嗜水气单胞菌感染暗纹东方鲀脾脏的蛋白质组学分析

发布时间：2022-02-20 13:51

　　为了解暗纹东方鲀（Takifugu obscurus）受到病原菌感染后参与应答的主要蛋白的功能与调控作用,采用TMT标记、高效液相色谱（HPLC）分级技术以及基于质谱的定量蛋白质组学技术,分析了暗纹东方鲀感染嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila） 12 h后脾脏组织的蛋白表达水平,鉴定差异表达蛋白,并通过亚细胞定位、GO（Gene Oncology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）对差异表达蛋白进行进一步分析.本次实验共鉴定到306个差异表达蛋白,其中120个上调表达蛋白,186个下调表达蛋白;利用平行反应检测实验（PRM）对4个（1个上调,3个下调）与免疫相关的差异蛋白进行验证,其结果与蛋白质测序结果一致;亚细胞定位结果显示:差异表达蛋白主要定位在细胞质、细胞核和胞外; GO分析发现:差异表达蛋白参与的主要生物进程有代谢过程、细胞进程和单一生物进程,主要的分子功能有结合、催化活性和机构分析活性; KEGG通路分析结果显示:差异表达蛋白主要参与了核糖体、视黄醇代谢、卟啉和叶绿素代谢、ECM受体相互作用、吞噬体... 

【文章来源】：华南师范大学学报(自然科学版). 2020,52(05)北大核心

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 主要试剂和仪器
    1.3 暗纹东方鲀感染及取样
    1.4 脾脏细胞凋亡率
    1.5 胞内游离Ca2+含量
    1.6 蛋白质提取及酶解
    1.7 TMT标记和HPLC分级
    1.8 液相色谱-质谱联用分析
    1.9 数据库搜索
    1.1 0 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 脾脏细胞凋亡率和胞内游离钙离子含量
    2.2 差异表达蛋白的统计及分析
        2.2.1 差异表达蛋白统计
        2.2.2 差异表达蛋白的亚细胞结构定位分析
        2.2.3 差异表达蛋白的GO注释
        2.2.4 差异表达蛋白的功能富集分析
    2.3 差异蛋白的PRM验证
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]白细胞黏附分子CD44在肺结核患者体内的表达水平、作用及机制研究[J]. 张宪波,刘月皎,钱世宁,董杰.  中国免疫学杂志. 2019(02)
[2]丝瓜果实发育过程的蛋白质差异表达分析[J]. 陈敏氡,王彬,朱海生,李永平,刘建汀,温庆放.  中国细胞生物学学报. 2018(11)
[3]小菜蛾整合素integrin β1基因的克隆及其功能分析[J]. 郑锦龙,许小霞,余静,张展滔,兰可可,仇培,金丰良.  环境昆虫学报. 2018(04)
[4]河鲀营养研究进展及展望[J]. 廖章斌,徐后国,卫育良,梁萌青.  动物营养学报. 2018(04)
[5]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 张媛媛,宋理平.  河北渔业. 2018(02)
[6]我国养殖河鲀(业)发展现状及研究进展[J]. 黄玉林,王文利,刘源,张丹妮.  中国食品学报. 2018(01)
[7]急性氨氮胁迫对红螯螯虾血细胞凋亡的影响[J]. 潘训彬,张秀霞,冼健安.  河北渔业. 2017(11)
[8]齐口裂腹鱼感染嗜水气单胞菌后血液生化指标与组织病理学研究[J]. 罗辉,杨月静,向梦斌,叶华,郑曙明,王晓清.  淡水渔业. 2017(04)
[9]小胶质细胞内的钙离子信号的研究进展[J]. 孟雪莲,刘佳,陈长兰.  辽宁大学学报(自然科学版). 2017(01)
[10]钙离子通道蛋白的研究进展[J]. 范雪新,杨磊,项斌,王世强.  生物化学与生物物理进展. 2016(12)



本文编号：3635180