长江水系大眼鳜的遗传多样性研究

发布时间：2022-07-11 12:00

　　大眼鳜（Siniperca kneri）,隶属鲈形目（Perciformes）、鮨科（Serranidae）、鳜亚科（Sinipercinae）。大眼鳜是东亚地区特有的名贵鱼类,具有很高的经济价值。但是,近年来,由于过度捕捞、人工放流、环境污染以及水坝的修建等因素的影响,野生大眼鳜的遗传多样性面临下降的趋势。本论文采用线粒体细胞色素（Cytochrome,Cytb）基因及控制区序列,对长江水系大眼鳜的4个群体（赤水河群体—CS、南京群体—NJ、岳阳群体—YC、宜昌群体—YY）共计79尾个体进行分析,探讨其遗传多样性、遗传分化、以及种群演化历史,从而为有效、合理开发利用大眼鳜资源提供基础数据支撑。主要内容如下:1.大眼鳜的遗传多样性研究:Cytb分析采用PCR扩增、直接测序法,获得4个大眼鳜群体共计79尾鱼的Cytb基因全序列（长度为1141bp）,共检测到26种单倍型。单倍型多样性（Haplotype diversity,Hd）指数为 0.685（CS）-0.924（YY）,核昔酸多样性（nucleotide diversity,TT）指数为0.00176（CS）-0.00285（YC... 

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1 大眼鳜的生物学特性
        1.1 形态特征
        1.2 生活习性
        1.3 繁殖习性
        1.4 感官、摄食、消化器官
    2 大眼鳜的人工养殖和经济价值
    3 鱼类多样性研究
        3.1 遗传多样性
        3.2 分子系统树的构建
    4 鱼类线粒体DNA分子标记
        4.1 鱼类线粒体基因组的特点
        4.2 线粒体分子标记在鱼类遗传学中的应用
    5 研究现状
    6 研究的目的和意义
第二章 大眼鳜的遗传多样性研究:CYTB分析
    1 材料与方法
        1.1 实验试剂和仪器
        1.2 研究的样本
        1.3 DNA的提取
        1.4 线粒体Cytb基因扩增、纯化和测序
        1.5 实验数据的处理和分析
    2 实验结果
        2.1 总DNA的提取
        2.2 Cytb基因序列特征
        2.3 Cytb遗传多样性分析
            2.3.1 单倍型分布
            2.3.2 遗传多样性指数
        2.4 Cytb的遗传结构分析
            2.4.1 遗传距离
            2.4.2 系统进化树
            2.4.3 遗传分化系数和基因流
        2.5 分子方差分析
        2.6 大眼鳜的种群历史动态
            2.6.1 中性检验
            2.6.2 歧点分布
    3 讨论
        3.1 大眼鳜的遗传多样性分析
        3.2 大眼鳜群体间的遗传分化
        3.3 大眼鳜的种群历史动态
第三章 大眼鳜的遗传多样性研究:D-LOOP分析
    1 材料与方法
        1.1 所需实验材料
        1.2 所需实验样本
        1.3 DNA的提取
        1.4 线粒体Cytb基因扩增、纯化和测序
        1.5 实验数据分析
    2 实验结果
        2.1 总DNA的提取
        2.2 D-loop序列特征
        2.3 D-loop遗传多样性分析
            2.3.1 单倍型分布
            2.3.2 遗传多样性指数
        2.4 D-loop区的遗传结构分析
            2.4.1 遗传距离
            2.4.2 系统进化树
            2.4.3 遗传分化系数和基因流
        2.5 分子方差分析
        2.6 大眼鳜的种群历史动态
            2.6.1 中性检验
            2.6.2 核苷酸不配对分布图
    3 讨论
        3.1 大眼鳜的遗传多样性分析
        3.2 大眼鳜群体间的遗传分化
        3.3 大眼鳜的遗传多样性保护
全文结论
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间参加的学术会议及发表的学术论文



本文编号：3658125