凡纳滨对虾LvJNK沉默的转录组比较和3种lvp38亚型的功能分析
发布时间：2022-01-14 02:08
凡纳滨对虾是水产养殖业主要的养殖品种,也是水产行业主要的经济种类。然而,对虾的各种病害时刻影响对虾产业持续稳定健康的发展,因此,致力于对虾抗病基因及其相关免疫功能基因的研究,能够为对虾病害的防治提供重要的理论基础。转录组测序可以分析特定生理条件下细胞内所有mRNA的表达水平,因此可以应用于不同实验条件下特定基因在mRNA表达水平的比较分析。在哺乳动物研究中JNK信号通路是细胞内重要的信号通路,能够参与许多细胞活动。在前期对虾的研究发现,LvJNK可以被WSSV病毒激活利用。为了深入全面的了解LvJNK在WSSV感染过程中的作用机制,本研究基于二代测序平台,通过RNA-seq技术手段进行转录组差异比较分析LvJNK在WSSV感染中的关联基因及可能参与的生物学过程。通过转录组差异比较分析共筛选得到230条差异基因,其中112条基因表达上调,118条基因表达下调。随后进一步分析了与JNK功能密切相关且已有相关研究报道的部分差异基因,同时对差异基因进行GO功能分类和KEGG富集分析。以上研究为后续对虾JNK通路的深入研究奠定了良好的基础。p38是MAPK家族中关键的应激活化蛋白激酶,可以被多种...
【文章来源】：自然资源部第三海洋研究所福建省
【文章页数】：126 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
WSSV结构示意图
图 2 WSSV 中国大陆株基因组结构图[7]Fig.2 The genomic structure of the WSSV-CN strainsSSV 功能基因研究SSV 基因编码的蛋白，主要分为结构蛋白和非结构蛋白。结构蛋白主要蛋白、核衣壳蛋白和被膜蛋白三种，可以维持病毒构型，保护核酸，还病毒对组织及细胞的识别、吸附和侵入。非结构蛋白主要是与催化、调酶和蛋白。WSSV 的囊膜蛋白至少由 35 种构成，其中最重要的是 VP26 两种蛋白，其在囊膜蛋白中含量高达 60%[12]。据研究报道，VP28 在宿主的最初阶段可以与细胞膜上的 PmRab7 蛋白相互作用，辅助病毒与合，进而促进病毒入胞[13; 14]。VP26 可以与细胞的一种骨架蛋白 actin 相来协助病毒进入细胞后快速接近细胞核以尽快完成自身复制[15]。据相
图 3 斑节对虾酚氧化酶原激活系统模型[46]Fig.3 Model of proPO-activating system in P.monodon淋巴凝结反应巴凝结作用在脊椎动物和无脊椎动物中都发挥着非常重要的作用口快速的郁结，减少血淋巴流失使伤口愈合，而且在免疫防御方面的作用，可以快速固定病原体并利于清除[51]。凝结过程主要是血氨酰胺酶调节，由血浆中的凝结蛋白通过复杂的交联反应形成凝块谷氨酰胺酶是一种 Ca2+依赖性的蛋白酶，能够催化某些蛋白（如氨酸和谷氨酰胺之间形成共价键。血淋巴凝结的级联反应不仅在鲎中都有研究[31]，而且在各对虾中也有所研究。在中国明对虾中测血细胞感染 WSSV 后晚期转谷氨酰胺酶转录水平明显下降，证
【参考文献】：
期刊论文
[1]LRP-1抑制缺氧/复氧诱导的肾细胞损伤[J]. 段斌,职瑾,杜鹏,高妍婷,李振江. 现代医学. 2017(12)
[2]中国对虾养殖业发展轨迹及技术变迁[J]. 周井娟. 中国农学通报. 2016(08)
[3]南美白对虾养殖技术[J]. 沈伟林,张鹏. 农民致富之友. 2015(12)
[4]溶藻弧菌感染后凡纳滨对虾鳃组织免疫相关基因的表达[J]. 罗词兴,黄旭雄,李桑,赵利斌,危立坤,陈春燕,刘林林,曾蓓蓓. 中国水产科学. 2014(01)
[5]斑节对虾Relish基因的克隆及免疫刺激对其mRNA表达水平的影响[J]. 刘文静,杨丽诗,李晓兰,邱丽华,苏天凤,杨其彬,江世贵. 中国水产科学. 2013(01)
[6]中国明对虾caspase基因的克隆与表达分析[J]. 宋光年,金松君,张继泉,相建海. 海洋科学. 2010(12)
[7]中国明对虾Rel/NF-κB家族基因在弧菌刺激下的表达[J]. 阎慧,李富花,王兵,张继泉,马洪明,相建海. 海洋与湖沼. 2008(06)
[8]LPS影响p38蛋白在单核细胞内定位[J]. 张琳,刘怒云,姜勇,李庆林,张璐. 中国病理生理杂志. 2007(06)
[9]甲壳动物血细胞及其在免疫防御中的功能[J]. 姚翠鸾,王志勇,相建海. 动物学研究. 2006(05)
