蓝藻ITS序列拷贝类型、进化关系及系统学适用性分析

发布时间：2022-01-11 23:24

　　蓝藻16S rRNA-23S rRNA基因间隔区（16S rRNA-23S rRNAinternal transcribedspacer, ITS）序列在长度和碱基组成上具有较高的变异性，因此有学者将其应用于蓝藻分类鉴定及系统发育研究。然而目前报道的蓝藻ITS序列拷贝分布情况以及不同拷贝类型间进化关系分析等数据有限，且ITS序列是否适用于蓝藻种水平分类阶元的研究亦存在争议。鉴于以上原因，本课题就蓝藻ITS序列的拷贝分布情况、不同拷贝类型之间的进化关系及其系统学研究适用性进行分析。采用形态学方法和基于16S rRNA基因的分子生物学方法对24株蓝藻样品进行分类鉴定；PCR扩增检测ITS序列拷贝分布情况；割胶回收扩增的拷贝条带并克隆测序。结果显示：（1）蓝藻的ITS序列至少存在三种拷贝类型，即ITS-IA型（同时携带tRNAIle和tRNAAla编码区的ITS）、ITS-I型（只携带tRNAIle编码区的ITS）、ITS-N型（无tRNA编码区的ITS）；（2）色球藻目藻株的ITS序列均为单一拷贝类型（仅有ITS-IA或ITS-I型）；颤藻目藻株的ITS序列为单一拷贝类型（仅有ITS-IA... 

【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

rrn操纵子的结构示意图

蓝藻样品2-E4—7-D616SrRNA基因PCR扩增琼脂糖凝胶电泳分析

蓝藻样品3-H3—6-D616SrRNA基因PCR扩增琼脂糖凝胶电泳分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]苏铁珊瑚根共生念珠藻ITS序列多拷贝研究[J]. 粟绒,焦淑静,黄现恩,张青,史全良.  现代生物医学进展. 2014(15)
[2]基于ITS序列分析对紫花地丁的分子鉴别[J]. 朱烨,张春,庄元春,税丕先.  中华中医药杂志. 2013(04)
[3]天麻ITS-1测序及单核苷酸多态性变异位点分析[J]. 王德信.  生物技术. 2012(05)
[4]地木耳实用价值的研究[J]. 袁云香.  农产品加工(学刊). 2011(12)
[5]微囊藻毒素神经毒理学研究进展[J]. 居静娟,浦跃朴,尹立红,王大勇.  生态毒理学报. 2011(01)
[6]不同生长基质中叶状地衣共生藻的分离与鉴定[J]. 张青,史全良.  生态环境学报. 2010(12)
[7]地衣中共生念珠藻多拷贝序列的初步分析[J]. 史全良,卜复鸣,韩梅.  苏州大学学报(自然科学版). 2005(04)
[8]AFLP分子标记技术的发展及其在海洋生物中的应用[J]. 王伟继,岳志芹,孔杰,王清印.  海洋水产研究. 2005(01)
[9]聚球藻（Synechococcus）分子生态学研究进展[J]. 马英,焦念志.  自然科学进展. 2004(09)
[10]脂类分析在海洋微藻化学分类学上的研究进展[J]. 徐继林,严小军.  海洋通报. 2004(02)

博士论文
[1]蓝藻念珠藻属系统发育和分子进化研究[D]. 韩丹翔.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2006

硕士论文
[1]蓝藻16S rRNA-23S rRNA基因间隔区序列（ITS）多拷贝分析[D]. 粟绒.苏州大学 2013
[2]蓝藻型地衣及其共生念珠藻的分子鉴定和系统发育分析[D]. 雷海燕.苏州大学 2009
[3]生物结皮中蓝藻多样性及其环境应用研究[D]. 苏振宏.西北师范大学 2006



本文编号：3583642