长毛明对虾微卫星的开发及雌雄群体遗传多样性的研究
发布时间：2022-08-12 21:44
长毛明对虾是我国上个世纪东南沿海重要的养殖、捕捞虾类。雌、雄个体在外观、大小、生长速率等方面差异明显,但雌、雄群体间遗传多样性差异的比较尚未有研究涉及。本研究利用FIASCO方法进行微卫星的开发,而后利用微卫星与AFLP技术,比较分析长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性。结果如下:运用FIASCO法对长毛明对虾微卫星文库进行富集,获得509个符合要求的微卫星序列,设计了209对引物,通过30个采自宁德的长毛明对虾野生个体进行分析,筛选到11个单态性位点,44个多态性位点,等位基因范围为3-7,平均为4.39;多态信息含量范围为0.121-0.794,平均值为0.5023;观察杂合度范围为0.0000-1.0000,平均值为0.3865;期望杂合度范围为0.1111-0.8129,平均值为0.4926。利用20对多态性引物对长毛明对虾雌、雄野生群体进行分析与比较。雌、雄群体的平均每位点等位基因数分别为4.25、4.55;平均观察杂合度分别为0.3335、0.3611;平均期望杂合度分别为0.5291、0.5407;平均多态信息含量分别为0.5532、0.5575。表明雌、雄群体的遗传多样性水...
【文章页数】：92 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 引言
1.1 长毛明对虾的生物学特性及其研究概况
1.1.1 长毛明对虾的生物学特性
1.1.2 长毛明对虾的研究概况
1.2 微卫星分子标记的概述
1.2.1 微卫星标记的简介
1.2.2 微卫星标记技术的基本步骤
1.2.3 微卫星标记的优缺点
1.2.4 微卫星标记技术在虾类群体遗传学中的应用
1.3 AFLP技术的概述
1.3.1 AFLP的概述
1.3.2 AFLP技术的基本步骤
1.3.3 AFLP技术的优缺点
1.3.4 AFLP技术在虾类群体遗传学中应用
1.4 本研究的目的、意义与内容
1.4.1 研究的目的与意义
1.4.2 研究的技术路线
1.4.3 试验样品的采集
第2章 长毛明对虾微卫星标记的开发
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验仪器与试剂
2.1.3 实验方法
2.2 实验结果
2.2.1 基因组DNA提取结果
2.2.2 基因组DNA酶切结果
2.2.3 富集产物PCR结果
2.2.4 阳性单克隆检测结果
2.2.5 测序结果
2.2.6 引物设计结果
2.2.7 多态及单态引物检测结果
2.3 讨论
第3章 基于微卫星标记的长毛明对虾雌雄群体遗传学研究
3.1 材料与方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 实验仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.2 实验结果
3.2.1 基因组DNA提取结果
3.2.2 PAGE检测结果
3.2.3 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性
3.2.4 长毛明对虾雌、雄群体各等位基因的分布
3.2.5 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化
3.3 讨论
3.3.1 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性分析
3.3.2 长毛明对虾雌、雄群体等位基因分析
3.3.3 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化分析
第4章 基于AFLP标记的长毛明对虾雌雄群体遗传学研究
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验仪器与试剂
4.1.3 实验方法
4.2 实验结果
4.2.1 基因组DNA提取结果
4.2.2 基因组DNA酶切结果
4.2.3 预扩增结果
4.2.4 选择性扩增引物筛选结果
4.2.5 长毛明对虾雌、雄群体AFLP的扩增结果
4.2.6 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性
4.2.7 长毛明对虾雌、雄群体各位点的出现频率
4.2.8 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化
4.3 讨论
4.3.1 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性分析
4.3.2 长毛明对虾雌、雄群体各位点出现频率的分析
4.3.3 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化的分析
第5章 结论与展望
致谢
参考文献
在学期间科研成果情况
【参考文献】：
期刊论文
[1]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析[J]. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 南方水产科学. 2015(02)
[2]中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）“黄海3号”新品种的培育[J]. 李健,何玉英,王清印,刘萍,李吉涛,王学忠. 渔业科学进展. 2015(01)
[3]长毛对虾海水养殖环境以及虾肠道微生物群落结构研究[J]. 王春忠,林国荣,严涛,郑志鹏,欧清峰,陈斌,孙富林. 水产学报. 2014(05)
