6个不同群体鳜基于SSR的遗传多样性初步研究
发布时间：2022-01-21 09:53
旨在了解不同群体鳜遗传多样性及种质资源现状,采用微卫星标记技术,对采自6个不同群体鳜96尾个体的遗传多样性进行了初步分析。结果表明,经筛选的10对引物在6个鳜群体中的平均等位基因数（Na）为2.2000～2.5000,期望杂合度（He）为0.6489～0.7289,多态信息含量（PIC）为0.5614～0.6409（PIC>0.5）;群体遗传分化系数（Fst）为0.0606（0.05<Fst<0.15）,平均基因流（Nm）为4.0151;检验表明,除高邮和靖江群体外,其他4个群体均不同程度地偏离Hardy-Weinberg平衡,主要表现为杂合子缺失。构建的UPGMA聚类图显示,铜陵、安庆、太湖、高邮和靖江群体聚为一类,当涂群体聚为另一类。本研究表明6个鳜群体的遗传多样性较高,群体间遗传分化水平中等,群体间存在着一定的基因交流。
【文章来源】：中国农学通报. 2020,36(26)
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
图1 位点G13在6个鳜群体的扩增电泳图
多态信息含量(PIC)常用来衡量位点的多态性。Botstein等认为，PIC>0.5时，为高度多态位点；0.25<PIC<0.5时，为中度多态位点；PIC<0.25时，为低度多态位点[14]。在本课题研究的10个微卫星位点中，除位点G09和G12(PIC值分别为0.5982和0.5238）属于高度多态位点(PIC>0.5)外，其余8个位点均属于中度多态位点(0.25<PIC<0.5)，平均多态信息含量(PIC)值为0.4317，说明本研究选取的10个微卫星位点多态性较高，适合用于鳜群体的遗传多样性分析。杂合度(H)能反映各个群体在多个位点上的遗传变异，期望杂合度(He)是衡量群体遗传变异程度的一个重要参数[15]，期望杂合度(He)越高，说明遗传多样性越丰富。本课题研究的6个群体的平均期望杂合度(He)为0.6489-0.7289，赵程等[16]对5种鳜属鱼类进行微卫星遗传多样性分析，得出来自湖南的翘嘴鳜野生群体的期望杂合度(He)为0.6900，田华[17]用22个微卫星位点，对长江鲢、鳙的野生和养殖群体进行分析，得到的期望杂合度(He)分别为鲢0.5810～0.6120和鳙0.5400～0.5500，刘朋朋[18]用13对微卫星引物，对巢湖、滆湖、洪泽湖、鄱阳湖和太湖的5个黄颡鱼种群进行SSR分析，其平均期望杂合度(He)为0.5096～0.6098，由此可见，相比于其他的鳜种群以及长江流域的其他鱼类种群，本课题6个鳜群体的遗传多样性较为丰富的，当环境发生变化时，鳜群体能有较高的适应能力。
【参考文献】：
期刊论文
[1]鳜属5种鱼类微卫星遗传多样性分析[J]. 赵程,梁旭方,田昌绪,杨敏,窦亚琪,郭稳杰,宋易. 华中农业大学学报. 2015(05)
[2]2个鳜鱼选育群体遗传多样性分析[J]. 张进,梁旭方,杨敏,陈敦学,刘灿洪,巫绍明,李永锋. 水产科学. 2014(07)
[3]翘嘴鳜养殖与野生群体及其家系的遗传多样性分析[J]. 杨凯,高银爱,丹成,曾可为,王青云,朱思华,夏儒龙,郑翠华,罗峰,程颖红,王辉,李波. 淡水渔业. 2013(03)
[4]瓦氏雅罗鱼达里湖群体和乌苏里江群体的遗传多样性和遗传结构分析[J]. 池炳杰,常玉梅,闫学春,曹顶臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 中国水产科学. 2010(02)
[5]利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性[J]. 孙莉,杨国梁,王军毅,吴婷婷,张海波,吴添文,陈国宏. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2009(03)
[6]牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析[J]. 刘海金,朱晓琛,孙效文,杨立更,薛玲玲,毛连菊. 中国水产科学. 2008(01)
[7]FIASCO法筛选鳜鱼微卫星标记[J]. 匡刚桥,刘臻,鲁双庆,刘红玉,张建社,唐建洲. 中国水产科学. 2007(04)
[8]应用微卫星多态分析四个鲤鱼群体的遗传多样性[J]. 全迎春,孙效文,梁利群. 动物学研究. 2005(06)
[9]鳜野生群体与养殖群体的RAPD分析[J]. 方展强,陈军,郑文彪,伍育源,肖智. 大连水产学院学报. 2005(01)
[10]鳜鱼遗传多样性的RAPD指纹分析[J]. 杨受保,祖国掌,程久发. 水产养殖. 2003(04)
