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异育银鲫可量性状相关性以及MSTN基因的多态性与生长性状的关联分析

发布时间:2022-01-25 07:18
  鲫鱼是我国主要的淡水养殖经济鱼类,其肉鲜质嫩,营养全面,含蛋白质丰富,具有很大的市场前景。目前自繁异育银鲫和最新种“中科三号”是主要的养殖品系。本研究对两种异育银鲫进行了生长对比实验,分析并比较了两种异育银鲫的生长性能、营养价值,对各生长性状与体质量的相关性进行了分析,并筛选了MMSTN基因的SNP标记,旨在为异育银鲫选育测量指标提供理论依据,以及为分子标记辅助育种奠定基础。具体研究内容如下:1.对异育银鲫(自繁)与异育银鲫(中科三号)两个品系鲫鱼标记时和收货时体重、体长、体高、体宽等性状以及绝对增重率AGRw、绝对增长率AGRBL、绝对增宽率AGRBW、绝对增高率AGRBH、空壳率、肥满度这6个生长参数进行了比较及分析,结果表明自繁的异育银鲫的生长要快于中科三号。在对两个品系鲫鱼体重、体长、体宽、体厚进行简单的相关分析后,结果显示体长与体重相关系数最大。对两个品系鲫鱼进行营养成分比较后发现,氨基酸总量、必须氨基酸含量和鲜味氨基酸含量均是自繁的异育银鲫优于中科三号。脂肪酸种类及含量比较结果证明,中科三号在脂肪酸含量上优于自繁的异育银鲫。2.本文采用分子克隆技术得到了异育银鲫“中科三号”... 

【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:75 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 综述
    1 前言
    2 MSTN基因概述
    3 形态性状相关性研究
    4 分子遗传标记概述
    5 分子遗传标记技术在鱼类遗传研究中的应用
        5.1 RFLP标记技术(Restriction fragment length polymorphhism)
        5.2 RAPD标记技术(Randomamplified polymorphic DNA)
        5.3 SSR标记技术(Simple sequence repeat,SSR)
        5.4 AFLP标记技术(Amplified fragment length polymorphicm)
        5.5 SSCP标记技术(single strand conformation polymorphism)
        5.6 SCAR标记技术(Sequence Characterized Ampl-ified Region)
        5.7 SRAP标记技术(Sequence-related AmplifiedPolymorphism)
        5.8 TRAP标记技术(Target Region Amplified Poly-morphism)
        5.9 SNPs标记技术(Single Nucleotide Polymorphism)
            5.9.1 SNPs技术概述
            5.9.2 SNPs技术在水产动物遗传育种中的应用
    6 本文研究的目的与意义
第二章 两个品系异育银鲫可量性状及营养成分比较
    1. 引言
    2 材料与方法
        2.1 实验材料
        2.2 标记方法
        2.3 数据测量
        2.4 肌肉营养成分的测定
        2.5 数据处理
            2.5.1 生长参数计算
            2.5.2 数据分析
    3. 结果分析
        3.1 各形态性状的表型参数
        3.2 生长参数比较分析
        3.3 性状间相关性分析
        3.4 肌肉营养价值分析
            3.4.1 蛋白质与灰分含量
            3.4.2 氨基酸
            3.4.3 脂肪酸
    4. 讨论
        4.1 两个品系鲫鱼体重与其他性状的比较及相关性分析特点
        4.2 营养价值比较在品系比较中的参考价值
第三章 两个品系异育银鲫MSTN基因的克隆及序列分析比较
    1. 前言
    2. 材料与方法
        2.1 实验材料
        2.2 实验试剂
        2.3 实验方法
            2.3.1 总RNA的提取
            2.3.2 基因组DNA的提取
            2.3.3 cDNA模板的制备
            2.3.4 MSTN基因cDNA序列扩增
            2.3.5 RACE扩增银鲫MSTN mRNA的5’端和3’端序列
            2.3.6 基因组DNA扩增
            2.3.7 半定量RT-PCR检测
            2.3.8 MSTN序列分析
    3 结果与分析
        3.1 结果
            3.1.1 两种异育银鲫MSTN部分编码序列的扩增
            3.1.2 两种异育银鲫MSTN5'-RACE和3’-RACE扩增
            3.1.3 两种异育银鲫MSTN内含子扩增
        3.2 分析
            3.2.1 MSTN基因序列和氨基酸组成及特征位点分析
            3.2.2 MSTN序列同源性与系统发育分析
            3.2.3 异育银鲫MSTN基因组织表达分析
        3.3 讨论
第四章 两个品系异育银鲫MSTN基因多态位点的查找及生长性状相关位点的筛选
    1. 引言
    2. 材料与方法
        2.1 实验材料
        2.2 实验试剂
        2.3 实验方法
            2.3.1 基因组DNA的提取
            2.3.2 两种鱼MSTN基因外显子2和3多态位点的查找
            2.3.3 采用Snapshot法进行基因分型
            2.2.3 数据处理
    3. 结果
        3.1 两种异育银鲫MSTN外显子2和外显子3扩增及多态位点查找
        3.2 中科三号外显子2和外显子3多态位点与生长性状关联分析
            3.2.1 分型结果
            3.2.2 与生长性状相关性分析
        3.3 自繁异育银鲫外显子2多态性与生长性状关联分析
            3.3.1 分型结果
            3.3.2 与生长性状相关性分析
    4. 讨论
全文总结
参考文献
致谢
科研情况
    攻读学位期间参加的科研项目
    攻读学位期间参加的学术会议
    攻读学位期间发表的文章


【参考文献】:
期刊论文
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[2]微卫星分子标记技术及其在水产动物研究中的应用[J]. 黎玉元,姚一彬,孙念.  湖南饲料. 2013(02)
[3]SCAR分子标记技术及其在水产动物研究中的应用[J]. 罗方兴,毛盼,姚一彬.  吉林农业. 2013(02)
[4]“黄海1号”中国对虾抗白斑病的SRAP分子标记[J]. 张铎,李梦阳,杨凯,赵宇亮,赵宝华.  河北师范大学学报(自然科学版). 2013(01)
[5]高邮鸭生长抑制素基因外显子3多态性与腹脂率的关联分析[J]. 刘倩,陈永华,蔡凤仙,朱文奇,王志跃,张汤杰.  中国家禽. 2012(23)
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[7]盐城市异育银鲫池塘高效养殖模式[J]. 李冰,查晓宗,戈贤平.  科学养鱼. 2012(10)
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[9]SNP及其在鱼类养殖中的应用[J]. 邹刚刚,陈永久,吴常文.  浙江海洋学院学报(自然科学版). 2012(05)
[10]鲮微卫星DNA分子标记的筛选与遗传多样性分析[J]. 刘佳瑶,赵建,郑光明,朱新平.  基因组学与应用生物学. 2012(04)



本文编号:3608119

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