[4]日本对虾养殖群体两个世代遗传结构的微卫星分析[J]. 胡龙洋,栾生,毛勇,钟声平,孔杰. 渔业科学进展. 2014(02)
[5]施氏鲟性别相关的微卫星标记筛选[J]. 刘洋,李超,刘翠,鲁翠云,赵元凤,孙效文. 水产学杂志. 2014(02)
[6]罗氏沼虾抗病选育群体的抗病性能及其遗传多样性分析[J]. 朱其建,戴习林,邹卫丽,蒋飞,苏建,过正乾,王海洋,丁福江. 水产学报. 2013(10)
[7]“光合1号”中华绒螯蟹微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 田盛君,李晓东,姜玉声,刘胥,杨红威,原振政,郑岩. 大连海洋大学学报. 2013(03)
[8]洮湖日本沼虾遗传多样性的RAPD和SSR分析[J]. 张敏莹,徐东坡,段金荣,刘凯,周彦锋,施炜纲. 江西农业大学学报. 2013(02)
[9]对虾传染性皮下与造血组织坏死病毒（IHHNV）的研究进展[J]. 白丽蓉,赵志英. 中国农学通报. 2012(14)
[10]钱塘江日本沼虾野生群体遗传变异的SSR分析[J]. 马克异,冯建彬,谢楠,冯晓宇,李家乐. 动物学研究. 2011(04)
博士论文
[1]日本沼虾微卫星标记开发、遗传结构分析及性别相关遗传标记筛选研究[D]. 赵燕.山东农业大学 2014
[2]克氏原螯虾在我国的入侵遗传学研究[D]. 李艳和.华中农业大学 2013
[3]中国沿海三疣梭子蟹群体形态、生化与分子遗传多样性研究[D]. 董志国.上海海洋大学 2012
[4]家蚕细胞周期蛋白家族基因的表达特点及功能分析[D]. 刘丽华.苏州大学 2011
[5]黄颡鱼微卫星标记的开发及其遗传连锁图谱的构建[D]. 张秀杰.华中农业大学 2010
[6]青虾分子标记的开发应用及遗传连锁图谱的构建[D]. 乔慧.南京农业大学 2010
[7]牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D]. 于海洋.中国海洋大学 2010
[8]中国主要出口虾类的分子鉴定标记研究[D]. 吴志刚.浙江工商大学 2010
[9]中国青蟹属种类组成和拟穴青蟹群体遗传多样性的研究[D]. 林琪.厦门大学 2008
[10]中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究[D]. 杨频.华东师范大学 2007
硕士论文
[1]金钱鱼性别特异分子标记的筛选及雌雄群体遗传多样性分析[D]. 向玲.广东海洋大学 2015
[2]长江、黄河、辽河水系中华绒螯蟹野生群体遗传多样性的微卫星分析[D]. 刘皓.上海海洋大学 2015
[3]江苏克氏原螯虾典型群体遗传多样性微卫星分析[D]. 邢智珺.上海海洋大学 2014
[4]凡纳滨对虾选育群体遗传多样性分析[D]. 包秀凤.广东海洋大学 2014
[5]红鳍东方鲀性别相关分子标记的筛选及数量形态特征比较[D]. 岳亮.上海海洋大学 2014
[6]凡纳滨对虾引进群体分子系谱构建及中国对虾分子标志家系放流效果评估[D]. 张凯.中国海洋大学 2013
[7]青虾高多态性EST-SSR标记的筛选及遗传多样性的研究[D]. 周巧.南京农业大学 2013
[8]中国东南沿海长毛明对虾种群遗传结构的研究[D]. 曹媛钰.集美大学 2013
[9]鄱阳湖流域克氏原螯虾的资源状况及长江中下游克氏原螯虾遗传多样性研究[D]. 黄羽.南昌大学 2012
[10]淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析[D]. 姜虎成.上海海洋大学 2012
本文编号：3676648
【文章页数】：92 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 引言
1.1 长毛明对虾的生物学特性及其研究概况
1.1.1 长毛明对虾的生物学特性
1.1.2 长毛明对虾的研究概况
1.2 微卫星分子标记的概述
1.2.1 微卫星标记的简介
1.2.2 微卫星标记技术的基本步骤
1.2.3 微卫星标记的优缺点
1.2.4 微卫星标记技术在虾类群体遗传学中的应用
1.3 AFLP技术的概述
1.3.1 AFLP的概述
1.3.2 AFLP技术的基本步骤
1.3.3 AFLP技术的优缺点
1.3.4 AFLP技术在虾类群体遗传学中应用
1.4 本研究的目的、意义与内容
1.4.1 研究的目的与意义
1.4.2 研究的技术路线
1.4.3 试验样品的采集
第2章 长毛明对虾微卫星标记的开发
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验仪器与试剂
2.1.3 实验方法
2.2 实验结果
2.2.1 基因组DNA提取结果
2.2.2 基因组DNA酶切结果
2.2.3 富集产物PCR结果
2.2.4 阳性单克隆检测结果
2.2.5 测序结果
2.2.6 引物设计结果
2.2.7 多态及单态引物检测结果
2.3 讨论
第3章 基于微卫星标记的长毛明对虾雌雄群体遗传学研究
3.1 材料与方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 实验仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.2 实验结果
3.2.1 基因组DNA提取结果
3.2.2 PAGE检测结果
3.2.3 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性
3.2.4 长毛明对虾雌、雄群体各等位基因的分布
3.2.5 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化
3.3 讨论
3.3.1 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性分析
