 2011(09)
[9]基于线粒体DNA部分片段探讨条石鲷与斑石鲷的亲缘关系[J]. 肖志忠,肖永双,马道远,徐世宏,刘清华,李军.  海洋学报(中文版). 2011(05)
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博士论文
[1]栉孔扇贝（Chlamys farreri）微卫星标记的筛选及应用[D]. 战爱斌.中国海洋大学 2007

硕士论文
[1]脊尾白虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析[D]. 贾舒雯.中国海洋大学 2012
[2]利用微卫星标记对六个湖北省地方鸡群遗传多样性的研究[D]. 邓呈逊.华中农业大学 2005



本文编号：3576830