硕士论文
[1]翘嘴鳜微卫星标记的开发以及三个群体遗传多态性分析[D]. 彭敏燕.暨南大学 2013
[2]长江中下游五个地理种群黄颡鱼遗传多样性的分析以及MSTN多态性的研究[D]. 刘朋朋.南京师范大学 2013
[3]鲢鳙长江野生群体和养殖群体微卫星的遗传多样性分析[D]. 田华.华中农业大学 2008
本文编号：3600044
【文章来源】：中国农学通报. 2020,36(26)
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
图1 位点G13在6个鳜群体的扩增电泳图
多态信息含量(PIC)常用来衡量位点的多态性。Botstein等认为，PIC>0.5时，为高度多态位点；0.25<PIC<0.5时，为中度多态位点；PIC<0.25时，为低度多态位点[14]。在本课题研究的10个微卫星位点中，除位点G09和G12(PIC值分别为0.5982和0.5238）属于高度多态位点(PIC>0.5)外，其余8个位点均属于中度多态位点(0.25<PIC<0.5)，平均多态信息含量(PIC)值为0.4317，说明本研究选取的10个微卫星位点多态性较高，适合用于鳜群体的遗传多样性分析。杂合度(H)能反映各个群体在多个位点上的遗传变异，期望杂合度(He)是衡量群体遗传变异程度的一个重要参数[15]，期望杂合度(He)越高，说明遗传多样性越丰富。本课题研究的6个群体的平均期望杂合度(He)为0.6489-0.7289，赵程等[16]对5种鳜属鱼类进行微卫星遗传多样性分析，得出来自湖南的翘嘴鳜野生群体的期望杂合度(He)为0.6900，田华[17]用22个微卫星位点，对长江鲢、鳙的野生和养殖群体进行分析，得到的期望杂合度(He)分别为鲢0.5810～0.6120和鳙0.5400～0.5500，刘朋朋[18]用13对微卫星引物，对巢湖、滆湖、洪泽湖、鄱阳湖和太湖的5个黄颡鱼种群进行SSR分析，其平均期望杂合度(He)为0.5096～0.6098，由此可见，相比于其他的鳜种群以及长江流域的其他鱼类种群，本课题6个鳜群体的遗传多样性较为丰富的，当环境发生变化时，鳜群体能有较高的适应能力。
【参考文献】：
期刊论文
[1]鳜属5种鱼类微卫星遗传多样性分析[J]. 赵程,梁旭方,田昌绪,杨敏,窦亚琪,郭稳杰,宋易. 华中农业大学学报. 2015(05)
[2]2个鳜鱼选育群体遗传多样性分析[J]. 张进,梁旭方,杨敏,陈敦学,刘灿洪,巫绍明,李永锋. 水产科学. 2014(07)
[3]翘嘴鳜养殖与野生群体及其家系的遗传多样性分析[J]. 杨凯,高银爱,丹成,曾可为,王青云,朱思华,夏儒龙,郑翠华,罗峰,程颖红,王辉,李波. 淡水渔业. 2013(03)
[4]瓦氏雅罗鱼达里湖群体和乌苏里江群体的遗传多样性和遗传结构分析[J]. 池炳杰,常玉梅,闫学春,曹顶臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 中国水产科学. 2010(02)
[5]利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性[J]. 孙莉,杨国梁,王军毅,吴婷婷,张海波,吴添文,陈国宏. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2009(03)
[6]牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析[J]. 刘海金,朱晓琛,孙效文,杨立更,薛玲玲,毛连菊. 中国水产科学. 2008(01)
[7]FIASCO法筛选鳜鱼微卫星标记[J]. 匡刚桥,刘臻,鲁双庆,刘红玉,张建社,唐建洲. 中国水产科学. 2007(04)
[8]应用微卫星多态分析四个鲤鱼群体的遗传多样性[J]. 全迎春,孙效文,梁利群. 动物学研究. 2005(06)
[9]鳜野生群体与养殖群体的RAPD分析[J]. 方展强,陈军,郑文彪,伍育源,肖智. 大连水产学院学报. 2005(01)
[10]鳜鱼遗传多样性的RAPD指纹分析[J]. 杨受保,祖国掌,程久发. 水产养殖. 2003(04)
硕士论文
[1]翘嘴鳜微卫星标记的开发以及三个群体遗传多态性分析[D]. 彭敏燕.暨南大学 2013
[2]长江中下游五个地理种群黄颡鱼遗传多样性的分析以及MSTN多态性的研究[D]. 刘朋朋.南京师范大学 2013
[3]鲢鳙长江野生群体和养殖群体微卫星的遗传多样性分析[D]. 田华.华中农业大学 2008
本文编号：3600044
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