3.3.2 长毛明对虾雌、雄群体等位基因分析
3.3.3 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化分析
第4章 基于AFLP标记的长毛明对虾雌雄群体遗传学研究
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验仪器与试剂
4.1.3 实验方法
4.2 实验结果
4.2.1 基因组DNA提取结果
4.2.2 基因组DNA酶切结果
4.2.3 预扩增结果
4.2.4 选择性扩增引物筛选结果
4.2.5 长毛明对虾雌、雄群体AFLP的扩增结果
4.2.6 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性
4.2.7 长毛明对虾雌、雄群体各位点的出现频率
4.2.8 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化
4.3 讨论
4.3.1 长毛明对虾雌、雄群体的遗传多样性分析
4.3.2 长毛明对虾雌、雄群体各位点出现频率的分析
4.3.3 长毛明对虾雌、雄群体的遗传分化的分析
第5章 结论与展望
致谢
参考文献
在学期间科研成果情况
【参考文献】：
期刊论文
[1]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析[J]. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 南方水产科学. 2015(02)
[2]中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）“黄海3号”新品种的培育[J]. 李健,何玉英,王清印,刘萍,李吉涛,王学忠. 渔业科学进展. 2015(01)
[3]长毛对虾海水养殖环境以及虾肠道微生物群落结构研究[J]. 王春忠,林国荣,严涛,郑志鹏,欧清峰,陈斌,孙富林. 水产学报. 2014(05)
[4]日本对虾养殖群体两个世代遗传结构的微卫星分析[J]. 胡龙洋,栾生,毛勇,钟声平,孔杰. 渔业科学进展. 2014(02)
[5]施氏鲟性别相关的微卫星标记筛选[J]. 刘洋,李超,刘翠,鲁翠云,赵元凤,孙效文. 水产学杂志. 2014(02)
[6]罗氏沼虾抗病选育群体的抗病性能及其遗传多样性分析[J]. 朱其建,戴习林,邹卫丽,蒋飞,苏建,过正乾,王海洋,丁福江. 水产学报. 2013(10)
[7]“光合1号”中华绒螯蟹微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 田盛君,李晓东,姜玉声,刘胥,杨红威,原振政,郑岩. 大连海洋大学学报. 2013(03)
[8]洮湖日本沼虾遗传多样性的RAPD和SSR分析[J]. 张敏莹,徐东坡,段金荣,刘凯,周彦锋,施炜纲. 江西农业大学学报. 2013(02)
[9]对虾传染性皮下与造血组织坏死病毒（IHHNV）的研究进展[J]. 白丽蓉,赵志英. 中国农学通报. 2012(14)
[10]钱塘江日本沼虾野生群体遗传变异的SSR分析[J]. 马克异,冯建彬,谢楠,冯晓宇,李家乐. 动物学研究. 2011(04)
博士论文
[1]日本沼虾微卫星标记开发、遗传结构分析及性别相关遗传标记筛选研究[D]. 赵燕.山东农业大学 2014
[2]克氏原螯虾在我国的入侵遗传学研究[D]. 李艳和.华中农业大学 2013
[3]中国沿海三疣梭子蟹群体形态、生化与分子遗传多样性研究[D]. 董志国.上海海洋大学 2012
[4]家蚕细胞周期蛋白家族基因的表达特点及功能分析[D]. 刘丽华.苏州大学 2011
[5]黄颡鱼微卫星标记的开发及其遗传连锁图谱的构建[D]. 张秀杰.华中农业大学 2010
[6]青虾分子标记的开发应用及遗传连锁图谱的构建[D]. 乔慧.南京农业大学 2010
[7]牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D]. 于海洋.中国海洋大学 2010
[8]中国主要出口虾类的分子鉴定标记研究[D]. 吴志刚.浙江工商大学 2010
[9]中国青蟹属种类组成和拟穴青蟹群体遗传多样性的研究[D]. 林琪.厦门大学 2008
[10]中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究[D]. 杨频.华东师范大学 2007
硕士论文
[1]金钱鱼性别特异分子标记的筛选及雌雄群体遗传多样性分析[D]. 向玲.广东海洋大学 2015
[2]长江、黄河、辽河水系中华绒螯蟹野生群体遗传多样性的微卫星分析[D]. 刘皓.上海海洋大学 2015
[3]江苏克氏原螯虾典型群体遗传多样性微卫星分析[D]. 邢智珺.上海海洋大学 2014
[4]凡纳滨对虾选育群体遗传多样性分析[D]. 包秀凤.广东海洋大学 2014
[5]红鳍东方鲀性别相关分子标记的筛选及数量形态特征比较[D]. 岳亮.上海海洋大学 2014
[6]凡纳滨对虾引进群体分子系谱构建及中国对虾分子标志家系放流效果评估[D]. 张凯.中国海洋大学 2013
[7]青虾高多态性EST-SSR标记的筛选及遗传多样性的研究[D]. 周巧.南京农业大学 2013
[8]中国东南沿海长毛明对虾种群遗传结构的研究[D]. 曹媛钰.集美大学 2013
[9]鄱阳湖流域克氏原螯虾的资源状况及长江中下游克氏原螯虾遗传多样性研究[D]. 黄羽.南昌大学 2012
[10]淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析[D]. 姜虎成.上海海洋大学 2012
本文编号：3676648
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