[10]虾类免疫机制的特点及其免疫增强剂的研究进展[J]. 李红权,刘燕. 畜牧兽医科技信息. 2006(08)
硕士论文
[1]斑节对虾JNK信号通路中的JNK、C-JUN和ATF-2基因的克隆与功能研究[D]. 时恭芳.上海海洋大学 2017
[2]中国明对虾Rac1/PI3K/Akt通路相关基因的克隆和功能关系的初步研究[D]. 迟艳红.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2012
本文编号：3587596
【文章来源】：自然资源部第三海洋研究所福建省
【文章页数】：126 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
WSSV结构示意图
图 2 WSSV 中国大陆株基因组结构图[7]Fig.2 The genomic structure of the WSSV-CN strainsSSV 功能基因研究SSV 基因编码的蛋白，主要分为结构蛋白和非结构蛋白。结构蛋白主要蛋白、核衣壳蛋白和被膜蛋白三种，可以维持病毒构型，保护核酸，还病毒对组织及细胞的识别、吸附和侵入。非结构蛋白主要是与催化、调酶和蛋白。WSSV 的囊膜蛋白至少由 35 种构成，其中最重要的是 VP26 两种蛋白，其在囊膜蛋白中含量高达 60%[12]。据研究报道，VP28 在宿主的最初阶段可以与细胞膜上的 PmRab7 蛋白相互作用，辅助病毒与合，进而促进病毒入胞[13; 14]。VP26 可以与细胞的一种骨架蛋白 actin 相来协助病毒进入细胞后快速接近细胞核以尽快完成自身复制[15]。据相
图 3 斑节对虾酚氧化酶原激活系统模型[46]Fig.3 Model of proPO-activating system in P.monodon淋巴凝结反应巴凝结作用在脊椎动物和无脊椎动物中都发挥着非常重要的作用口快速的郁结，减少血淋巴流失使伤口愈合，而且在免疫防御方面的作用，可以快速固定病原体并利于清除[51]。凝结过程主要是血氨酰胺酶调节，由血浆中的凝结蛋白通过复杂的交联反应形成凝块谷氨酰胺酶是一种 Ca2+依赖性的蛋白酶，能够催化某些蛋白（如氨酸和谷氨酰胺之间形成共价键。血淋巴凝结的级联反应不仅在鲎中都有研究[31]，而且在各对虾中也有所研究。在中国明对虾中测血细胞感染 WSSV 后晚期转谷氨酰胺酶转录水平明显下降，证
【参考文献】：
期刊论文
[1]LRP-1抑制缺氧/复氧诱导的肾细胞损伤[J]. 段斌,职瑾,杜鹏,高妍婷,李振江. 现代医学. 2017(12)
[2]中国对虾养殖业发展轨迹及技术变迁[J]. 周井娟. 中国农学通报. 2016(08)
[3]南美白对虾养殖技术[J]. 沈伟林,张鹏. 农民致富之友. 2015(12)
[4]溶藻弧菌感染后凡纳滨对虾鳃组织免疫相关基因的表达[J]. 罗词兴,黄旭雄,李桑,赵利斌,危立坤,陈春燕,刘林林,曾蓓蓓. 中国水产科学. 2014(01)
[5]斑节对虾Relish基因的克隆及免疫刺激对其mRNA表达水平的影响[J]. 刘文静,杨丽诗,李晓兰,邱丽华,苏天凤,杨其彬,江世贵. 中国水产科学. 2013(01)
[6]中国明对虾caspase基因的克隆与表达分析[J]. 宋光年,金松君,张继泉,相建海. 海洋科学. 2010(12)
[7]中国明对虾Rel/NF-κB家族基因在弧菌刺激下的表达[J]. 阎慧,李富花,王兵,张继泉,马洪明,相建海. 海洋与湖沼. 2008(06)
[8]LPS影响p38蛋白在单核细胞内定位[J]. 张琳,刘怒云,姜勇,李庆林,张璐. 中国病理生理杂志. 2007(06)
[9]甲壳动物血细胞及其在免疫防御中的功能[J]. 姚翠鸾,王志勇,相建海. 动物学研究. 2006(05)
[10]虾类免疫机制的特点及其免疫增强剂的研究进展[J]. 李红权,刘燕. 畜牧兽医科技信息. 2006(08)
硕士论文
[1]斑节对虾JNK信号通路中的JNK、C-JUN和ATF-2基因的克隆与功能研究[D]. 时恭芳.上海海洋大学 2017
[2]中国明对虾Rac1/PI3K/Akt通路相关基因的克隆和功能关系的初步研究[D]. 迟艳红.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2012
本文编号：3587596
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