深海嗜热噬菌体GVE2裂解宿主菌的机制及GVE2感染相关代谢物的功能研究
发布时间:2022-08-01 12:23
众所周知,海洋覆盖了地球70%多的地表,蕴育着丰富和独特的生物资源,相比于陆生生物资源,人们对于海洋生物资源的认识和开发还处于起步阶段。自从1977年美国阿尔文号深潜器在太平洋首次发现了深海热液口后,深海热液口的生态系统和生物资源便受到了人们极大的关注。在深海热液口生态系统中,一些化能合成细菌和古菌能够利用地热能和化能来合成有机物,它们是整个生态系统中食物链的基础。近年来的研究发现在这些细菌和古细菌中存在着大量的病毒,这些病毒能够通过裂解细菌和古菌来破坏食物链的基础,从而极大地影响热液口生态系统的群落结构。同时,这些嗜热病毒还能够通过裂解宿主菌释放出可溶性的有机物来参与地球化学物质循环。因此对嗜热病毒尤其是嗜热菌噬菌体裂解宿主菌分子机理的研究,不仅能让我们了解在高温条件下病毒是如何裂解宿主菌的,而且在我们理解嗜热病毒对深海热液口生物群落和地球化学物质循环的作用方面具有非常重要的意义。本试验研究了深海热液口高温噬菌体GVE2裂解其宿主嗜热细菌Geobacillus sp. E263的分子机理。我们的研究发现,作为双链DNA噬菌体,GVE2能通过编码两种蛋白endolysin和holin来...
【文章页数】:161 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
引言
1.1 嗜热微生物和噬菌体研究进展
1.1.1 嗜热微生物研究进展
1.1.2 嗜热噬菌体研究进展
1.2 噬菌体裂解宿主菌机制研究进展
1.2.1 常温噬菌体裂解宿主菌机制概述
1.2.2 常温噬菌体裂解宿主过程的调控
1.3 海洋生物次生代谢产物与代谢组学
1.3.1 海洋生物的次生代谢产物
1.3.2 代谢组学
1.4 代谢物与肿瘤发生和发展的关系
1.4.1 肿瘤中的代谢改变
1.4.2 抗肿瘤药物的研究
1.5 本文研究的目的和意义
材料与方法
2.1. 材料
2.1.1 试验材料
2.1.2 细胞系、菌株和质粒
2.1.3 试验试剂
2.1.4 数据分析软件
2.1.5 引物序列
2.1.6 设备与仪器
2.1.7 主要培养基与常用溶液
2.2 试验方法
结果与分析
3.1 GVE2裂解宿主嗜热细菌Geobacillus sp.E263的分子机理
3.1.1 氯化铯梯度离心法纯化高温噬菌体GVE2
3.1.2 噬菌体GVE2感染导致宿主菌的裂解
3.1.3 裂解相关基因endolysin和holin的表达时相分析
3.1.4 endolysin-GFP在宿主菌中的定位分析
3.1.5 endolysin的互作蛋白
3.2 Geobacillus sp.E263骨架蛋白MreB在GVE2侵染中的作用
3.3 噬菌体GVE2感染相关代谢产物的功能研究
3.3.1 噬菌体感染相关代谢产物在宿主抵抗GVE2侵染中的作用
3.3.1.1 噬菌体感染相关代谢产物的筛选
3.3.1.2 外源性色醇添加条件的确定
3.3.1.3 噬菌体感染相关代谢物在噬菌体感染中的作用
3.3.2 GVE2感染相关代谢物的抗肿瘤作用分析
讨论
小结与展望
小结
展望
参考文献
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]Caspase家族与细胞凋亡的关系[J]. 赵瑞杰,李引乾,王会,王广彬,娜日苏,金大鹏,关伟军,马月辉. 中国畜牧杂志. 2010(17)
[2]海洋微生物资源及其产生生物活性代谢产物的研究[J]. 李越中,陈琦. 生物工程进展. 2000(05)
本文编号:3667443
【文章页数】:161 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
引言
1.1 嗜热微生物和噬菌体研究进展
1.1.1 嗜热微生物研究进展
1.1.2 嗜热噬菌体研究进展
1.2 噬菌体裂解宿主菌机制研究进展
1.2.1 常温噬菌体裂解宿主菌机制概述
1.2.2 常温噬菌体裂解宿主过程的调控
1.3 海洋生物次生代谢产物与代谢组学
1.3.1 海洋生物的次生代谢产物
1.3.2 代谢组学
1.4 代谢物与肿瘤发生和发展的关系
1.4.1 肿瘤中的代谢改变
1.4.2 抗肿瘤药物的研究
1.5 本文研究的目的和意义
材料与方法
2.1. 材料
2.1.1 试验材料
2.1.2 细胞系、菌株和质粒
2.1.3 试验试剂
2.1.4 数据分析软件
2.1.5 引物序列
2.1.6 设备与仪器
2.1.7 主要培养基与常用溶液
2.2 试验方法
结果与分析
3.1 GVE2裂解宿主嗜热细菌Geobacillus sp.E263的分子机理
3.1.1 氯化铯梯度离心法纯化高温噬菌体GVE2
3.1.2 噬菌体GVE2感染导致宿主菌的裂解
3.1.3 裂解相关基因endolysin和holin的表达时相分析
3.1.4 endolysin-GFP在宿主菌中的定位分析
3.1.5 endolysin的互作蛋白
3.2 Geobacillus sp.E263骨架蛋白MreB在GVE2侵染中的作用
3.3 噬菌体GVE2感染相关代谢产物的功能研究
3.3.1 噬菌体感染相关代谢产物在宿主抵抗GVE2侵染中的作用
3.3.1.1 噬菌体感染相关代谢产物的筛选
3.3.1.2 外源性色醇添加条件的确定
3.3.1.3 噬菌体感染相关代谢物在噬菌体感染中的作用
3.3.2 GVE2感染相关代谢物的抗肿瘤作用分析
讨论
小结与展望
小结
展望
参考文献
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]Caspase家族与细胞凋亡的关系[J]. 赵瑞杰,李引乾,王会,王广彬,娜日苏,金大鹏,关伟军,马月辉. 中国畜牧杂志. 2010(17)
[2]海洋微生物资源及其产生生物活性代谢产物的研究[J]. 李越中,陈琦. 生物工程进展. 2000(05)
本文编号:3667443
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