杂色鲍高温和缺氧应激下若干热激反应基因的研究
发布时间:2022-02-24 08:15
热激反应相关基因对机体在高温及缺氧应激条件下启动热休克反应具有重要作用。本研究通过简并引物扩增、转录组数据库查找并结合SMART-RACE技术成功克隆得到5条热休克及免疫调控相关基因:热休克转录因子1(heat shock transcriptional factor 1,HSF1)、热休克因子结合蛋白1(heat shock factor binding protein 1,HSBP1)、热休克蛋白90(heat shock protein 90,HSP90)、同种移植炎症因子1(allograft inflammatory factor 1,AIF-1)和紫色酸性磷酸酯酶(Purple acid phosphatase,PAP),并分别命名为HdHSF1、HdHSBP1、HdHSP90、HdAIF-1和HdPAP。采用实时荧光定量PCR(qPCR)技术分析杂色鲍若干热激反应基因在高温和缺氧应激过程中的变化。通过培养杂色鲍血细胞,运用RNAi技术对HdHSF1干扰后,检测其它热休克相关基因的表达情况并作分析。主要的研究结果如下:(1)HdHSF1的cDNA全长为2134 bp,编码5...
【文章来源】:集美大学福建省
【文章页数】:90 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
基因名称英文缩略词表
第1章 引言
1.1 应激及应激反应的发生
1.1.1 应激的类型
1.1.2 热应激反应的发生
1.1.3 缺氧应激的发生
1.2 热休克转录因子1的热启动调控作用
1.3 热休克因子结合蛋白1参与热休克调控
1.4 热休克蛋白的转录调控作用
1.5 热激信号传导途径
1.6 生物耐热性获得
1.7 本研究的目的与意义
1.8 主要研究内容和技术路线
1.8.1 主要研究内容
1.8.2 主要技术路线
第2章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 实验动物
2.1.2 主要试剂和仪器
2.1.3 引物
2.2 实验方法
2.2.1 总RNA的提取(RDP法)和去除DNA的污染
2.2.2 合成RT-PCR cDNA第一链和PCR扩增获取基因cDNA片段
2.2.3 SMART-RACE技术获取基因全长
2.2.4 割胶纯化基因片段
2.2.5 与质粒载体连接
2.2.6 感受态细胞的转化及筛选
2.2.7 质粒插入片段的检测
2.2.8 质粒测序
2.2.9 目的基因的生物信息学分析
2.2.10 RNA干扰实验
2.2.11 实时荧光定量PCR反应体系及条件
第3章 结果
3.1 杂色鲍各组织总RNA的抽提结果
3.2 HdHSF1、HdHSBP1、HdHSP90、HdAIF-1 和HdPAP基因序列分析
3.3 HdHSF1、HdHSBP1、HdHSP90、HdAIF-1 和HdPAP基因各组织表达
3.4 热休克及免疫相关基因在应激情况下的表达
3.4.1 高温和缺氧应激下热休克及免疫相关基因的表达
3.4.2 其它若干热休克相关基因的应激表达情况
3.5 热休克及免疫相关基因在HdHSF1干扰下的表达情况
第4章 讨论
4.1 热休克转录因子 1、热休克因子结合蛋白1和热休克蛋白 90
4.2 同种移植炎症因子 1
4.3 紫色酸性磷酸酯酶
4.4 其它热休克相关蛋白
第5章 结论和展望
5.1 结论
5.2 展望
致谢
参考文献
在学期间发表的学术论文和研究成果
1. 发表的学术论文
2. GenBank注册的功能基因
【参考文献】:
期刊论文
[1]蛋鸡常用抗热应激的添加剂[J]. 张君. 养殖技术顾问. 2012(04)
[2]温度对杂色鲍不同群体生长率与存活率的影响[J]. 游伟伟,林焕阳,骆轩,王德祥,林壮炳,柯才焕. 台湾海峡. 2011(04)
[3]杂色鲍的遗传育种研究进展[J]. 柯才焕,游伟伟. 厦门大学学报(自然科学版). 2011(02)
[4]DAD1和AIF-1细胞因子在鱼类中的研究进展[J]. 王利,吴信忠. 中国水产科学. 2011(01)
[5]热休克因子结合蛋白(HSBP1)的表达、纯化、结晶与初步晶体学研究(英文)[J]. 张红彦,刘学琦,孙玉娜,郝宁,李雪梅,娄智勇. 生物化学与生物物理进展. 2010(04)
[6]热休克转录因子1与机体耐热性的相关研究[J]. 王延久,王长法,鞠志花,何剑斌,黄金明,李建斌,仲跻峰,李秋玲. 生物技术通报. 2010(03)
[7]热休克转录因子1在肝细胞癌中的表达及意义[J]. 李祎,王葵. 临床医药实践. 2009(19)
[8]中国海洋溢油污染现状及其生态影响研究[J]. 王传远,贺世杰,李延太,侯西勇,杨翠云. 海洋科学. 2009(06)
[9]杂色鲍对高温和低盐耐受力的初步研究[J]. 刘贤德,闫玉华,王志勇,蔡明夷,柯才焕. 集美大学学报(自然科学版). 2008(04)
[10]HSF1生理特征及调控HSP表达的研究进展[J]. 徐雪,马中富,黄帆. 热带医学杂志. 2008(09)
博士论文
[1]刺参Apostichopus japonicus (Selenka)对温度胁迫响应分子机理的基础研究[D]. 赵欢.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2011
[2]刺参(Apostichopus Japonicus)对温度变化的生态生理学响应机制[D]. 纪婷婷.中国海洋大学 2009
硕士论文
[1]杂色鲍若干免疫相关基因的克隆和分析[D]. 王宝珍.集美大学 2009
[2]若干大黄鱼性腺发育相关基因的克隆与表达[D]. 周鹏.集美大学 2009
[3]杂色鲍sod、cat和mpeg基因的克隆与分析[D]. 张克烽.集美大学 2007
[4]大黄鱼抗病功能基因的克隆与分析[D]. 谢芳靖.集美大学 2007
[5]环境胁迫对凡纳滨对虾行为和生理活动的影响[D]. 周小壮.暨南大学 2005
本文编号:3642330
【文章来源】:集美大学福建省
【文章页数】:90 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
基因名称英文缩略词表
第1章 引言
1.1 应激及应激反应的发生
1.1.1 应激的类型
1.1.2 热应激反应的发生
1.1.3 缺氧应激的发生
1.2 热休克转录因子1的热启动调控作用
1.3 热休克因子结合蛋白1参与热休克调控
1.4 热休克蛋白的转录调控作用
1.5 热激信号传导途径
1.6 生物耐热性获得
1.7 本研究的目的与意义
1.8 主要研究内容和技术路线
1.8.1 主要研究内容
1.8.2 主要技术路线
第2章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 实验动物
2.1.2 主要试剂和仪器
2.1.3 引物
2.2 实验方法
2.2.1 总RNA的提取(RDP法)和去除DNA的污染
2.2.2 合成RT-PCR cDNA第一链和PCR扩增获取基因cDNA片段
2.2.3 SMART-RACE技术获取基因全长
2.2.4 割胶纯化基因片段
2.2.5 与质粒载体连接
2.2.6 感受态细胞的转化及筛选
2.2.7 质粒插入片段的检测
2.2.8 质粒测序
2.2.9 目的基因的生物信息学分析
2.2.10 RNA干扰实验
2.2.11 实时荧光定量PCR反应体系及条件
第3章 结果
3.1 杂色鲍各组织总RNA的抽提结果
3.2 HdHSF1、HdHSBP1、HdHSP90、HdAIF-1 和HdPAP基因序列分析
3.3 HdHSF1、HdHSBP1、HdHSP90、HdAIF-1 和HdPAP基因各组织表达
3.4 热休克及免疫相关基因在应激情况下的表达
3.4.1 高温和缺氧应激下热休克及免疫相关基因的表达
3.4.2 其它若干热休克相关基因的应激表达情况
3.5 热休克及免疫相关基因在HdHSF1干扰下的表达情况
第4章 讨论
4.1 热休克转录因子 1、热休克因子结合蛋白1和热休克蛋白 90
4.2 同种移植炎症因子 1
4.3 紫色酸性磷酸酯酶
4.4 其它热休克相关蛋白
第5章 结论和展望
5.1 结论
5.2 展望
致谢
参考文献
在学期间发表的学术论文和研究成果
1. 发表的学术论文
2. GenBank注册的功能基因
【参考文献】:
期刊论文
[1]蛋鸡常用抗热应激的添加剂[J]. 张君. 养殖技术顾问. 2012(04)
[2]温度对杂色鲍不同群体生长率与存活率的影响[J]. 游伟伟,林焕阳,骆轩,王德祥,林壮炳,柯才焕. 台湾海峡. 2011(04)
[3]杂色鲍的遗传育种研究进展[J]. 柯才焕,游伟伟. 厦门大学学报(自然科学版). 2011(02)
[4]DAD1和AIF-1细胞因子在鱼类中的研究进展[J]. 王利,吴信忠. 中国水产科学. 2011(01)
[5]热休克因子结合蛋白(HSBP1)的表达、纯化、结晶与初步晶体学研究(英文)[J]. 张红彦,刘学琦,孙玉娜,郝宁,李雪梅,娄智勇. 生物化学与生物物理进展. 2010(04)
[6]热休克转录因子1与机体耐热性的相关研究[J]. 王延久,王长法,鞠志花,何剑斌,黄金明,李建斌,仲跻峰,李秋玲. 生物技术通报. 2010(03)
[7]热休克转录因子1在肝细胞癌中的表达及意义[J]. 李祎,王葵. 临床医药实践. 2009(19)
[8]中国海洋溢油污染现状及其生态影响研究[J]. 王传远,贺世杰,李延太,侯西勇,杨翠云. 海洋科学. 2009(06)
[9]杂色鲍对高温和低盐耐受力的初步研究[J]. 刘贤德,闫玉华,王志勇,蔡明夷,柯才焕. 集美大学学报(自然科学版). 2008(04)
[10]HSF1生理特征及调控HSP表达的研究进展[J]. 徐雪,马中富,黄帆. 热带医学杂志. 2008(09)
博士论文
[1]刺参Apostichopus japonicus (Selenka)对温度胁迫响应分子机理的基础研究[D]. 赵欢.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2011
[2]刺参(Apostichopus Japonicus)对温度变化的生态生理学响应机制[D]. 纪婷婷.中国海洋大学 2009
硕士论文
[1]杂色鲍若干免疫相关基因的克隆和分析[D]. 王宝珍.集美大学 2009
[2]若干大黄鱼性腺发育相关基因的克隆与表达[D]. 周鹏.集美大学 2009
[3]杂色鲍sod、cat和mpeg基因的克隆与分析[D]. 张克烽.集美大学 2007
[4]大黄鱼抗病功能基因的克隆与分析[D]. 谢芳靖.集美大学 2007
[5]环境胁迫对凡纳滨对虾行为和生理活动的影响[D]. 周小壮.暨南大学 2005
本文编号:3642330
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